HHsearch 1.5 NAME c6n1lA_ FAM FILE c6n1lA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6n1lA_.a3m DATE Sat Mar 30 08:21:20 2019 LENG 141 match states, 141 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4605 0.3904 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCSSSCHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHTCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp ECEEDBDCADEBADBABEBACEACECCDDBCDCCECCECEEDEEEDCCDAEDDBEECDCEDACEAADCABECACDABECAEDBEEEDBCDACDCADEBCD DADDABDDAEECEDCCDAADDABECACEBCDCADEABECBE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9424799999999999989996517112002101501332027588999999997523999999999999999998620145665556567767999999 99999999973013589999999999999898999863239 >Consensus RyksylexVkxnvdsAIxtIxKixxtxxxxstKlxxmYxxRxxxxxKxkaxeexskFxKxkLxxxlxxlLnxIqxSxxxAxxxxxIxdxxaKxkLexlet EiktLiaKvqxqxxxYeaYkxIvsSIlxmxdslxxvxxxxx >c6n1lA_ RYQSYLEGVKYNVDSAIQTITKIYNTYTLFSTKLTQMYSTRLDNFAKAKAKEEAAKFTKEDLEKNFKTLLNYIQVSVKTAANFVYINDTHAKRKLENIEA EIKTLIAKIKEQSNLYEAYKAIVTSILLMRDSLKEVQGIID >UniRef50_B5RPD7(252-392:398) BBK32 immunogenic protein P35, lipoprotein n=9 Tax=Borrelia RepID=B5RPD7_BORDL E=3e-43 s/c=1.25 id=68% cov=101% RYKSYLESVRYNVDSAIDTIDKIYNNYILFSTKQTQMYSTRLNSVTKAKAREEAKYFTKEKLERDLKTLLNYIQVSAKTATNFVYIREIHAKQRLNKLEI EMKSLISKVQGQSNSYEAYKAIVSSILQMKDSLEIVQSSTD >UniRef50_C5J484(208-348:354) Fibronectin binding protein n=27 Tax=Borrelia burgdorferi group RepID=C5J484_9SPIO E=4e-39 s/c=1.15 id=87% cov=101% RYQSYLEGVKHNVDSAIKTITKIYDTYTLFSTKRTQMYSTRLDNLAKAKAAEEATKFTKEDLEKNFKTLLNYIQVSVKTATNFVYISETHAKGKLENIET EIKTLIAKIKEQSNLYEAYKAIVRSILLMRDSLKKVKGAIE >UniRef50_B5RS69(258-391:415) Antigenic protein P35 n=3 Tax=Borrelia RepID=B5RS69_BORRA E=6e-30 s/c=0.98 id=34% cov=89% RSKNTKDSVKKAFKLAIQ-IKKDWGTVEFHKTKLNPIYGIRATSDEKQKSQRKLSKFNKNKLIESLTKFLNAIEESLNNADALTNIpeypgsfaKDLQAK AKLDRLKTEIKTLISKVQKSNKTnYQSYEEIGSSI--------------- >UniRef50_Q1CNX8(205-336:362) BBK32-like protein n=2 Tax=Borrelia hermsii RepID=Q1CNX8_BORHD E=3e-17 s/c=0.68 id=32% cov=71% -----------------------WGTVEFLTMKLDPNYGIRSTKEEKQEYQEKLSKFNKNKLTEDLTKLLSAIEESLNDAIALTNIpeypgsfqSDLDSK TKLEKLKTEISSLLAKVQVSHKTnYQAYKEI------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1742 0 0 Y 2 * * * * * * * * * * * * * * * 1504 * * * 627 2 0 * * * * * * 1742 0 0 Q 3 * * * * * * * * 765 * * * * 1281 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1742 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * 1504 * * * 627 * * * * 4 0 * * * * * * 1742 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 1504 * * 627 5 0 * * * * * * 1742 0 0 L 6 * * * * * * * * 1504 627 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1742 0 0 E 7 * * 1504 627 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1742 0 0 G 8 * * * * * 1281 * * * * * * * * * 765 * * * * 8 0 * * * * * * 1742 0 0 V 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 9 0 * * * * * * 1742 0 0 K 10 * * * * * * * * 389 * * * * * 2082 * * * * * 10 0 * * * * * * 1742 0 0 Y 11 * * * * * * 2272 * 1504 * * * * * * * * * * 1183 11 0 * * * * * * 1742 0 0 N 12 1504 * * * * * * * * * * 627 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1742 0 0 V 13 * * * * 1504 * * * * * * * * * * * * 627 * * 13 0 * * * * * * 1742 0 0 D 14 * * 627 * * * * * 1504 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1742 0 0 S 15 * * * * * * * * * 1504 * * * * * 627 * * * * 15 0 * * * * * * 1742 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1742 0 0 I 17 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1742 0 0 Q 18 * * 2082 * * * * * 2272 * * * * 845 * * * * * * 18 627 * 1504 * * * * 1742 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * 0 * 1299 0 1000 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1742 0 0 T 21 * * 2082 * * * * * 1504 * * * * * * * 1281 * * * 21 0 * * * * * * 1742 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1742 0 0 I 23 * * 1504 * * * * 627 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1742 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1122 887 24 0 * * * * * * 1924 0 0 N 25 * * 2554 * * 1122 * * * * * 1433 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1924 0 0 T 26 * * * * * * * * * * * 2322 * * * * 322 * * * 26 0 * * * * * * 1924 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1122 * 887 27 0 * * * * * * 1924 0 0 T 28 * * * 1122 * * * 2322 * * * * * * * * 1554 * * * 28 0 * * * * * * 1924 0 0 L 29 * * * * 1122 * * * * 887 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1924 0 0 F 30 * * * * 887 * 2130 * * 2115 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1924 0 0 S 31 * * * * * * * * 2130 * * * * * * 887 2115 * * * 31 0 * * * * * * 1924 0 0 T 32 * * * * * * * * * * 2115 * * * * * 379 * * * 32 0 * * * * * * 1924 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1924 0 0 L 34 * * * * * * * * * 667 * * * 2322 2554 * * * * * 34 0 * * * * * * 1924 0 0 T 35 * * 2115 * * * * * * * * 2130 * * * * 887 * * * 35 0 * * * * * * 1924 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * 1122 887 * * * * * * 36 0 * * * * * * 1924 0 0 M 37 * * * * * * * 2130 * * 887 2115 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1924 0 0 Y 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 38 0 * * * * * * 1924 0 0 S 39 * * * * * 1122 * * * * * * * * * 887 * * * * 39 0 * * * * * * 1924 0 0 T 40 * * * * * * * 1122 * * * * * * * * 887 * * * 40 0 * * * * * * 1924 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1924 0 0 L 42 2130 * * * * * * * * 887 * * * * * 2115 * * * * 42 0 * * * * * * 1924 0 0 D 43 * * 1554 * * * * * * * * 2322 * * * * 1122 * * * 43 0 * * * * * * 1924 0 0 N 44 * * * * * * * * 2115 * * 1554 * * * 1223 * * * * 44 0 * * * * * * 1924 0 0 F 45 * * 2130 2115 2554 * * * * 2554 * * * * * * * 2322 * * 45 0 * * * * * * 1924 0 0 A 46 1554 * * 1122 * * * * * * * * * * * * 2322 * * * 46 0 * * * * * * 1924 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1924 0 0 A 48 887 * * * * * * * * * * * * 1122 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1924 0 0 K 49 * * * 2115 * * * * 379 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1924 0 0 A 50 887 * * * * * * * * * * * * * * 2130 * * * 2115 50 0 * * * * * * 1924 0 0 K 51 2554 * * * * * * * 2554 * * * * 1122 2322 * * * * * 51 0 * * * * * * 1924 0 0 E 52 * * * 374 * * * * * * * * * * 2130 * * * * * 52 0 * * * * * * 1924 0 0 E 53 * * * 887 * * * * 1122 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1924 0 0 A 54 887 * * * * * * * * 1122 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1924 0 0 A 55 2554 * * * * * * * 2322 * * * * * * 1122 2554 * * * 55 0 * * * * * * 1924 0 0 K 56 * * * * * * * * 322 * * * * * * * * * * 2322 56 0 * * * * * * 1924 0 0 F 57 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1924 0 0 T 58 * * * * * * * * * * * 1122 * * * * 887 * * * 58 0 * * * * * * 1924 0 0 K 59 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1924 0 0 E 60 * * * 887 * * * * * * * 1122 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1924 0 0 D 61 * * 1554 * * * * * 601 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1924 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1924 0 0 E 63 * * * 887 * * * 2130 * * * * * * * * 2115 * * * 63 0 * * * * * * 1924 0 0 K 64 * * * 1122 * * * * 1554 * * * * * 2322 * * * * * 64 0 * * * * * * 1924 0 0 N 65 * * 1215 * * * * * * * * 1554 * * * 2130 * * * * 65 0 * * * * * * 1924 0 0 F 66 * * * * 1554 * * * * 601 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1924 0 0 K 67 * * * * * * * * 887 * * * * * * * 1122 * * * 67 0 * * * * * * 1924 0 0 T 68 * * * * * * * * 1122 * * * * * * * 887 * * * 68 0 * * * * * * 1924 0 0 L 69 * * * * 2130 * * * * 374 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1924 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1924 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 379 * * * 2115 * * * * 71 0 * * * * * * 1924 0 0 Y 72 1122 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 887 72 0 * * * * * * 1924 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1924 0 0 Q 74 * * * 1122 * * * * * * * * * 887 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1924 0 0 V 75 * * * 1122 * * * * * * * * * * * * * 887 * * 75 0 * * * * * * 1924 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * * * * * 1924 0 0 V 77 2322 * * * * * * * * 1122 * * * * * * * 1554 * * 77 0 * * * * * * 1924 0 0 K 78 * * * * * * * * 887 * * 1122 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1924 0 0 T 79 * * 2115 * * * * * * * * 2130 * * * * 887 * * * 79 0 * * * * * * 1924 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1924 0 0 A 81 2554 * 2130 * * * * 2115 * * * * * * * * 1433 * * * 81 0 * * * * * * 1924 0 0 N 82 1122 * * * * * * * * * * 887 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1924 0 0 F 83 * * * * 887 * * * * 1122 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1924 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 1122 887 * * 84 0 * * * * * * 1924 0 0 Y 85 * * * * * * * * * * * 1122 * * * * * * * 887 85 0 * * * * * * 1924 0 0 I 86 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 86 887 1122 * 3000 193 * * 1924 1242 0 N 87 * * * * * * * * 2130 * * 2554 * * 2322 1318 * * * * 87 0 * * * * * * 1924 0 0 D 88 * * 667 1433 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1924 0 0 T 89 * * * * * * * 2322 * 1122 * * * * * * 1554 * * * 89 0 * * * * * * 1924 0 0 H 90 * * 2115 * * * 887 * * * * * * 2130 * * * * * * 90 0 * * * * * * 1924 0 0 A 91 379 * * * * * * * * * * * * * * 2115 * * * * 91 0 * * * * * * 1924 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1924 0 0 R 93 2130 * * * * 2554 * * * * * * * 2322 2554 * 2115 * * * 93 0 * * * * * * 1924 0 0 K 94 * * * * * * * * 322 * * * * * 2322 * * * * * 94 0 * * * * * * 1924 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1924 0 0 E 96 * * 2130 807 * * * * * * * 2322 * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1924 0 0 N 97 * * * * * * * * 1215 * * 1554 * * 2130 * * * * * 97 0 * * * * * * 1924 0 0 I 98 * * * * * * * 1554 * 601 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1924 0 0 E 99 * * * 887 * * * * 1122 * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1924 0 0 A 100 2554 * * * * * * 2322 * * * * * * * * 667 * * * 100 0 * * * * * * 1924 0 0 E 101 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1924 0 0 I 102 * * * * * * * 322 * * 2322 * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1924 0 0 K 103 * * * * * * * * 379 * * * * * * 2115 * * * * 103 0 * * * * * * 1924 0 0 T 104 * * * * * * * * * * * * * * * 1215 813 * * * 104 0 * * * * * * 1924 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1924 0 0 I 106 * * * * * * * 379 * 2115 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1924 0 0 A 107 807 * * * * * * * * * * * * * * 1223 * * * * 107 0 * * * * * * 1924 0 0 K 108 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1924 0 0 I 109 * * * * * * * 1554 * * * * * * * * * 601 * * 109 0 * * * * * * 1924 0 0 K 110 * * * * * * * * 1554 * * * * 601 * * * * * * 110 0 * * * * * * 1924 0 0 E 111 * * * 1554 * 2322 * * 2130 * * * * * * * * 2115 * * 111 0 * * * * * * 1924 0 0 Q 112 * * * * * * * * * * * * * 887 * 1122 * * * * 112 0 * * * * * * 1924 0 0 S 113 * * * * * * 2115 * * * * 2130 * * * 887 * * * * 113 0 * * * * * * 1924 0 0 N 114 * * * * * * * * 1122 * * 887 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1924 0 0 L 115 * * * * * * * * * 1554 * * * * * 2322 1122 * * * 115 887 1122 * 0 * * * 1924 1242 0 Y 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 116 0 * * * * * * 1924 0 0 E 117 * * * 887 * * * * * * * * * 1122 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1924 0 0 A 118 374 * * * * * * * * * * * * * * 2130 * * * * 118 0 * * * * * * 1924 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1924 0 0 K 120 * * * 2130 * * * * 374 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1924 0 0 A 121 887 * * 1122 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1924 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1924 0 0 V 123 * * * * * 1504 * * * * * * * * * * * 627 * * 123 0 * * * * * * 1742 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * 2272 765 2291 * * * 124 0 * * * * * * 1742 0 0 S 125 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 125 0 * * * * * * 1742 0 0 I 126 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1742 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1299 0 0 L 128 * * * * * * * * * 661 * * * 1444 * * * * * * 128 0 * * * * * * 1299 0 0 M 129 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1299 0 0 R 130 * * * * * * * * 1444 * * * * * 661 * * * * * 130 0 * * * * * * 1299 0 0 D 131 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1299 0 0 S 132 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 132 0 * * * * * * 1299 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1299 0 0 K 134 * * * 1444 * * * * 661 * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1299 0 0 E 135 * * * 1669 * * * 1444 1653 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1299 0 0 V 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 136 0 * * * * * * 1299 0 0 Q 137 * * * * * * * * 1653 * * * * 552 * * * * * * 137 0 * * * * * * 1299 0 0 G 138 * * * * * 661 * * * * * * * * * 1444 * * * * 138 0 * * * * * * 1299 0 0 I 139 1653 * * * * * * 1669 * * * * * * * 1444 * * * * 139 0 * * * * * * 1299 0 0 I 140 * * * * * * * 661 * * * * * * * * 1444 * * * 140 0 * * * * * * 1299 0 0 D 141 * * 552 1653 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * 0 * * * 1299 0 0 //