HHsearch 1.5 NAME c7bpoA_ FAM FILE c7bpoA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c7bpoA_.a3m DATE Sat Mar 27 08:26:24 2021 LENG 165 match states, 165 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3853 -2.1082 SEQ >ss_dssp CCCCGGGSCCBCCCCHHHHHTTCCEEEEEESSSTTTTCEEEEECCSTTCCSSCEEEEEEETTEEEEEEEEECTTSSCEEEEETTTCCEEEEEEEEEETTC TTCCEEEEEEEETTEEEEEEEEESSSCCCHHHHHHHHHHHTSTTGGGCEESSSSCCCCSSSSSCC >sa_dssp EECCADEBDCDEBDECECBCECCDACABBABCEEBCBBBBCBCDCEEEDEEBCABACBCDCEEDCCBCBDCCEEBDBBDBDBDEEDDECDBBBBBCCBEC EEBAAAABABCEEDDADBABAAACEDCDAEDADEBBEDADDBDCAEDBCDACEECDEDEEDECDD >ss_pred CCCCHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCC CCCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEECCCCC >ss_conf 9653536710148750210268851578998326552247887520333565651476401268950135505541555531676750367688664378 77574566634897355688514665138899788776414898755689631589731123329 >Consensus gsltcdklpkvippgidaftshnpfefsyvltddldctarvyvqpvhgltnysgtafdikgthitindftigadgltayltncdtgekqvwhfqyvdlgd pqganycayscngpqiaeykcttntgyispkqlqavkearsvpngdkihlaqvdcpphlycplyy >c7bpoA_ GSLTCDKLPKVIPPGIDAFTSHNPFEFSYVLTDDLDCTARVYVQPVHGLTNYSGTAFDIKGTHITINDFTIGADGLTAYLTNCDTGEKQVWHFQYVDLGD PQGANYCAYSCNGPQIAEYKCTTNTGYISPKQLQAVKEARSVPNGDKIHLAQVDCPPHLYCPLYY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 C 5 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 P 9 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 I 12 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 P 14 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 I 16 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 F 19 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 H 22 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 D 33 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 D 36 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 C 37 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 A 39 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 R 40 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 V 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 42 0 * * * * * * 1000 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 P 45 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 H 47 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 L 49 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 N 51 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 T 55 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 F 57 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 G 61 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 H 63 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 T 65 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 I 66 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 D 68 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 F 69 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 A 73 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 D 74 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1000 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 C 83 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 T 85 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 K 88 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 89 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 W 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 H 92 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 F 93 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 94 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 1000 0 0 V 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 L 98 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 D 100 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 P 101 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 102 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 G 103 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 A 104 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * * 1000 0 0 C 107 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 109 0 * * * * * * 1000 0 0 S 110 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 C 111 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 N 112 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 G 113 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 115 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 I 116 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 A 117 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1000 0 0 K 120 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 C 121 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 T 122 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 T 123 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 N 124 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 T 125 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 G 126 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 127 0 * * * * * * 1000 0 0 I 128 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 S 129 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 P 130 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 K 131 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 132 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 134 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 A 135 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 V 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 K 137 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 R 140 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 S 141 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 V 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 P 143 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 N 144 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 G 145 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 D 146 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 K 147 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 I 148 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 H 149 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 L 150 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 A 151 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 152 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 V 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 D 154 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 C 155 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 P 156 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 P 157 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 H 158 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 L 159 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 160 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 160 0 * * * * * * 1000 0 0 C 161 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 P 162 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 L 163 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 164 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 164 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 165 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 165 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //