HHsearch 1.5
NAME  c4tq1B_
FAM   
FILE  c4tq1B_
COM   /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4tq1B_.a3m 
DATE  Sat Mar 14 08:19:18 2015
LENG  32 match states, 32 columns in multiple alignment
FILT  2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100)
NEFF  1.1 
EVD   0.4683  2.5397 
SEQ
>ss_dssp
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTSCCSCC
>sa_dssp
EDDEEDDDDEDEDEDDDDEEDEEDEEEEEEEE
>ss_pred
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>ss_conf
94358999999999999999997798997419
>Consensus
qtaawrkqifxqlxertkrexenfrhyeqaie
>c4tq1B_
QTAAWRKQIFQQLTERTKRELENFRHYEQAVE
>UniRef50_Q4S4I1(631-662:1251) Chromosome 2 SCAF14738, whole genome shotgun sequence. (Fragment) n=6 Tax=Chordata RepID=Q4S4I1_TETNG  E=2e-12 s/c=2.30 id=85% cov=103%
QTAAWRKQIFEQLSERTKREMENFRHYEQAIE
#
NULL   3706	5728	4211	4064	4839	3729	4763	4308	4069	3323	5509	4640	4464	4937	4285	4423	3815	3783	6325	4665	
HMM    A	C	D	E	F	G	H	I	K	L	M	N	P	Q	R	S	T	V	W	Y	
       M->M	M->I	M->D	I->M	I->I	D->M	D->D	Neff	Neff_I	Neff_D
       0	*	*	0	*	0	*	*	*	*	
Q 1    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	1
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

T 2    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	2
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

A 3    0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	3
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

A 4    0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	4
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

W 5    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	5
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

R 6    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	6
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

K 7    *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	7
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

Q 8    *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	8
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

I 9    *	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	9
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

F 10   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	10
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

Q 11   *	*	*	1000	*	*	*	*	*	*	*	*	*	1000	*	*	*	*	*	*	11
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

Q 12   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	12
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

L 13   *	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	13
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

T 14   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	1000	1000	*	*	*	14
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

E 15   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	15
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

R 16   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	16
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

T 17   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	17
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

K 18   *	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	18
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

R 19   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	19
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

E 20   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	20
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

L 21   *	*	*	*	*	*	*	*	*	1000	1000	*	*	*	*	*	*	*	*	*	21
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

E 22   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	22
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

N 23   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	23
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

F 24   *	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	24
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

R 25   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	25
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

H 26   *	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	26
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

Y 27   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	27
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

E 28   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	28
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

Q 29   *	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	0	*	*	*	*	*	*	29
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

A 30   0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	30
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

V 31   *	*	*	*	*	*	*	1000	*	*	*	*	*	*	*	*	*	1000	*	*	31
       0	*	*	*	*	*	*	1091	0	0	

E 32   *	*	*	0	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	*	32
       0	*	*	0	*	*	*	1091	0	0	

//