HHsearch 1.5 NAME c6q5uQ_ FAM FILE c6q5uQ_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6q5uQ_.a3m DATE Sat Jun 22 08:33:27 2019 LENG 124 match states, 124 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.3899 -1.5247 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCCCCCCCSCCSSCCCCCBCCEECSSSEEEEECHHHHHTTSCCCCCEEEEECSSCCSCEEEECTTTCCCCEECTTCEEEEECCCCSSCEEEEE CSSCCEECEEECCSCCCCCBSSCC >sa_dssp EEEEEEEEEECEDCEEECEEDEDDCECEBEBDEEECEBDBDECDEDEEBCAABAACACAEEBECDACACADDCECECCAECDBCACBDBDBCDDACACAC CECEDEADACABACDCEEDDEDEE >ss_pred CCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCEEECCCCCCCEEEEEECCHHHHHHH HHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCC >ss_conf 9842236653054344478885135468985163589999985225862314799971323567079972004868882477864012552557998898 523884206776300100304679 >Consensus manqqiggsTxxYNGxxxxxGPxaixxxxxiAGxxVxxDLxxxxxTxxxsGVQxiYIDxxxxxGxxxixxxxTGQRIxxxAGxQGYxPxLxxxxxKFixx xxxxGKxPxxFiNFxIAxGVWpsg >c6q5uQ_ MANQQIGGSTVTYNGAIPMGGPVAINSVIEIAGTEVLVDLKLDYATGKISGVQTLYIDLRDFLGDVTVTMPDTGQRITARAGTQGYYPVLSTNLMKFIVS ATIDGKFPMNFINFPIALGVWPSG >UniRef50_P27384(12-126:126) Penton protein P31 n=6 Tax=Enterobacteria phage PRD1 RepID=VP31_BPPRD E=2e-12 s/c=0.64 id=39% cov=91% ---------TPVYNGCDSGEGPQSVRGYFDaVAGENVKYDLTYLADTQGFTGVQCIYIDNAENDGAFEIDVEETGQRIKCPAGKQGYFPLLVPGRAKFVA RHLGSGKksVPLFFLNFTIAQGVW--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 4 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 G 7 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1523 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * 11 0 * * * * * * 1523 0 0 T 12 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 12 0 * * * * * * 1523 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1523 0 0 N 14 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1523 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1523 0 0 A 16 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1523 0 0 I 17 * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1523 0 0 P 18 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 18 0 * * * * * * 1523 0 0 M 19 * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1523 0 0 G 20 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1523 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1523 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1523 0 0 V 23 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 23 0 * * * * * * 1523 0 0 A 24 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 24 0 * * * * * * 1523 0 0 I 25 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 25 0 * * * * * * 1523 0 0 N 26 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 26 0 * * * * * * 1523 0 0 S 27 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 27 0 * * * * * * 1523 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 28 0 * * * * * * 1523 0 0 I 29 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1523 0 0 E 30 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 1000 1000 * 0 * * * 1523 1000 0 I 31 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 31 0 * * * * * * 1523 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1523 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1523 0 0 T 34 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 34 0 * * * * * * 1523 0 0 E 35 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1523 0 0 V 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 36 0 * * * * * * 1523 0 0 L 37 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1523 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 38 0 * * * * * * 1523 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1523 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1523 0 0 K 41 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 41 0 * * * * * * 1523 0 0 L 42 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 42 0 * * * * * * 1523 0 0 D 43 * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1523 0 0 Y 44 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 44 0 * * * * * * 1523 0 0 A 45 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1523 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1523 0 0 G 47 * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1523 0 0 K 48 * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1523 0 0 I 49 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1523 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 50 0 * * * * * * 1523 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1523 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1523 0 0 Q 53 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1523 0 0 T 54 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 54 0 * * * * * * 1523 0 0 L 55 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1523 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 56 0 * * * * * * 1523 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1523 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1523 0 0 L 59 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1523 0 0 R 60 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 60 0 * * * * * * 1523 0 0 D 61 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1523 0 0 F 62 * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1523 0 0 L 63 * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1523 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1523 0 0 D 65 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1523 0 0 V 66 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 66 0 * * * * * * 1523 0 0 T 67 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 67 0 * * * * * * 1523 0 0 V 68 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 68 0 * * * * * * 1523 0 0 T 69 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 69 0 * * * * * * 1523 0 0 M 70 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 70 0 * * * * * * 1523 0 0 P 71 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1523 0 0 D 72 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1523 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1523 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1523 0 0 Q 75 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1523 0 0 R 76 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 76 0 * * * * * * 1523 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1523 0 0 T 78 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 78 0 * * * * * * 1523 0 0 A 79 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1523 0 0 R 80 * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * 80 0 * * * * * * 1523 0 0 A 81 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1523 0 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1523 0 0 T 83 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 83 0 * * * * * * 1523 0 0 Q 84 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1523 0 0 G 85 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1523 0 0 Y 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 86 0 * * * * * * 1523 0 0 Y 87 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 87 0 * * * * * * 1523 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1523 0 0 V 89 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 89 0 * * * * * * 1523 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1523 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 91 0 * * * * * * 1523 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 92 0 * * * * * * 1523 0 0 N 93 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1523 0 0 L 94 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 94 0 * * * * * * 1523 0 0 M 95 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1523 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1523 0 0 F 97 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1523 0 0 I 98 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 98 0 * * * * * * 1523 0 0 V 99 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 99 0 * * * * * * 1523 0 0 S 100 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 100 0 * * * * * * 1523 0 0 A 101 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1523 0 0 T 102 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 102 0 * * * * * * 1523 0 0 I 103 * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1523 0 0 D 104 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 104 0 * * * * * * 1523 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1523 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 1000 1000 * 1000 1000 * * 1523 1000 0 F 107 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 107 0 * * * * * * 1523 0 0 P 108 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1523 0 0 M 109 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1523 0 0 N 110 * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1523 0 0 F 111 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1523 0 0 I 112 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1523 0 0 N 113 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1523 0 0 F 114 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1523 0 0 P 115 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 115 0 * * * * * * 1523 0 0 I 116 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1523 0 0 A 117 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1523 0 0 L 118 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 118 0 * * * * * * 1523 0 0 G 119 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1523 0 0 V 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 120 0 * * * * * * 1523 0 0 W 121 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 121 0 * * * * * * 1523 0 0 P 122 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //