HHsearch 1.5 NAME c5ezuA_ FAM FILE c5ezuA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ezuA_.a3m DATE Thu Feb 9 12:44:51 2017 LENG 76 match states, 76 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4436 0.8378 SEQ >ss_dssp CEEEEEEETTSCCEEEEEEETTTTEEEEEEEETTEEEEEEECTTCCCEEEEEEETTTTEEEEEEECCSSCEEEEEC >sa_dssp EECDCDBDCEDECEDEEDDBEEDDCCABDCDBEDCCCCBCACDEEECDDDEDDCEEEDBCCCEBEBBEDBEEDEDE >ss_pred CEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEECHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC >ss_conf 9166764245415589999604654899540466058999520120100012045576399986056434544029 >Consensus mafdisvnasktinalvyfstqqnklvirnevndthytvefdrdkvvdtfisynrhndtieirgvlpeetnigcav >c5ezuA_ MAFDISVNASKTINALVYFSTQQNKLVIRNEVNDTHYTVEFDRDKVVDTFISYNRHNDTIEIRGVLPEETNIGCAV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 F 3 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 T 12 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 N 14 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 18 0 * * * * * * 1000 0 0 F 19 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 23 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 R 29 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 H 36 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 37 0 * * * * * * 1000 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 D 42 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 D 44 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 V 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 F 50 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 53 0 * * * * * * 1000 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 H 56 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 T 59 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 I 62 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 P 67 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 C 74 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //