HHsearch 1.5 NAME c6lciA_ FAM FILE c6lciA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6lciA_.a3m DATE Sat Nov 28 08:34:50 2020 LENG 162 match states, 162 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3986 -1.2677 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCBCCCSSSBEEEETTTTEEEEESSSCCSTTCBEEEECCCSSCCGGGCEEECTTSBEEETTTCCEEEESSSSCCTTCBEEEECCCCTTSCTTS CSSBEEECTTSCEEESSCTTEEEEECCCTTCCSTTCBEEEEECCGGGCCCGGGCEEEECSCC >sa_dssp EEEEEBEEDDEBCEEDABACADCCCBAABADEDCEEDDBDABABDDDEEECCBABADCCEDBBABADDCCBAABADEDEBEDDBDACACEDCDEEDEDEE BDBCBACAEEBBAAACDDCBBAAAAEECEEDEEDCBDABACDCDEEDDEEDDADBDCCECEE >ss_pred CCHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCC CHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHCCHHHHCCCEEEECC >ss_conf 9323332200487615999747970799981665336982899986321046675310777315733676177640688410023432202567521125 34430778530489727961889722543222147057657630221220220111322019 >Consensus maaamfeksekfpegwffiknnsngyvlmvdnesqesgspivlatlrtkdyasqlwrhdpsgylvnkksgqvmdiakgtpkagvdivqqtqagsnvkddl nfqkfglspyghiylankpslilgikesffarreglhvhlqlvdkrhldrkeqrwdfvlpvv >c6lciA_ MAAAMFEKSEKFPEGWFFIKNNSNGYVLMVDNESQESGSPIVLATLRTKDYASQLWRHDPSGYLVNKKSGQVMDIAKGTPKAGVDIVQQTQAGSNVKDDL NFQKFGLSPYGHIYLANKPSLILGIKESFFARREGLHVHLQLVDKRHLDRKEQRWDFVLPVV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 M 5 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 F 6 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 F 12 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 W 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 F 17 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 M 29 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 D 31 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 N 32 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 35 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 G 38 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 P 40 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 D 50 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1000 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 54 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 W 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 R 57 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 H 58 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 G 62 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 63 0 * * * * * * 1000 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 N 66 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 71 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 M 73 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 D 74 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 I 75 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 K 81 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 D 85 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 I 86 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 88 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 89 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 91 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 A 92 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 S 94 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 V 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 K 97 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 D 99 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 N 101 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 F 102 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 103 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 F 105 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 G 106 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 S 108 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 P 109 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 110 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 110 0 * * * * * * 1000 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 H 112 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 114 0 * * * * * * 1000 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 A 116 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 N 117 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 K 118 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 L 123 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 K 126 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 E 127 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 S 128 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 F 129 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 A 131 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 R 132 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 R 133 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 E 134 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 G 135 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 H 137 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 V 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 H 139 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 141 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 V 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 D 144 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 K 145 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 R 146 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 H 147 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 L 148 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 D 149 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 R 150 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 K 151 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 E 152 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 153 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 R 154 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 W 155 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 D 156 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 F 157 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 V 158 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 L 159 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 P 160 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 V 161 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 V 162 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 162 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //