HHsearch 1.5 NAME c6ywdC_ FAM FILE c6ywdC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6ywdC_.a3m DATE Sat Oct 10 08:48:39 2020 LENG 75 match states, 75 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4283 0.5584 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHTSSSCHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCCSTHHHHHHHHHGGGGTTCHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDEECEEDCDEBDEDAEEBECDEECCECBCEBADDBBDDEEEEEEDDEDECDDDAADDBEEDEEBCECACDBCEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 904899999999985046730057999998899999999843299999999999999851870899998666409 >Consensus verelrnwlsevlskindapvtndikkaisnqvlkvaeqvwnskeelqervrkevcsvcsnvpacwaicggllev >c6ywdC_ VERELRNWLSEVLSKINDAPVTNDIKKAISNQVLKVAEQVWNSKEELQERVRKEVCSVCSNVPACWAICGGLLEV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 N 7 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 W 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 I 16 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 N 17 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 P 20 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 K 26 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 32 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 V 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 V 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 W 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 K 44 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 R 50 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 K 53 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 C 56 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 C 59 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 V 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 C 65 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 W 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 I 68 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 C 69 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 V 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 75 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //