HHsearch 1.5 NAME c6r1gA_ FAM FILE c6r1gA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6r1gA_.a3m DATE Sat Sep 21 08:27:24 2019 LENG 148 match states, 148 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4256 -0.0489 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHTCCCCGGGHHHHHTTCEEEEEEEETTEEEEESSSTTCSEEEEEETTEEEEEEEEEETTEEEEEEEEECTTSSBEEEEEEESSCCGG GGTSSSCBEETTEECCCCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTTC >sa_dssp EBECECBCBAADABDCECEEEDCEDCBEEBECCCACCEEDEBDDCECCEEBDAAAABBEECAAABBDBDBEEEEBCAAAAACDECECACCABCDECECEC DDDADECDBDECEBDCEBEEEDEBBDCACEBACCAACAACDBBEDCDE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCEEECCCEEEEEEEECHHHHHHHCCCCCCCCHHH HEEHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9631348889987532320122454137227999954678374226555845999996140036552033275149999537017886212223320011 000002512353579998158622898998676898207532022069 >Consensus kidehtighvfhamgvvhskkdrkslgknikvfyfseedghfqtipskenaklivyfydnvyageapisisgkeafifvgitpdfkkiinsnlhgaksdl igtfkdlniknskleitvdennsdaktflesvnyiidgvekispmltn >c6r1gA_ KIDEHTIGHVFHAMGVVHSKKDRKSLGKNIKVFYFSEEDGHFQTIPSKENAKLIVYFYDNVYAGEAPISISGKEAFIFVGITPDFKKIINSNLHGAKSDL IGTFKDLNIKNSKLEITVDENNSDAKTFLESVNYIIDGVEKISPMLTN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 D 3 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 H 5 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 H 9 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 F 11 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 H 12 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 M 14 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 H 18 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 G 27 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 I 30 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 34 0 * * * * * * 1000 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 H 41 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 F 42 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 43 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 K 52 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 I 54 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 56 0 * * * * * * 1000 0 0 F 57 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 62 0 * * * * * * 1000 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 P 67 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 I 68 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 I 70 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 F 76 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 F 78 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 I 81 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 P 83 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 K 86 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 I 88 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 I 89 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 N 92 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 L 93 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 H 94 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 K 97 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 D 99 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 T 103 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 F 104 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 K 105 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 D 106 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 N 108 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 I 109 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 K 110 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 K 113 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 E 115 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 I 116 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 T 117 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 D 119 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 E 120 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 N 121 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 D 124 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 A 125 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 K 126 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 T 127 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 F 128 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 E 130 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 S 131 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 V 132 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 N 133 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 134 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 134 0 * * * * * * 1000 0 0 I 135 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 I 136 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 D 137 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 G 138 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 V 139 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 E 140 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 K 141 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 I 142 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 S 143 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 P 144 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 M 145 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 L 146 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 T 147 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 N 148 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 148 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //