HHsearch 1.5 NAME c6l7qA_ FAM FILE c6l7qA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6l7qA_.a3m DATE Sat Nov 7 08:30:06 2020 LENG 145 match states, 145 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3597 -3.2976 SEQ >ss_dssp CEEECHHHHHHHHHTCSSCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEETTEEEEECSSEEEEEEECCCEEEEHHHHHHHTTTCCCEEEEEGGGTEEEEECHHHHGG GSCSSEEEEEEETTTTEEEEESSCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHC >sa_dssp CABBCEDACDDABEDCEEEECCDDBACCABDACEDCCDBEDEEDCBABABCECAABACECECDEBCCDDACDDAEECCDABAABCDDECADECEADDBAE DBDEDDBCBBCCDEDDBAAAADEEABCADCBCEBDEEBDDDDEEE >ss_pred CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEECCEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHCHHHHHH HCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEC >ss_conf 9123024689999998720108999999999862010366317589997696128998512425289999999616772576701540022214588997 389972899993750499982788779998413564103788859 >Consensus xMLLTrHAkERlxKRLaKrRxlxxvYsxLwxFLxrsxRIevnexvvxFTDGxKsLVcxkLdcerLxlxeIxxrVxgixxYeCvFxdxrlarxTxPxKFlx xiPxGxYxFYxNxEKrxLYiGxxxPLLAiTxRPAKRxERlfyxxx >c6l7qA_ MMLLTRHAKERIAKRLAKKRSLSHIYSSLWAFLERAVRIEIAEGVVAFTDGRKTLVCVPLDCERLSRGEILEKVRGVGVYECIFPEGRLAKLTRPEKFLE SVPPGEYYFYMNDEKKVLYVGKRRPLLAITFRPAKRDERLFYIWA >UniRef50_B7R4Q2(1-139:165) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Thermococcus sp. AM4 RepID=B7R4Q2_9EURY E=9e-43 s/c=1.25 id=61% cov=96% -MLLTRHAEERLVKRLAKRRKLERVYSELWSFLDRSRRIEVNERVVIFTDGRKSLVCAKLECERLHLDEIRERVKGLnGTYRCVFPDKRLARETSPIKFL SEIPNGIYCFYLNREKRSLYIGREEPLLAITLRPAKREER------ >UniRef50_C5A609(27-165:191) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Thermococcus RepID=C5A609_THEGJ E=4e-42 s/c=1.24 id=60% cov=96% -MLLTRHAEERLVKRLTKRRNIKRVYLELWAFLDRSRRIDVNERVVIFTDGRKSLVCAKLDCERLSLDEIRERVEGLeGTYRCVFPDRRLARETVPVKFL SEIPDGVYCFYLNREKRSLYIGSEEPLLAITLRPAKREER------ >UniRef50_B6YWU5(1-139:141) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Thermococcus RepID=B6YWU5_THEON E=1e-40 s/c=1.20 id=60% cov=96% -MLLTRHAKERLVKRLAKRRKLERVYSALWEFLERSKRIDVNDKVVIFTDGQKSLVCVRLECERLPLEEIRHRVEKIKrPYECVFLDGRLARETVPRKFV ELIPEGEYCFYINQEKRSLYIGSEGPLLAITLRPAKRKER------ >UniRef50_O59458(15-156:158) Putative uncharacterized protein PH1794 n=4 Tax=Pyrococcus RepID=O59458_PYRHO E=9e-50 s/c=1.39 id=62% cov=97% -MLLTKHAKERIAKRLAKKRKIDKIYSALFSFLKNSIRIEI-EGTIFFTDGSKTLVATKLDGKLLDLEDIIRRVRGIeESYECVFWDKKIVKITKPRKFL QEVPPGKYYFYINKEKKVLYIGSHEPLLALTFRPAKRWERaLFY--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 M 2 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1591 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1591 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1591 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1591 0 0 R 6 * * * * * * * * 2089 * * * * * 386 * * * * * 6 0 * * * * * * 1591 0 0 H 7 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1591 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1591 0 0 K 9 * * * 1501 * * * * 629 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1591 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1591 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1591 0 0 I 12 * * * * * * * 1142 * 871 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1591 0 0 A 13 1142 * * * * * * * * * * * * * * * * 871 * * 13 0 * * * * * * 1591 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1591 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1591 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1591 0 0 A 17 285 * * * * * * * * * * * * * * * 2480 * * * 17 0 * * * * * * 1591 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1591 0 0 K 19 * * * * * * * * 1142 * * * * * 871 * * * * * 19 0 * * * * * * 1591 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 20 0 * * * * * * 1591 0 0 S 21 * * * * * * * * 731 * * 2480 * * * 2196 * * * * 21 0 * * * * * * 1591 0 0 L 22 * * * * * * * 1271 * 772 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1591 0 0 S 23 * * 2089 1444 * * * * 2480 * * * * * * 2196 * * * * 23 0 * * * * * * 1591 0 0 H 24 * * * * * * 2196 * 2089 * * * * * 871 * * * * * 24 0 * * * * * * 1591 0 0 I 25 * * * * * * * 1142 * * * * * * * * * 871 * * 25 0 * * * * * * 1591 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1591 0 0 S 27 * * * * * * * * * 2480 * * * * * 285 * * * * 27 0 * * * * * * 1591 0 0 S 28 1223 * * 1501 * * * * * * * * * * * 2196 * * * * 28 0 * * * * * * 1591 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1591 0 0 W 30 * * * * 2089 * * * * * * * * * * * * * 386 * 30 0 * * * * * * 1591 0 0 A 31 1331 * * 2370 * * * * * * * * * * * 1289 * * * * 31 0 * * * * * * 1591 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1591 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1591 0 0 E 34 * * 1501 1281 * * * * 2089 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1591 0 0 R 35 * * * * * * * * * * * 2089 * * 386 * * * * * 35 0 * * * * * * 1591 0 0 A 36 2196 * * * * * * * * * * * * * * 355 * * * * 36 0 * * * * * * 1591 0 0 V 37 * * * * * * * 2089 2370 * * * * * 1501 * * 2196 * * 37 0 * * * * * * 1591 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1591 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1591 0 0 E 40 * * 1424 673 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1591 0 0 I 41 * * * * * * * 1142 * * * * * * * * * 871 * * 41 386 * 2089 * * * * 1591 0 0 A 42 1760 * * * * * * * * * * 505 * * * * * * * * 42 0 * * * * 0 * 1434 0 1000 E 43 * * 2370 310 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1591 0 0 G 44 * * * * * 1142 * * 2370 * * * * * 1501 * * * * * 44 0 * * * * * * 1591 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 2089 386 * * 45 0 * * * * * * 1591 0 0 V 46 * * * * * * * 2089 * * * * * * * * * 386 * * 46 0 * * * * * * 1591 0 0 A 47 2196 * * * 2089 * * 871 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1591 0 0 F 48 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1591 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1591 0 0 D 50 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1591 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1591 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * 2370 807 2089 * * * * 52 0 * * * * * * 1591 0 0 K 53 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1591 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * 871 1142 * * * 54 0 * * * * * * 1591 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1591 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1591 0 0 C 57 2089 386 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1591 0 0 V 58 1501 * * * * * * * * * * * * * * * 2089 1281 * * 58 0 * * * * * * 1591 0 0 P 59 * * * * * * * * 765 * * * 2196 * 2370 * * * * * 59 0 * * * * * * 1591 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1591 0 0 D 61 * * 661 1444 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1591 0 0 C 62 * 386 * * * 2089 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1591 0 0 E 63 * * * 386 * * * * 2089 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1591 0 0 R 64 * * * * * * * * * 2089 * * * * 386 * * * * * 64 0 * * * * * * 1591 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1591 0 0 S 66 * * 2089 * * * 2522 * * * * * 2370 * * 1331 * * * * 66 0 * * * * * * 1591 0 0 R 67 * * * * * * * * * 355 * * * * 2196 * * * * * 67 0 * * * * * * 1591 0 0 G 68 * * 1501 1223 * 2196 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1591 0 0 E 69 * * 2089 386 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1591 0 0 I 70 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1591 0 0 L 71 * * * * * * * 2089 * 2196 * * * * 871 * * * * * 71 0 * * * * * * 1591 0 0 E 72 * * * 807 * * 2370 * * * * * * * 2089 * * * * * 72 0 * * * * * * 1591 0 0 K 73 * * * * * * * * 2196 * * * * * 355 * * * * * 73 0 * * * * * * 1591 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1591 0 0 R 75 * * * 1424 * * * * 2522 * * * * * 1142 * * * * * 75 0 * * * * * * 1591 0 0 G 76 * * * * * 310 * * 2370 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1591 0 0 V 77 * * * * * * * 1223 * 1501 * * * * * * * 2196 * * 77 1281 765 * 0 * * * 1591 1398 0 G 78 * * * 2089 * 807 * * 2370 * * * * * * * * * * * 78 310 2370 * 0 * * * 1591 1000 0 V 79 * * * * * * * * * * * * 2370 * * 2089 1501 2196 * * 79 0 * * * * * * 1591 0 0 Y 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 80 0 * * * * * * 1591 0 0 E 81 * * * 629 * * * * * * * * * * 1501 * * * * * 81 0 * * * * * * 1591 0 0 C 82 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1591 0 0 I 83 * * * * * * * 2196 * * * * * * * * * 355 * * 83 0 * * * * * * 1591 0 0 F 84 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1591 0 0 P 85 * * * * * * * * * 2370 * * 807 * * * * * 2089 * 85 0 * * * * * * 1591 0 0 E 86 * * 355 2196 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1591 0 0 G 87 * * * * * 1281 * * 1289 * * * * * 2480 * * * * * 87 0 * * * * * * 1591 0 0 R 88 * * * * * * * * 2089 * * * * * 386 * * * * * 88 0 * * * * * * 1591 0 0 L 89 * * * * * * * 2089 * 386 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1591 0 0 A 90 386 * * * * * * * * * * * * * * * * 2089 * * 90 0 * * * * * * 1591 0 0 K 91 * * * * * * * * 1142 * * * * * 871 * * * * * 91 0 * * * * * * 1591 0 0 L 92 * * * 871 * * * 2089 * 2196 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1591 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 93 0 * * * * * * 1591 0 0 R 94 * * * * * * * * 2089 * * * * * 2196 2522 * 1424 * * 94 0 * * * * * * 1591 0 0 P 95 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1591 0 0 E 96 * * * 2196 * * * 2522 * * * * * * 1223 * * 2480 * * 96 0 * * * * * * 1591 0 0 K 97 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1591 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1591 0 0 L 99 * * * * * * * * * 310 * * * * * * * 2370 * * 99 0 * * * * * * 1591 0 0 E 100 * * * 1281 * * * * * * * * * 2089 * 1501 * * * * 100 0 * * * * * * 1591 0 0 S 101 * * * 765 * * * * * 2370 * * * * * 2196 * * * * 101 0 * * * * * * 1591 0 0 V 102 * * * * * * * 871 * * * * * * * * * 1142 * * 102 0 * * * * * * 1591 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1591 0 0 P 104 * * 2480 2370 * * * * * * * 2522 1142 * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1591 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1591 0 0 E 106 * * * 1281 * * * 2522 2089 * * * * * * * * 2480 * * 106 0 * * * * * * 1591 0 0 Y 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 107 0 * * * * * * 1591 0 0 Y 108 * 871 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1142 108 0 * * * * * * 1591 0 0 F 109 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1591 0 0 Y 110 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 110 0 * * * * * * 1591 0 0 M 111 * * * * * * * 1223 * 1501 2196 * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1591 0 0 N 112 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1591 0 0 D 113 * * 2196 * * * * * 2089 * * * * 2370 1501 * * * * * 113 0 * * * * * * 1591 0 0 E 114 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1591 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1591 0 0 K 116 * * * * * * * * 1142 * * * * * 871 * * * * * 116 0 * * * * * * 1591 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * 871 * 1142 * * 117 0 * * * * * * 1591 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1591 0 0 Y 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 119 0 * * * * * * 1591 0 0 V 120 * * * * * * * 355 * * * * * * * * * 2196 * * 120 0 * * * * * * 1591 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1591 0 0 K 122 * * * * * * * * 2196 * * * * * 2522 719 * * * * 122 0 * * * * * * 1591 0 0 R 123 * * * 871 * * 2089 * * * * * * * 2196 * * * * * 123 0 * * * * * * 1591 0 0 R 124 * * * 765 * 2370 * * * * * * * * 2196 * * * * * 124 0 * * * * * * 1591 0 0 P 125 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1591 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1591 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1591 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1591 0 0 I 129 * * * * * * * 386 * 2089 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1591 0 0 T 130 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 130 0 * * * * * * 1591 0 0 F 131 * * * * 1142 * * * * 871 * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1591 0 0 R 132 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 132 0 * * * * * * 1591 0 0 P 133 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1591 0 0 A 134 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1591 0 0 K 135 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1591 0 0 R 136 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 136 0 * * * * * * 1591 0 0 D 137 * * 2196 1501 * * * * 2370 * * * * * * * * * 2089 * 137 0 * * * * * * 1591 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1591 0 0 R 139 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 139 1055 947 * 0 * * * 1591 1000 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1298 0 0 F 141 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1298 0 0 Y 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 142 0 * * * * * * 1298 0 0 I 143 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 W 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 A 145 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //