HHsearch 1.5 NAME c5nkzC_ FAM FILE c5nkzC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5nkzC_.a3m DATE Sat Jan 27 08:18:05 2018 LENG 105 match states, 105 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4281 0.1621 SEQ >ss_dssp CCCEEEEECTTGGGGCCHHHHHHCTTEEEEECTTSCHHHHHHHTTCGGGSTTEEECSSHHHHHHHHHHHCCSEEECCGGGSSCCSCCCSCSCSSSEECGG GGGGC >sa_dssp EDCBAABAAEEABEDBDCCCAEECEDACAAABDDBDCEEABDECEADECDEBACCBEDBDCABDCBCEDDBEBAABBDECBECEEDEECEEECDEECDAD DBEEC >ss_pred CCEEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH HHHCC >ss_conf 9627999871321023266420389748998226788786654202336436788871156999999730276569851112030010101288886557 76139 >Consensus gqsvslvltqkdldffsaaylneypnltvilhpsvdkseflsrfnvqrnshqviqvrteesifhvlkqlssninlitlgnlemsanevetfhldkfltnv hevdr >c5nkzC_ GQSVSLVLTQKDLDFFSAAYLNEYPNLTVILHPSVDKSEFLSRFNVQRNSHQVIQVRTEESIFHVLKQLSSNINLITLGNLEMSANEVETFHLDKFLTNV HEVDR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 T 9 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 F 16 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1000 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1000 0 0 P 25 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 N 26 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 V 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 I 30 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 H 32 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 P 33 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 V 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 D 36 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 F 40 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 F 44 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 47 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 H 51 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 I 54 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 R 57 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 T 58 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 I 62 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 H 64 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 68 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 N 74 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 I 76 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 G 79 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 L 81 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 E 82 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 M 83 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 S 84 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 N 86 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 E 89 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 H 92 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 L 93 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 D 94 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 F 96 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 H 101 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //