HHsearch 1.5 NAME c7kzwA_ FAM FILE c7kzwA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7kzwA_.a3m DATE Mon Jan 4 15:51:57 2021 LENG 128 match states, 128 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.3798 -2.4195 SEQ >ss_dssp CCEECCEEEEEEETTTTEEEEEEECCTTTCCTTCCCTTSSSCCCEEEEEEEEEEESEEEEEECSTTCCEEEECSSEEEEEBCCTTCEEEEEEEESTTCEE EEEEEEEETTEEEEEEEEEEHHHHTTCC >sa_dssp EDDEACDDEECECEEDDCACBBAABDEECDBEDBDBCEDEEBBDADADADCEECEDBCABCBDDDECEEBDBDEDCEBDABACCECCBACACAECEDBCA DBDABADAEECCACCECDABBEECCEDE >ss_pred CCEEECEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEECCCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCC CEEEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHCCCC >ss_conf 9715020012755444430001145543886521430467841489999974785617999723677610011022057876187517999954666772 0699998503241123550001320789 >Consensus qxxxlpxxkhgxskkxqtaynixgfxxxntpsgixnildkkpteflvnvyvgdnxgckfxyxxdxxgkxxeitxtxsfxxylsgxnellkleckgxdsni dykivxyanxveydxvgnlsylxxsggl >c7kzwA_ QARELPLLKHGYSKKNXTAYNXFGFCCDNTPSGIFNIXDKKPTEFLVNIYVGDNQGCKFIYAADTKGKQGEITQTGSFTAYLSGRNELLKLECKGKDSNI DYKVIAYANAIEYDRVGNLSYLVESGGL >UniRef50_B0U0K3(33-160:160) Lipoprotein, putative n=20 Tax=Francisella RepID=B0U0K3_FRAP2 E=5e-58 s/c=1.75 id=70% cov=101% QGQVLPIIKHGHSKKKQTAYNIYGFKFENTPSGIYNILDKKPTEFLVNVYVGDNYGCKFTYTMDKEGKKEEITKTSSFVSYLSGSNELLKLECKGEDSNI DYKIVVYANNVEYDKVGNLSYLAASGGL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1209 0 0 A 2 1034 * * * * 967 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1209 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * 967 1034 * * * * * 3 0 * * * * * * 1209 0 0 E 4 * * * 1034 * * * * * * * * * * * * * 967 * * 4 0 * * * * * * 1209 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1209 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1209 0 0 L 7 * * * * * * * 967 * 1034 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1209 0 0 L 8 * * * * * * * 967 * 1034 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1209 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1209 0 0 H 10 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1209 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 12 * * * * * * 967 * * * * * * * * * * * * 1034 12 0 * * * * * * 1209 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1209 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1209 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1209 0 0 N 16 * * * * * * * * 967 * * 1034 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1209 0 0 X 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1209 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1209 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1209 0 0 X 22 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 F 23 * * * * 1034 * * * * * * * * * * * * * * 967 23 0 * * * * * * 1209 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1209 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1209 0 0 C 26 * 1034 * * * * * * 967 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1209 0 0 C 27 * 1034 * * 967 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1209 0 0 D 28 * * 1034 967 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1209 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1209 0 0 T 30 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 30 0 * * * * * * 1209 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1209 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1209 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1209 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1209 0 0 F 35 * * * * 1034 * * * * * * * * * * * * * * 967 35 0 * * * * * * 1209 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1209 0 0 I 37 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1209 0 0 X 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1209 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1209 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1209 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1209 0 0 T 43 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 43 0 * * * * * * 1209 0 0 E 44 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1209 0 0 F 45 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1209 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1209 0 0 V 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 47 0 * * * * * * 1209 0 0 N 48 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1209 0 0 I 49 * * * * * * * 1034 * * * * * * * * * 967 * * 49 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1209 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * * 1209 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1209 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1209 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1209 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 1034 * * * * * 967 55 0 * * * * * * 1209 0 0 G 56 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1209 0 0 C 57 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1209 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1209 0 0 F 59 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1209 0 0 I 60 * * * * * * * 1034 * * * * * * * * 967 * * * 60 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 1209 0 0 A 62 1034 * * * * * * * * * * * * * * * 967 * * * 62 0 * * * * * * 1209 0 0 A 63 1034 * * * * * * * * * 967 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1209 0 0 D 64 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1209 0 0 T 65 * * * * * * * * 967 * * * * * * * 1034 * * * 65 0 * * * * * * 1209 0 0 K 66 * * * 967 * * * * 1034 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1209 0 0 G 67 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1209 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1209 0 0 Q 69 * * * * * * * * 967 * * * * 1034 * * * * * * 69 0 * * * * * * 1209 0 0 G 70 * * * 967 * 1034 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1209 0 0 E 71 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1209 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1209 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1209 0 0 Q 74 * * * * * * * * 967 * * * * 1034 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1209 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 75 0 * * * * * * 1209 0 0 G 76 * * * * * 1034 * * * * * * * * * 967 * * * * 76 0 * * * * * * 1209 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1209 0 0 F 78 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1209 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 1034 967 * * 79 0 * * * * * * 1209 0 0 A 80 1034 * * * * * * * * * * * * * * 967 * * * * 80 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 1209 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1209 0 0 S 83 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 83 0 * * * * * * 1209 0 0 G 84 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1209 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 1034 967 * * * * 85 0 * * * * * * 1209 0 0 N 86 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1209 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1209 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1209 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1209 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1209 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1209 0 0 E 92 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1209 0 0 C 93 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1209 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1209 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1209 0 0 K 96 * * * 967 * * * * 1034 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1209 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1209 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1209 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1209 0 0 I 100 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1209 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1209 0 0 K 103 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1209 0 0 V 104 * * * * * * * 967 * * * * * * * * * 1034 * * 104 0 * * * * * * 1209 0 0 I 105 * * * * * * * 1034 * * * * * * * * * 967 * * 105 0 * * * * * * 1209 0 0 A 106 1034 * * * * * * * * * * * * * * * * 967 * * 106 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 107 0 * * * * * * 1209 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1209 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1209 0 0 A 110 1034 * * * * * * * * * * 967 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1209 0 0 I 111 * * * * * * * 1034 * * * * * * * * * 967 * * 111 0 * * * * * * 1209 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 113 0 * * * * * * 1209 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1209 0 0 R 115 * * * * * * * * 967 * * * * * 1034 * * * * * 115 0 * * * * * * 1209 0 0 V 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 116 0 * * * * * * 1209 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1209 0 0 N 118 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1209 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1209 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1209 0 0 Y 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 121 0 * * * * * * 1209 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1209 0 0 V 123 967 * * * * * * * * * * * * * * * * 1034 * * 123 0 * * * * * * 1209 0 0 E 124 967 * * 1034 * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1209 0 0 S 125 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 125 0 * * * * * * 1209 0 0 G 126 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1209 0 0 G 127 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1209 0 0 L 128 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 128 0 * * 0 * * * 1209 0 0 //