HHsearch 1.5 NAME c8gzuS_ FAM FILE c8gzuS_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8gzuS_.a3m DATE Sat Jul 11 09:11:25 2026 LENG 169 match states, 169 columns in multiple alignment FILT 2 out of 4 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4022 -1.7627 SEQ >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHCC >ss_conf 9888999998677666665433465401300222344345689999987644569988774178477667999999986066677778999999998999 997412533122358999999999999895427354877999964087767067618889999875439 >Consensus AIRNxxFkxxNxixNxxAKxxLxYxxxxxxqsxxxxxTxxxxxxxxxxxxxxxNmxNvxRaxixdxxrxEFxilxkxxxxGxxxxxVDPxxvlxQLDRIq VLkxLKxiExNxxAxxxexxxxxKLxArVxLEExxAxxxxxxFIxxxPxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx >c8gzuS_ AIRNFVFKISNQIQNLAAKRSLAYLNQIDSQSVPSRATINMKDQVTQMQREIDNMANVIRAQIPDEDRAEFEILKKYYVTGQHDSLVDPQDVLLQLDRIQ VLKNLKMIELNEEAYDPELVRLEKLKARVLLEEEGALLEYAHFISKRPYNKPYEKWGVSEEHVKQQILG >UniRef50_A0BX54(2-149:160) Chromosome undetermined scaffold_133, whole genome shotgun sequence n=2 Tax=Paramecium tetraurelia RepID=A0BX54_PARTE E=7e-09 s/c=0.42 id=30% cov=86% AIRNRLFQAFNTVHrifNVEAK-FLPYTCTTRNEALVQNHT--KHQSYLHYANKDQNLQNITRSTLDEFQKLEFNVISQFQRKGLNNPHVDPHQIIYQLD RIEVLRKLKVLEQNAGAFPKDEAECLKLIAKVHLEEPNAQENLDKFIEANP--------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1605 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1605 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 3 0 * * * * * * 1605 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1605 0 0 F 5 * * * * 971 * * * * * * * * * 1030 * * * * * 5 0 * * * * * * 1605 0 0 V 6 * * * * * * * * * 1030 * * * * * * * 971 * * 6 0 * * * * * * 1605 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1605 0 0 K 8 * * * * * * * * 971 * * * * 1030 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1605 0 0 I 9 1030 * * * * * * 971 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1605 0 0 S 10 * * * * 1030 * * * * * * * * * * 971 * * * * 10 0 * * * * * * 1605 0 0 N 11 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 12 * * * * * * * * * * * * * 971 * * 1030 * * * 12 0 * * * * * * 1605 0 0 I 13 * * * * * * * 971 * * * * * * * * * 1030 * * 13 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 14 * * * * * * 1030 * * * * * * 971 * * * * * * 14 971 1030 * 1585 585 * * 1605 1000 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1605 0 0 L 16 * * * * * * * * * 971 * * * * * * * 1030 * * 16 0 * * * * * * 1605 0 0 A 17 971 * * 1030 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1605 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1605 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 971 * 1030 * * * * 1605 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 20 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 S 21 * * * * 1030 * * * * * * * * * * 971 * * * * 21 0 * * * * * * 1605 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1605 0 0 A 23 971 * * * * * * * * * * * 1030 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1605 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1605 0 0 L 25 * * * * * * * * * 971 * * * * * * 1030 * * * 25 0 * * * * * * 1605 0 0 N 26 * 1030 * * * * * * * * * 971 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 971 * * 1030 * * * 27 0 * * * * * * 1605 0 0 I 28 * * * * * * * 971 * * * * * * * * 1030 * * * 28 0 * * * * * * 1605 0 0 D 29 * * 971 * * * * * * * * * * * 1030 * * * * * 29 0 * * * * * * 1605 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * 1030 * * * 971 * * * * 30 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 31 * * * 1030 * * * * * * * * * 971 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1605 0 0 S 32 1030 * * * * * * * * * * * * * * 971 * * * * 32 0 * * * * * * 1605 0 0 V 33 * * * * * * * * * 1030 * * * * * * * 971 * * 33 0 * * * * * * 1605 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 971 * * * * 1030 * * 34 0 * * * * * * 1605 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * 1030 * 971 * * * * 35 0 * * * * * * 1605 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * 1030 * * 971 * * * * * 36 0 * * * * * * 1605 0 0 A 37 971 * * * * * 1030 * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1605 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 971 * 1030 * * * * 1605 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * 0 1000 0 1000 N 40 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 40 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 M 41 * * * * * * * * 1030 * 971 * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1605 0 0 K 42 * * * * * * 1030 * 971 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1605 0 0 D 43 * * 971 * * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 971 * 1030 * * * * 44 0 * * * * * * 1605 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * 971 * 1030 45 0 * * * * * * 1605 0 0 T 46 * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 971 * * * 46 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 47 * * * * * * 1030 * * * * * * 971 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1605 0 0 M 48 * * * * * * * * * * 971 * * * * * * * * 1030 48 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 49 1030 * * * * * * * * * * * * 971 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1605 0 0 R 50 * * * * * * * * * * * 1030 * * 971 * * * * * 50 0 * * * * * * 1605 0 0 E 51 * * * 971 * * * * 1030 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1605 0 0 I 52 * * 1030 * * * * 971 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1605 0 0 D 53 * * 971 * * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1605 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1605 0 0 M 55 * * * * * * * * * 1030 971 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1605 0 0 A 56 971 * * * * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1605 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1605 0 0 V 58 * * * * * * * 1030 * * * * * * * * * 971 * * 58 0 * * * * * * 1605 0 0 I 59 * * * * * * * 971 * * * * * * * * 1030 * * * 59 0 * * * * * * 1605 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 60 0 * * * * * * 1605 0 0 A 61 971 * * * * * * * * * * * * * * 1030 * * * * 61 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 62 * * * * * * * * * * * * * 971 * * 1030 * * * 62 0 * * * * * * 1605 0 0 I 63 * * * * * * * 971 * 1030 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1605 0 0 P 64 * * 1030 * * * * * * * * * 971 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1605 0 0 D 65 * * 971 1030 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1605 0 0 E 66 * * * 971 1030 * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1605 0 0 D 67 * * 971 * * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1605 0 0 R 68 * * * * * * * * 1030 * * * * * 971 * * * * * 68 0 * * * * * * 1605 0 0 A 69 971 * * * * * * * * 1030 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1605 0 0 E 70 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1605 0 0 F 71 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1605 0 0 E 72 * * * 971 * * * * * * * 1030 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1605 0 0 I 73 * * * * * * * 971 * * * * * * * * * 1030 * * 73 0 * * * * * * 1605 0 0 L 74 * * * * * * * 1030 * 971 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1605 0 0 K 75 * * * * * * * * 971 * * * * * * 1030 * * * * 75 0 * * * * * * 1605 0 0 K 76 * * * * * * * * 971 * * * * 1030 * * * * * * 76 0 * * * * * * 1605 0 0 Y 77 * * * * 1030 * * * * * * * * * * * * * * 971 77 0 * * * * * * 1605 0 0 Y 78 * * * * * * * * * * * * * 1030 * * * * * 971 78 0 * * * * * * 1605 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * 1030 * * 971 * * 79 0 * * * * * * 1605 0 0 T 80 * * * * * * * * 1030 * * * * * * * 971 * * * 80 0 * * * * * * 1605 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 82 * * * * * * * * * 1030 * * * 971 * * * * * * 82 0 * * * * * * 1605 0 0 H 83 * * * * * * 971 * * * * 1030 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1605 0 0 D 84 * * 971 * * * * * * * * 1030 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1605 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * 1030 * * 971 * * * * 85 0 * * * * * * 1605 0 0 L 86 * * * * * * 1030 * * 971 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1605 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1605 0 0 D 88 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1605 0 0 P 89 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 90 * * * * * * 1030 * * * * * * 971 * * * * * * 90 0 * * * * * * 1605 0 0 D 91 * * 971 * * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 91 0 * * * * * * 1605 0 0 V 92 * * * * * * * 1030 * * * * * * * * * 971 * * 92 0 * * * * * * 1605 0 0 L 93 * * * * * * * 1030 * 971 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1605 0 0 L 94 * * * * * * * * * 971 * * * * * * * * * 1030 94 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 95 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1605 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1605 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1605 0 0 R 98 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 98 0 * * * * * * 1605 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1605 0 0 Q 100 * * * 1030 * * * * * * * * * 971 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1605 0 0 V 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 101 0 * * * * * * 1605 0 0 L 102 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1605 0 0 K 103 * * * * * * * * 971 * * * * * 1030 * * * * * 103 0 * * * * * * 1605 0 0 N 104 * * * * * * * * 1030 * * 971 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1605 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1605 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1605 0 0 M 107 * * * * * * * * * * 971 * * * * * * 1030 * * 107 0 * * * * * * 1605 0 0 I 108 * * * * * * * 971 * 1030 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1605 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1605 0 0 L 110 * * * * * * * * * 971 * * * 1030 * * * * * * 110 0 * * * * * * 1605 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1605 0 0 E 112 1030 * * 971 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1605 0 0 E 113 * * * 971 * 1030 * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1605 0 0 A 114 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1605 0 0 Y 115 * * * * 1030 * * * * * * * * * * * * * * 971 115 0 * * * * * * 1605 0 0 D 116 * * 971 * * * * * * * * * 1030 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1605 0 0 P 117 * * * * * * * * 1030 * * * 971 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1605 0 0 E 118 * * 1030 971 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1605 0 0 L 119 * * * 1030 * * * * * 971 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1605 0 0 V 120 1030 * * * * * * * * * * * * * * * * 971 * * 120 0 * * * * * * 1605 0 0 R 121 * * * 1030 * * * * * * * * * * 971 * * * * * 121 0 * * * * * * 1605 0 0 L 122 * 1030 * * * * * * * 971 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1605 0 0 E 123 * * * 971 * * * * * 1030 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1605 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1605 0 0 L 125 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1605 0 0 K 126 * * * * * * * 1030 971 * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1605 0 0 A 127 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1605 0 0 R 128 * * * * * * * * 1030 * * * * * 971 * * * * * 128 0 * * * * * * 1605 0 0 V 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 129 0 * * * * * * 1605 0 0 L 130 * * * * * * 1030 * * 971 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1605 0 0 L 131 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1605 0 0 E 132 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1605 0 0 E 133 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1605 0 0 E 134 * * * 971 * * * * * * * * 1030 * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1605 0 0 G 135 * * * * * 971 * * * * * 1030 * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1605 0 0 A 136 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1605 0 0 L 137 * * * * * * * * * 971 * * * 1030 * * * * * * 137 0 * * * * * * 1605 0 0 L 138 * * * 1030 * * * * * 971 * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1605 0 0 E 139 * * * 971 * * * * * * * 1030 * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1605 0 0 Y 140 * * * * * * * * * 1030 * * * * * * * * * 971 140 0 * * * * * * 1605 0 0 A 141 971 * 1030 * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1605 0 0 H 142 * * * * * * 971 * 1030 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1605 0 0 F 143 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1605 0 0 I 144 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1605 0 0 S 145 * * * 1030 * * * * * * * * * * * 971 * * * * 145 0 * * * * * * 1605 0 0 K 146 1030 * * * * * * * 971 * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1605 0 0 R 147 * * * * * * * * * * * 1030 * * 971 * * * * * 147 0 * * * * * * 1605 0 0 P 148 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1605 0 0 Y 149 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 149 0 * * * * * * 1000 0 0 N 150 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 K 151 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 P 152 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 153 0 * * * * * * 1000 0 0 E 154 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 K 155 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 W 156 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 G 157 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 V 158 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 S 159 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 E 160 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 E 161 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 H 162 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 V 163 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 K 164 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 165 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 166 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 I 167 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 L 168 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 G 169 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //