HHsearch 1.5 NAME c6lpaA_ FAM FILE c6lpaA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6lpaA_.a3m DATE Sat Aug 15 08:20:51 2020 LENG 101 match states, 101 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4201 0.6075 SEQ >ss_dssp CCEEEEEECSSSEEBCCBSSHHHHHHHHHHHHHTTTTTEEEEETTCGGGEESCCTTSEEEEEEECCEEEEEEETTCCCTTEEEEEEEBCCCEEEEEECEE C >sa_dssp EECDABCCDDEEBEBDCBEDDECADECBEDADEEDBEDABBACDEDCECBDEBEEECCABAACCEEBDBDCBCBDDDDEDBDAAAABBEBEDDEDECDAD E >ss_pred CEEEEEEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECEEEEEEECCCCEEEEEECCEEEEHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEEC C >ss_conf 9269997453201101674389899752132203200023644413022453166658999964220000354168862012358643850110000021 9 >Consensus nxxslaxaxdxeisaxgxxsxxxavxxxsxxaxxgfxxcrfvxxglqdxvigvexxdxvxxxxgxxlxayxxtfgxrpxxlrgwlxxsnxnyxleexxxi f >c6lpaA_ NQLTLAVASDQEISAHGYPTMSDAVEHFSSSASHGFKDCRFVAFGLQDIVIGVEPSDFVVALEGDILTAYIATFGARPRCLRGWLIPSNSNYVLEEFQVI F >UniRef50_P0C6F6(4-105:4128) Non-structural protein 11 n=99 Tax=root RepID=R1A_BC512 E=3e-17 s/c=0.88 id=51% cov=101% NHISLAFANDEEISAIGFGSVEEAVSYYSDAAVNGFDQCRFVSLGLQDAVVGVEDDDVVMLITGvTQLRAYLGTFGDRPLNLRGWLLFSNCNYFLEELDL VF # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1400 0 0 Q 2 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1400 0 0 L 3 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1400 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 4 0 * * * * * * 1400 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1400 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1400 0 0 V 7 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 7 0 * * * * * * 1400 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1400 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 9 0 * * * * * * 1400 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1400 0 0 Q 11 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1400 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1400 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1400 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1400 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1400 0 0 H 16 * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1400 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1400 0 0 Y 18 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 18 0 * * * * * * 1400 0 0 P 19 * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1400 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 20 0 * * * * * * 1400 0 0 M 21 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 21 0 * * * * * * 1400 0 0 S 22 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 22 0 * * * * * * 1400 0 0 D 23 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1400 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1400 0 0 V 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 25 0 * * * * * * 1400 0 0 E 26 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 26 0 * * * * * * 1400 0 0 H 27 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 27 0 * * * * * * 1400 0 0 F 28 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 28 0 * * * * * * 1400 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 29 0 * * * * * * 1400 0 0 S 30 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 30 0 * * * * * * 1400 0 0 S 31 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 31 0 * * * * * * 1400 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1400 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 33 0 * * * * * * 1400 0 0 H 34 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1400 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1400 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1400 0 0 K 37 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1400 0 0 D 38 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1400 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1400 0 0 R 40 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 40 0 * * * * * * 1400 0 0 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1400 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1400 0 0 A 43 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 43 0 * * * * * * 1400 0 0 F 44 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1400 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1400 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1400 0 0 Q 47 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1400 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1400 0 0 I 49 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1400 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1400 0 0 I 51 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 51 0 * * * * * * 1400 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1400 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1400 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1400 0 0 P 55 * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1400 0 0 S 56 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 56 0 * * * * * * 1400 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1400 0 0 F 58 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 58 0 * * * * * * 1400 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1400 0 0 V 60 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 60 0 * * * * * * 1400 0 0 A 61 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1400 0 0 L 62 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1400 0 0 E 63 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 63 0 * * * * * * 1400 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 1000 1000 * 0 * * * 1400 1000 0 D 65 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 65 0 * * * * * * 1400 0 0 I 66 * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1400 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1400 0 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 68 0 * * * * * * 1400 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1400 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1400 0 0 I 71 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1400 0 0 A 72 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1400 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1400 0 0 F 74 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1400 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1400 0 0 A 76 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1400 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 1400 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1400 0 0 R 79 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 79 0 * * * * * * 1400 0 0 C 80 * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1400 0 0 L 81 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1400 0 0 R 82 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 82 0 * * * * * * 1400 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1400 0 0 W 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 84 0 * * * * * * 1400 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1400 0 0 I 86 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1400 0 0 P 87 * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1400 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 1400 0 0 N 89 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1400 0 0 S 90 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 90 0 * * * * * * 1400 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1400 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 1400 0 0 V 93 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 93 0 * * * * * * 1400 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1400 0 0 E 95 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1400 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1400 0 0 F 97 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1400 0 0 Q 98 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 98 0 * * * * * * 1400 0 0 V 99 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 99 0 * * * * * * 1400 0 0 I 100 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 100 0 * * * * * * 1400 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * 0 * * * 1400 0 0 //