HHsearch 1.5 NAME c6q5uN_ FAM FILE c6q5uN_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6q5uN_.a3m DATE Sat Jun 22 08:27:27 2019 LENG 51 match states, 51 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4683 2.4706 SEQ >ss_dssp CCCTTCCSCHHHHSSCCCSSCSSCCCSCCCCSCSHHHHHHHHHHHHHHHTC >sa_dssp EECECEDCDCEEBEEEDEEEDEEEEEECEEEDDEEDDDEDDEDDECBDEDE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 977657899710027866770574104566766655898898887764079 >Consensus qvasnwegppymtynqpqagsvtlpvagyissqlnnyaeslndylasqagv >c6q5uN_ QVASNWEGPPYMTYNQPQAGSVTLPVAGYISSQLNNYAESLNDYLASQAGV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 W 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 P 9 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 11 0 * * * * * * 1000 0 0 M 12 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1000 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 16 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 P 17 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 P 25 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 G 28 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 29 0 * * * * * * 1000 0 0 I 30 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 37 0 * * * * * * 1000 0 0 A 38 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 44 0 * * * * * * 1000 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //