HHsearch 1.5 NAME c5gwmA_ FAM FILE c5gwmA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5gwmA_.a3m DATE Sat Sep 16 08:27:59 2017 LENG 53 match states, 53 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4674 1.9048 SEQ >ss_dssp CCSSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCSSCCCCC >sa_dssp EDEEEDEDDDDEDDEEDDDDDDEDEEEDDDDEEDEEEEDECEEEDDCEDEEEE >ss_pred CCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >ss_conf 95100544599999983254899999984489999999999742001546579 >Consensus mxsxiskedeeryqklvtenxxlqxlixqkeekirilxqrlxexgdakgteln >c5gwmA_ MDSAISKEDEERYQKLVTENEQLQRLITQKEEKIRVLRQRLVERGDAKGTELN >UniRef50_Q172J2(722-764:803) Gaba-b receptor n=6 Tax=Neoptera RepID=Q172J2_AEDAE E=1e-16 s/c=2.03 id=73% cov=83% -ETGISKEDEERYQKLVTENDDLQKLIAQKEEKIRILKQRLTEK--------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 D 2 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1194 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 3 0 * * * * * * 1194 0 0 A 4 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1194 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1194 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1194 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1194 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1194 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1194 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1194 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1194 0 0 R 12 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 12 0 * * * * * * 1194 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1194 0 0 Q 14 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 14 0 * * * * * * 1194 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1194 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1194 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1194 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1194 0 0 E 19 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1194 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1194 0 0 E 21 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1194 0 0 Q 22 * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1194 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1194 0 0 Q 24 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1194 0 0 R 25 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 25 0 * * * * * * 1194 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1194 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1194 0 0 T 28 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 28 0 * * * * * * 1194 0 0 Q 29 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1194 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1194 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1194 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1194 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1194 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1194 0 0 R 35 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 35 0 * * * * * * 1194 0 0 V 36 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 36 0 * * * * * * 1194 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1194 0 0 R 38 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 38 0 * * * * * * 1194 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1194 0 0 R 40 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 40 0 * * * * * * 1194 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1194 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 42 0 * * * * * * 1194 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1194 0 0 R 44 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 44 0 * * * * * * 1194 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 D 46 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 A 47 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 53 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //