HHsearch 1.5 NAME c7vehA_ FAM FILE c7vehA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7vehA_.a3m DATE Sat Jul 9 08:39:15 2022 LENG 118 match states, 118 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4102 -0.6751 SEQ >ss_dssp CCSSCEEEEEECSSCEEEEETTSCEEEECSSCCTTCCEEETTEEECCHHHHHHHHHHHHHHHSTTCHHHHHHHHHHTSCCSCEEEETTEEEETTCCEEEE CTTHHHHTSCCEECCTTC >sa_dssp EEEEECEDCECDEEBACADBEDEDDACACBBCBEECEBCCDEEEBEDDECAECABEDABEEBAEEDDCBABAABCCCDDAEDCEDEEDCCCBDDDCCACD CEDBEECECCBBDDBEEE >ss_pred CCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHH HCCCCEEEEEEEEEECCC >ss_conf 9740788888303687633676646899847899732244668778247899999999986077651256565147421123100277075044013433 112332536899730359 >Consensus agsmkllnikinefavtanteagdelylqlphtpdsqhsinheplddddfvkevqeicdeyfgkgdrtlarlsyaggqaydsyteedgvyttntgdqfve hsyadyynvevyckadlv >c7vehA_ AGSMKLLNIKINEFAVTANTEAGDELYLQLPHTPDSQHSINHEPLDDDDFVKEVQEICDEYFGKGDRTLARLSYAGGQAYDSYTEEDGVYTTNTGDQFVE HSYADYYNVEVYCKADLV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 M 4 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 F 14 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 N 19 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 A 22 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 27 0 * * * * * * 1000 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 29 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 H 32 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 D 35 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 37 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 H 38 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 I 40 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 N 41 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 P 44 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 D 46 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 D 49 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 F 50 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 K 52 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 E 53 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 C 58 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 1000 0 0 F 62 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 G 65 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 R 67 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 G 76 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 78 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 80 0 * * * * * * 1000 0 0 D 81 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1000 0 0 T 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 E 86 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 D 87 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 G 88 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 V 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 90 0 * * * * * * 1000 0 0 T 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 N 93 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 D 96 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 97 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 H 101 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1000 0 0 A 104 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 D 105 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 107 0 * * * * * * 1000 0 0 N 108 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 E 110 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 V 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 112 0 * * * * * * 1000 0 0 C 113 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 K 114 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 A 115 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 D 116 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //