HHsearch 1.5 NAME c6knyA_ FAM FILE c6knyA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6knyA_.a3m DATE Sat Apr 18 08:22:36 2020 LENG 173 match states, 173 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4199 -0.3205 SEQ >ss_dssp CCHHHHHTGGGTGGGCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCEECHHHHTTTCGGGSSSCCCTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTCSEEEEEECC CCGGGCCCSSEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHTCSSSCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCC >sa_dssp EDECCEEDEECCECBEDEECDCEDACECADDCCEDADDCADEDEBECCEDAABACADDBCECDBDEEAACCABBAADAACCAACBAAEBEBCDACCBDBC DBEDBEEEDDDCDBCACAAACADCCABEEADECBEDBEECCBDDEDDEDEEDDEDCBCACACACABBBCDDCE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCC >ss_conf 9730221111210243244672677777899999897511006258851356023587513586300010013037879999998985258889998466 6864256788876534778527789999987554110321245211576113303899999864465168889 >Consensus vgsletaykpflassalvpttptafqnelktfrdslissckkknilitdtsswlgfqvystqapsvqaastlgfelkainslvnklaecglskfikvyrp qlpietdqapwtpmpleiafqgdresvlkamnaitgmqdylftvnsirirnerkeqvfvqvslnlvhfnqpka >c6knyA_ VGSLETAYKPFLASSALVPTTPTAFQNELKTFRDSLISSCKKKNILITDTSSWLGFQVYSTQAPSVQAASTLGFELKAINSLVNKLAECGLSKFIKVYRP QLPIETDQAPWTPMPLEIAFQGDRESVLKAMNAITGMQDYLFTVNSIRIRNERKEQVFVQVSLNLVHFNQPKA # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 8 0 * * * * * * 1000 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 F 11 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 T 31 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 I 37 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 C 40 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 K 42 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 N 44 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 D 49 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 W 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 F 56 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 59 0 * * * * * * 1000 0 0 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 62 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 V 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 F 74 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 I 79 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 S 81 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 N 84 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 A 87 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 C 89 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 K 93 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 F 94 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 I 95 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 V 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 98 0 * * * * * * 1000 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 P 100 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 101 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 L 102 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 I 104 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 D 107 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 108 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 P 110 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 W 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 M 114 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 P 115 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 E 117 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 I 118 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 F 120 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 121 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 D 123 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 R 124 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 E 125 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 S 126 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 L 128 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 K 129 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 A 130 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 M 131 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 N 132 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 A 133 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 I 134 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 T 135 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 G 136 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 M 137 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 138 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 D 139 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 140 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 140 0 * * * * * * 1000 0 0 L 141 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 F 142 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 T 143 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 V 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 S 146 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 I 147 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 R 148 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 I 149 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 R 150 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 N 151 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 E 152 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 R 153 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 K 154 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 E 155 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 156 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 V 157 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 F 158 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 V 159 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 160 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 V 161 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 S 162 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 L 163 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 N 164 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 L 165 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 V 166 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 H 167 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 F 168 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 N 169 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 170 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 P 171 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 K 172 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 A 173 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 173 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //