HHsearch 1.5 NAME c7qiiA_ FAM FILE c7qiiA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7qiiA_.a3m DATE Tue Jun 21 22:55:30 2022 LENG 106 match states, 106 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.4219 -0.7799 SEQ >ss_dssp CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHCTTCHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHCCHHHHHHHSTTCHHHHHHHHHHHHHTTCCCCHHHHHHH HHCCCC >sa_dssp EEECEEDCEECCDCADDCBEEEDBEDABECACDABEDCDECDDABDBBADAABECEDBEDACCADCACEDCEEDCDBCCCBBDACDDCEEEEBEEBDDDD DECEEE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH HHHHCC >ss_conf 9521356899999999997605756899999999841821288899999999975881379999998336986656689987899961205579999999 985349 >Consensus xxxxtxxxexlLlxgwLqlQygqxxraxilLdAlLxlxPexxxarxxlxValLxxxxxeraexxxklxsxxxxxAgxWlClSqAxxxxxdexArqAyqxY Lxxxhx >c7qiiA_ NITLTRQQEFLLLNGWLQLQCGHAERACILLDALLTLNPEHLAGRRCRLVALLNNNQGERAEEAQWLISHDPLQAGNWLCLSRAQQLNGDLDARHAYQHY LELDHN >UniRef50_D2TXP3(1-93:98) Type III secretion protein SctY n=1 Tax=Arsenophonus nasoniae RepID=D2TXP3_9ENTR E=2e-21 s/c=1.11 id=37% cov=87% ----------MLLQGWLALQYGQLTRSQILLEALLKMAPDDYQARKMLIVELLKLDLPEQVlTHCVKLKNANINEAELWLCESQAYlMMEQQEKAQQAYQ NYL----- >UniRef50_A6AY40(4-110:114) VscY n=12 Tax=Vibrionaceae RepID=A6AY40_VIBPA E=2e-24 s/c=1.06 id=35% cov=97% ----TKDIELLLVHAALQVQYQQPDQAIAILDAVLELEPEREDALHTLAVACLQTGRYTRAvavcEGLLKSQSQSVQAAGIWFCLSQARWKQNDvEGARQ AHRRYLQSLHS # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1566 0 0 R 6 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 6 0 * * * * * * 1566 0 0 Q 7 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1566 0 0 Q 8 * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1566 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1566 0 0 F 10 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1566 0 0 L 11 * * * * * * * * * 597 1561 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1981 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1981 0 0 L 13 * * * * * * * * * 603 * * * * * * * 1550 * * 13 0 * * * * * * 1981 0 0 N 14 * * * * * * 1550 * * * * 1646 * 1561 * * * * * * 14 0 * * * * * * 1981 0 0 G 15 1550 * * * * 603 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1981 0 0 W 16 1550 * * * * * * * * * * * * * * * * * 603 * 16 0 * * * * * * 1981 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 18 1561 * * * * * * * * * * * * 597 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1981 0 0 L 19 * * * * * * * * * 603 * * * * * * * 1550 * * 19 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1981 0 0 C 21 * 1646 * * * * * * * * * * * * * * * * * 556 21 0 * * * * * * 1981 0 0 G 22 * * * * * 603 * * * * * * * 1550 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1981 0 0 H 23 * * * * * * 1646 * * * * * * 556 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1981 0 0 A 24 1646 * * * * * * * * 1561 * * 1550 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1981 0 0 E 25 * * 1550 1646 * * * * * * * * * * * * 1561 * * * 25 0 * * * * * * 1981 0 0 R 26 * * * * * * * * * * * * * 1550 603 * * * * * 26 0 * * * * * * 1981 0 0 A 27 597 * * * * * * * * * * * * * * 1561 * * * * 27 0 * * * * * * 1981 0 0 C 28 * 1646 * * * * * 1550 * * * * * 1561 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1981 0 0 I 29 1550 * * * * * * 603 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1981 0 0 L 30 * * * * * * * 1550 * 603 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1981 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1981 0 0 D 32 * * 597 1561 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1981 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1981 0 0 L 34 * * * * * * * * * 603 * * * * * * * 1550 * * 34 0 * * * * * * 1981 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1981 0 0 T 36 * * * 1550 * * * * 1561 * * * * * * * 1646 * * * 36 0 * * * * * * 1981 0 0 L 37 * * * * * * * * * 597 1561 * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1981 0 0 N 38 1561 * * 1550 * * * * * * * 1646 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1981 0 0 P 39 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1981 0 0 E 40 * * 1561 597 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1981 0 0 H 41 * * 1561 * * * 1646 * * * * * * * 1550 * * * * * 41 0 * * * * * * 1981 0 0 L 42 * * * 1550 * * * * * 1646 * * * * * * * * * 1561 42 0 * * * * * * 1981 0 0 A 43 1646 * 1550 * * * * * * * * * * 1561 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1981 0 0 G 44 556 * * * * 1646 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1981 0 0 R 45 * * * * * * * * * 1550 * * * * 603 * * * * * 45 0 * * * * * * 1981 0 0 R 46 * * * * * * 1550 * 1561 * * * * * 1646 * * * * * 46 0 * * * * * * 1981 0 0 C 47 * 1646 * * * * * * * * 1561 * * * * * 1550 * * * 47 0 * * * * * * 1981 0 0 R 48 * * * * * * * * * 556 * * * * 1646 * * * * * 48 0 * * * * * * 1981 0 0 L 49 1550 * * * * * * 1561 * 1646 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1981 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1981 0 0 A 51 597 * * 1561 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1981 0 0 L 52 * 1550 * * * * * * * 603 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1981 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1981 0 0 N 54 * * * * * * * * 1561 * * 1646 * 1550 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1981 0 0 N 55 * * * * * * * * * 1561 * 1646 * * * * 1550 * * * 55 0 * * * * * * 1981 0 0 N 56 * * 1561 * * 1550 * * * * * 1646 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 57 * * * * * * * * * 1561 * * * 1646 1550 * * * * * 57 0 * * * * * * 1981 0 0 G 58 * * * * * 1646 * * * * * * 1561 * * * * * * 1550 58 0 * * * * * * 1981 0 0 E 59 * * * 603 * * * * * * * * * * * * 1550 * * * 59 0 * * * * * * 1981 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * 1561 597 * * * * * 60 0 * * * * * * 1981 0 0 A 61 597 * * * * * * * * * * * * * * * * 1561 * * 61 1646 556 * 1346 721 * * 1981 1640 0 E 62 * * * 597 * * * * * * * * * * * * 1561 * * * 62 0 * * * * * * 1981 0 0 E 63 * * * 1646 * 1550 1561 * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1981 0 0 A 64 1646 1561 * * * * * * * 1550 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 65 * * * * * * * * * 1550 * * * 1646 * * * 1561 * * 65 0 * * * * * * 1981 0 0 W 66 * * * * * * * * 556 * * * * * * * * * 1646 * 66 0 * * * * * * 1981 0 0 L 67 * * * * * * * * * 603 * * * * * 1550 * * * * 67 0 * * * * * * 1981 0 0 I 68 * * * * * * * 1646 1561 * * * * 1550 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1981 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * 1561 * * * 597 * * * * 69 0 * * * * * * 1981 0 0 H 70 1561 * * * * * 1646 * * * * * * 1550 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1981 0 0 D 71 * * 1646 * * * * * * * * 1561 * * * 1550 * * * * 71 0 * * * * * * 1981 0 0 P 72 * * * * * * * 1561 * * * * 1646 * * * * 1550 * * 72 0 * * * * * * 1981 0 0 L 73 * * * * * * * * * 1646 * 1561 * 1550 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 74 1550 * * 1561 * * * * * * * * * 1646 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1981 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1981 0 0 G 76 * * * 1561 * 597 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1981 0 0 N 77 * * * * * * * 1550 * 1561 * 1646 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1981 0 0 W 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 78 0 * * * * * * 1981 0 0 L 79 * * * * 1550 * * * * 603 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1981 0 0 C 80 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1981 0 0 L 81 * * * 1561 * * * * * 597 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1981 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1981 0 0 R 83 * * * * * * * * * * * * * 556 1646 * * * * * 83 0 * * * * * * 1981 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 1646 1550 * * * * 1561 85 597 1561 * 0 * * * 1981 1000 0 Q 86 * * * * * * * * * * 1561 * * 1646 * * * * 1550 * 86 0 * * * * * * 1981 0 0 L 87 * * * * * * * * 1550 1646 1561 * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1981 0 0 N 88 * * * 1561 * * * * * * * 1646 * 1550 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1981 0 0 G 89 * * * * * 1646 * * * * * 1550 * 1561 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1981 0 0 D 90 * * 597 * * * * * * * * * * 1561 * * * * * * 90 603 1550 * 0 * * * 1981 1000 0 L 91 * * * 556 * * * * * 1646 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1981 0 0 D 92 * * 1646 * * 1550 * * 1561 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1981 0 0 A 93 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1981 0 0 R 94 * * * * * * * * * * * * * 1561 597 * * * * * 94 0 * * * * * * 1981 0 0 H 95 * * * * * * 1646 * * * * * * 556 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1981 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1981 0 0 Y 97 * * * * * * 1550 * * * * * * * * * * * * 603 97 0 * * * * * * 1981 0 0 Q 98 * * * * * * * * * * * * * 603 1550 * * * * * 98 0 * * * * * * 1981 0 0 H 99 * * * * * * 1646 * * * * 1561 * * 1550 * * * * * 99 0 * * * * * * 1981 0 0 Y 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 100 0 * * * * * * 1981 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1981 0 0 E 102 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1566 0 0 L 103 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 103 0 * * * * * * 1566 0 0 D 104 * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1566 0 0 H 105 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1566 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 106 0 * * 0 * * * 1566 0 0 //