HHsearch 1.5 NAME c5zhgA_ FAM FILE c5zhgA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5zhgA_.a3m DATE Sat Apr 14 08:22:03 2018 LENG 162 match states, 162 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3907 -2.2867 SEQ >ss_dssp CEEEEEECCSEECGGGSSSSCEEEEEECCSSCEEEEEESCSSCCTTSCEEEEEEECTTCEEECSGGGGSCCGGGEEECSSSEEEEEEEETTEEEEEEEEE CCSSEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEETTTEEEEEEEEEEEECSSTTCCEEECSCEEEEEC >sa_dssp EEEDDDCEEEDBDBDEBCEDDBDACAEDCEECCCAABABCEECDEECBABAACAADDECEADADBAEEBECECCCBEBECCABAAABBCEECDADCBCAC BDEEDCBABADCDDEDCACABADBDCEDEEEDEDECECDCCACCBDEECCACBDCDBCCBCE >ss_pred CCCCCCCCCEEEEEHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEE EEECCCEEEEEECCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECC >ss_conf 9002687530687210105633589815766054221077544576025898852788679999974105775235578838999983885404456799 87100218996407410121112211265774151234533766689702455455564139 >Consensus meitgphtntviewsnlintntwllyqkplnsvrllkhgpdtynsnlaafelwygksgttitsvyyntinnqnkthdansdclilfwnegstqlekqvvt fnwnvggilikpinssrmricmsgmenfnndsfnwenwnhefprsnpgininmyteyflass >c5zhgA_ MEITGPHTNTVIEWSNLINTNTWLLYQKPLNSVRLLKHGPDTYNSNLAAFELWYGKSGTTITSVYYNTINNQNKTHDANSDCLILFWNEGSTQLEKQVVT FNWNVGGILIKPINSSRMRICMSGMENFNNDSFNWENWNHEFPRSNPGININMYTEYFLASS # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 H 7 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 N 9 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 I 12 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 W 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 N 19 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 W 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 V 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 H 38 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 P 40 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 D 41 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 43 0 * * * * * * 1000 0 0 N 44 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 F 50 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 W 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 T 59 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 I 61 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 S 63 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 65 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * * * * * 1000 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 I 69 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 72 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 N 73 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 K 74 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 H 76 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 D 77 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 N 79 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 D 81 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 C 82 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 F 86 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 W 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 N 88 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 E 89 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 E 95 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 97 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 V 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 N 102 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 W 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 N 104 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 V 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 G 106 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 I 108 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 I 110 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 P 112 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 S 116 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 R 117 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 M 118 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 R 119 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 I 120 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 C 121 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 M 122 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 M 125 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 E 126 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 N 127 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 F 128 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 N 129 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 N 130 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 D 131 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 S 132 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 F 133 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 N 134 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 W 135 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 N 137 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 W 138 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 N 139 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 H 140 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 E 141 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 F 142 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 P 143 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 R 144 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 S 145 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 N 146 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 P 147 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 G 148 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 I 149 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 N 150 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 I 151 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 N 152 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 M 153 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 154 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 154 0 * * * * * * 1000 0 0 T 155 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 E 156 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 157 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 157 0 * * * * * * 1000 0 0 F 158 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 L 159 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 A 160 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 S 161 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 S 162 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 162 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //