HHsearch 1.5 NAME c6zh1A_ FAM FILE c6zh1A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6zh1A_.a3m DATE Sat Jan 15 08:40:03 2022 LENG 159 match states, 159 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.4343 0.1172 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHTCGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHSSCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT TCCGGGGSGGGTTCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCHHHHHHHHHHHTCC >sa_dssp EEDCDDBDEDBDEDBDEBBECACDCADCDEBDECADDCBEDDBDDBDEEEDDEEBBDDAEEEBDCECDDECACEABEDBDDEDADDAACCACCBCDBAEE CEBEDBECEEBEECEDDDCCCDDBCDEBABBAAABAABBCCDCBEBEDABECACECAED >ss_pred CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC CCEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9108999973025725799999997311578899999999999998741028572455640467642568999999983416899999999999999505 74101001471456656899999999722101376766303776888999999997429 >Consensus xktldxlxsxlDxnQKQAlxfFkdxlqdkkyxxxlxqaqkxxLxxlxkxkxdxxlqxklxkxlnxxYdxsxxeklfxxLGNdkxKqFLqqLHixlkxInd GtxxSFsSxNfndlxxLeqKqEralxxixxxLYvxyYfYxNgxxxxdxFFxxxMxylxx >c6zh1A_ LKTLDNLLKTLDNNQKQALIYFKDKLQDKKYLNDLMEQQKSFLDNLQKKKEDPDLQDRLKKTLNSEYDESQFNKLLNELGNAKAKQFLQQLHIMLQSIKD GTLTSFSSSNFNDLQNLEQKKERALQYINGKLYVEYYFYINGISNADNFFETIMEYLKT >UniRef50_B0L8D6(32-185:185) Factor H binding protein n=13 Tax=Borrelia RepID=B0L8D6_BORHD E=2e-40 s/c=1.08 id=85% cov=97% -----NLLKTLDNNQKQALIYFKDTLQDKKYLSYLTTSQKNFLDDLEKNKKAPGLQYKLKKTLSSEYDESQFNKLLNELGNAKAKQFLQQLHIMLQSIKD GTLTSFSSANFNDLQNLEQKKERALQSINGELYVEYYFYINGISNPDNFFEKIMQNLKT >UniRef50_C1L349(28-174:175) Complement regulators and plasminogen binding protein A n=1 Tax=Borrelia recurrentis RepID=C1L349_9SPIO E=9e-39 s/c=1.09 id=46% cov=93% -KTLETLESNIDDGQKQALAFFQESLQDNKHLDALKQAQSALL---------KDIKDKPQKTLNFKYNKTKLEQLFRKLGNDKTKQFLKNLHVTIKFINN GSFQSFSSANFNDLDTLEKKQERAINSIKEELYVNYYLYTNELVDLDYFFYRAMNYL-- >UniRef50_Q0SLI6(32-197:204) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Borrelia burgdorferi group RepID=Q0SLI6_BORAP E=2e-36 s/c=0.92 id=42% cov=96% ----DAIISSLDSNQKQAFIFFKDLVKNKQYSKDFDQAIKEPLEALKARieelknenKQDIELQNKLDQGFNCDYDDSKMEKLFVQLGNDNVKKFLQQLH LVLKAINDGTHISFTSLNLTQTpKTLSEKQEIVLDVTKRNLYIQFYFYSNdifreGYTPAEYFFNEVMKY--- >UniRef50_C0R979(31-151:151) Factor H binding protein n=2 Tax=Borrelia burgdorferi group RepID=C0R979_BORVA E=2e-24 s/c=0.93 id=52% cov=77% ----NNIISNLDSNQKQALAFFKDLVQNKQYSKDLEQASKSFLEDLKKNNKDLNLQNKLNQGLSCDYDDSIVEESFAQLGNDKMKKFLQQLHIMLKAINY GTLVSFSSLNFKDLSNLNQKQERVL---------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1419 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1419 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1419 0 0 D 5 * * 967 1930 * * * * * * * 2146 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1870 0 0 N 6 2136 * * * * * * * * * * 888 * * * * 2106 * * * 6 0 * * * * * * 1902 0 0 L 7 * * * * * * * 1269 * 773 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1902 0 0 L 8 * * * 2106 * * * 1269 * 1503 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1902 0 0 K 9 * * * * * * * * 1503 * * * * * * 628 * * * * 9 0 * * * * * * 1902 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * 1252 * * * 2136 1503 * * * 10 0 * * * * * * 1902 0 0 L 11 * * * * * * * 2106 * 381 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1902 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1902 0 0 N 13 * * 2106 * * * * * * * * 1503 * * * 1269 * * * * 13 0 * * * * * * 1902 0 0 N 14 * * * * * 2106 * * * * * 381 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1902 0 0 K 16 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1902 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1902 0 0 L 19 * * * * 2136 * * * * 372 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1902 0 0 I 20 1252 * * * * * * 785 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1902 0 0 Y 21 * * * * 628 * * * * * * * * * * * * * * 1503 21 0 * * * * * * 1902 0 0 F 22 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1902 0 0 K 23 * * * * * * * * 381 * * * * 2106 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1902 0 0 D 24 * * 381 2106 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1902 0 0 K 25 * * * * * * * * 2504 1269 * * * * * 2106 2503 * * * 25 0 * * * * * * 1902 0 0 L 26 * * * * * * * * * 773 * * * * * * * 1269 * * 26 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 27 * * * * * * * * 2136 * * * * 372 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1902 0 0 D 28 * * 773 * * * * * * * * 1269 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1902 0 0 K 29 * * * * * * * * 381 * * 2106 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1902 0 0 K 30 * * * * * * * * 773 * * * * 1269 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1902 0 0 Y 31 * * * * * * 2106 * * * * * * * * * * * * 381 31 0 * * * * * * 1902 0 0 L 32 * * * * * * * * * 773 * * * * * 1269 * * * * 32 0 * * * * * * 1902 0 0 N 33 * * 2106 * * * * * 1269 * * 2504 * * * 2503 * * * * 33 0 * * * * * * 1902 0 0 D 34 2106 * 758 * * * * * * * * * * * * * * * * 2503 34 0 * * * * * * 1902 0 0 L 35 * * * * 2136 * * * * 372 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1902 0 0 M 36 * * 2136 2416 * * * * 2106 * 2504 * * * * * 2503 * * * 36 0 * * * * * * 1902 0 0 E 37 * * * 2504 * * * * * * * * * 628 * * 2503 * * * 37 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 38 628 * * * * * * * * * * * * 2504 * 2503 * * * * 38 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 39 * * * * * * * 2136 * * * * * 773 * 2416 * * * * 39 0 * * * * * * 1902 0 0 K 40 * * * * * * * * 381 * * * * * * 2106 * * * * 40 0 * * * * * * 1902 0 0 S 41 2106 * * 2136 * * * * * * * 2503 * * * 1459 * * * * 41 0 * * * * * * 1902 0 0 F 42 * * * * 888 * * * * 2106 * * 2136 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1902 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 381 * 2106 * * * * 1902 0 0 D 44 * * 1104 903 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * 0 1648 0 1000 N 45 1795 * 1061 * * * * * * * * 2104 * * * * * * * * 45 0 * * * * * 0 1648 0 1000 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * 0 1648 0 1000 Q 47 * * * 2104 * * * * 903 * * * * 2104 * * * * * * 47 0 * * * * * 0 1648 0 1000 K 48 1795 * * * * * * * 490 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * 0 1648 0 1000 K 49 * * * * * * * * 2104 * * 1061 * * 1795 * * * * * 49 490 1795 * 3000 193 * 0 1648 1000 1000 K 50 * * * * * * * * 408 * * 2020 * * * * * * * * 50 0 * * * * * 0 1648 0 1000 E 51 * * * 2104 * * * * 1061 * * * * 1795 * * * * * * 51 0 * * * * * 0 1648 0 1000 D 52 2104 * 382 * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * 0 * 1648 0 1000 P 53 * * * * * * * 2136 2106 2416 * * 1503 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1902 0 0 D 54 * * 1291 2136 * 2503 * * * * * 2416 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1902 0 0 L 55 * * * * * * * 2106 * 381 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 56 * * * * * * * * 2106 * * * * 381 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1902 0 0 D 57 * * 1291 * * * * * * * * 1269 * * * * * * * 2503 57 0 * * * * * * 1902 0 0 R 58 * * * * * * * * 280 * * * * * 2504 * * * * * 58 0 * * * * * * 1902 0 0 L 59 * * * * * * * * * 381 * * 2106 * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1902 0 0 K 60 * * 2136 * * * * * 1503 * * 2416 * 2106 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1902 0 0 K 61 * * * * * * * * 773 * * * * 1269 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1902 0 0 T 62 * * * * * 1269 * * * * * * * * * * 773 * * * 62 0 * * * * * * 1902 0 0 L 63 * * * * 2136 * * * * 372 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1902 0 0 N 64 * * * * * * * * * * * 653 * * * 1459 * * * * 64 0 * * * * * * 1902 0 0 S 65 * 1269 * * 2106 * * * * * * * * * * 1503 * * * * 65 0 * * * * * * 1902 0 0 E 66 * * 1269 1503 * * * * 2106 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1902 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1902 0 0 D 68 * * 381 * * * * * * * * 2106 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1902 0 0 E 69 * * 1269 1503 * * * * 2106 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1902 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 381 2106 * * * 70 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 71 * * * * * * * 2416 1121 * * * * 1503 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1902 0 0 F 72 * * * * 1503 * * * * 2106 2136 * * * * * * 2416 * * 72 0 * * * * * * 1902 0 0 N 73 * * * 628 * * * * * * * 1503 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1902 0 0 K 74 * * * 2416 * * * * 785 * * * * 2106 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1902 0 0 L 75 * * * * * * * * * 299 * * * * * 2416 * * * * 75 0 * * * * * * 1902 0 0 L 76 * * * * 628 * * * * 1503 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1902 0 0 N 77 2416 * * * * * * * * * * 1503 * * 2106 * * 2136 * * 77 0 * * * * * * 1902 0 0 E 78 * * * 1503 * * * * 2106 * * * * 1269 * * * * * * 78 0 * * * * * * 1902 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1902 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1902 0 0 N 81 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1902 0 0 A 82 1503 * 628 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1902 0 0 K 83 * * * * * * * * 372 * * 2136 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1902 0 0 A 84 1503 * * * * * * * * * 2416 * * * * * 2106 2136 * * 84 0 * * * * * * 1902 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 86 * * * * * * * * 1269 * * * * 773 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1902 0 0 F 87 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1902 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 89 * * * * * * * * 2106 * * * * 381 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 90 * * * * * * * * * * * 2106 * 381 * * * * * * 90 0 * * * * * * 1902 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1902 0 0 H 92 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1902 0 0 I 93 * * * * * * * 888 * 2136 * * * * * * * 2106 * * 93 0 * * * * * * 1902 0 0 M 94 * * * * * * * * * * 888 * * * * * 2106 2136 * * 94 0 * * * * * * 1902 0 0 L 95 * * * * * * * 2106 * 381 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 96 * * * * * * * * 628 * * * * 1503 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1902 0 0 S 97 1269 * * * 2106 * * * * * * * * * * 1503 * * * * 97 0 * * * * * * 1902 0 0 I 98 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1902 0 0 K 99 * * * * * * * * 1503 * * 628 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1902 0 0 D 100 * * 785 * * * * * * * * 2106 * * * * * * * 2416 100 0 * * * * * * 1902 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1902 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * 2106 381 * * * 102 0 * * * * * * 1902 0 0 L 103 * * * * 2106 * 2136 * * 888 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1902 0 0 T 104 * * * * * * * 2136 * * * * * 2106 * * 1503 2416 * * 104 0 * * * * * * 1902 0 0 S 105 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 105 0 * * * * * * 1902 0 0 F 106 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1902 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * * * * * 372 2136 * * * 107 0 * * * * * * 1902 0 0 S 108 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 108 0 * * * * * * 1902 0 0 S 109 1291 * * * * * * * * 1269 * * * * * 2504 * * * * 109 0 * * * * * * 1902 0 0 N 110 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1902 0 0 F 111 * * * * 372 * * * * 2136 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1902 0 0 N 112 * * * * * * * * 2416 * * 773 * * * * 2136 * * * 112 0 * * * * * * 1902 0 0 D 113 * * 372 * * * * * * * * * * 2136 * * * * * * 113 0 * * * * * * 1902 0 0 L 114 * * * * * * * * * 372 * * * * * * 2136 * * * 114 372 2136 * 0 * * * 1902 1000 0 Q 115 * * 2106 * * * * * 2136 * * * * 1503 * 2416 * * * * 115 0 * * * * * * 1902 0 0 N 116 * * * * * * * * * * * 888 * * * * 1121 * * * 116 0 * * * * * * 1902 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1902 0 0 E 118 * * * 773 * * * * * * * 2416 * * * 2136 * * * * 118 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 119 * * * 2136 * * * * 2106 * * * * 888 * * * * * * 119 0 * * * * * * 1902 0 0 K 120 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1902 0 0 K 121 * * * * * * * * 1503 * * * * 628 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1902 0 0 E 122 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1902 0 0 R 123 * * * * * * * 2136 * * * * * * 372 * * * * * 123 0 * * * * * * 1902 0 0 A 124 773 * * * * * * * * * * * * * * * * 1269 * * 124 0 * * * * * * 1902 0 0 L 125 * * * * * * * 2106 * 381 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1902 0 0 Q 126 * * 1723 * * * * * * * * 1893 * 1225 * * * * * * 126 0 * * * * * * 1872 0 0 Y 127 * * * * * * * * * * * * * * * 1042 * 1723 * 2242 127 0 * * * * * * 1872 0 0 I 128 * * * * * * * 521 * * * * * * * * 1723 * * * 128 0 * * * * * * 1872 0 0 N 129 * * * * * * * * 805 * * 1225 * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1872 0 0 G 130 * * * 1893 * 1225 * * * * * * * * 1723 * * * * * 130 0 * * * * * * 1872 0 0 K 131 * * * 1042 * * * * 2242 * * 1723 * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1872 0 0 L 132 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1872 0 0 Y 133 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 133 0 * * * * * * 1872 0 0 V 134 * * * * * * * 1723 * * * * * * * * * 521 * * 134 0 * * * * * * 1872 0 0 E 135 * * * 1225 * * * * * * * 1893 * 1723 * * * * * * 135 0 * * * * * * 1872 0 0 Y 136 * * * * 1723 * * * * * * * * * * * * * * 521 136 0 * * * * * * 1872 0 0 Y 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 137 0 * * * * * * 1872 0 0 F 138 * * * * 453 * * * * 1893 * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1872 0 0 Y 139 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 139 0 * * * * * * 1872 0 0 I 140 * * * * * * * 1225 * * * * * * * 1723 1893 * * * 140 0 * * * * * * 1872 0 0 N 141 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 141 521 1723 * 2322 322 * * 1872 1000 0 G 142 * * * 1893 * 453 * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1872 0 0 I 143 * * * * * * * 1225 * 1893 * * * * * * * * * 1723 143 0 * * * * * * 1872 0 0 S 144 * * * * * * * * * * * * * * * 1225 1723 1893 * * 144 0 * * * * * * 1872 0 0 N 145 * * 1893 * * * * * * * * 1225 1723 * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1872 0 0 A 146 959 * * * * * * * * 1893 * * 2209 * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1872 0 0 D 147 * * 521 1723 * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1872 0 0 N 148 * * * * * * * * * * * 1225 * * * * * * * 805 148 0 * * * * * * 1872 0 0 F 149 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1872 0 0 F 150 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1872 0 0 E 151 * * * 1225 * * * * * * * 1723 * * * * * * * 1893 151 0 * * * * * * 1872 0 0 T 152 * * * 1723 * * * * 2209 * * * * * 1893 * 2242 * * * 152 0 * * * * * * 1872 0 0 I 153 1893 * * * * * * 1225 * * * * * * * * * 1723 * * 153 0 * * * * * * 1872 0 0 M 154 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1872 0 0 E 155 * * * 2242 * * * * 1723 * * 1893 * 2209 * * * * * * 155 0 * * * * * * 1872 0 0 Y 156 * * * * * * * * * * * 2209 * * * * * * * 352 156 0 * * * * * * 1872 0 0 L 157 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1502 0 0 K 158 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1109 0 0 T 159 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 159 0 * * 0 * * * 1109 0 0 //