HHsearch 1.5 NAME c7zjyA_ FAM FILE c7zjyA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7zjyA_.a3m DATE Sat Apr 29 08:23:04 2023 LENG 60 match states, 60 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4225 0.7040 SEQ >ss_dssp CCCCCSEEEEEEEEETTEEEEEEEEECTTCEEEETTEEEEBCGGGCBSCCEETTEEEEEC >sa_dssp EEEEDEBEABACCDDEEEDDDDDCEBDCDDEBEADEDDBDABEECDAEDBDCECADBEDD >ss_pred CCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECC >ss_conf 973222201005620682798613667563699974044126677877530254301129 >Consensus gphmadctlgckylennrwvsvsksanigdtlyimghstkigrgckpettewsdaeiysw >c7zjyA_ GPHMADCTLGCKYLENNRWVSVSKSANIGDTLYIMGHSTKIGRGCKPETTEWSDAEIYSW # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 H 3 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 M 4 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 C 7 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 C 11 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 K 12 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1000 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 E 15 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 N 17 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 R 18 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 W 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 T 31 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 33 0 * * * * * * 1000 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 M 35 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 H 37 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 T 39 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 C 45 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 W 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 58 0 * * * * * * 1000 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 W 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 60 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //