HHsearch 1.5 NAME c4hwmA_ FAM FILE c4hwmA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4hwmA_.a3m DATE Thu Jan 10 12:54:25 2013 LENG 117 match states, 117 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.4223 0.3743 SEQ >ss_dssp CCGGGCCCCCCCTTTCEEEECCSCCTTSSSTTCEEEEEECTTSEEEEEEESSSEEEEEEEEEEETTEEEEEETTCCEEEEEEETTEEEETTEEEEEESSC CHHHHHHHHHHHTTSCC >sa_dssp EDCEECEDBECDEDBDCDACBDDECEDCECEEBCAAABBCEDACABAACBDEEDEDCDABACEDEEDBBAAADEDDDCEBEDEDEDADACEBDACDCEEB BDDACEBCEECDEEDEE >ss_pred CCHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEECCEEEEHHHCC CHHHHHHHHHHHCCCCC >ss_conf 9366764086732101222025863345780111357772469803068788887326400035340673021000211110487766463000024048 78999999864302799 >Consensus xnYxxvVktPAPaglxGxWqtxgPQxxLVSpxAxASLiitxeGdTlDCRqWQRviaxPGKLTxxdxxxxNvnxxxxvxxlexdgnxlhYdxltLqrvxxp TxeCqxxlxkxxxxxxx >c4hwmA_ DRYEDVVKAPAPAGLAGFWQTKGPQSAXXSPDAIASLIVTKEGDTFDCRQWQRVIAQPGKLXNRDSEIYNVTASLDIYPVEREGNTISYDRXTLSRVERL TPECEKAWAKARATGPV >UniRef50_Q06399(20-129:141) Uncharacterized lipoprotein yedD n=102 Tax=Enterobacteriaceae RepID=YEDD_SALTY E=2e-34 s/c=1.33 id=61% cov=95% ENYNDVVKTPAPAGLEGYWQSKGPQRKLVSPEAIASLVVTKEGDTLDCRQWQRVIALPGKLTMLSDDLTNVTVKRELYEIERDGNTLEYDGMTLQRVARP TPECAAALEK------- >UniRef50_Q2NUW7(23-125:159) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Sodalis glossinidius str. 'morsitans' RepID=Q2NUW7_SODGM E=2e-20 s/c=0.97 id=41% cov=89% --YVKVVAAPAPQGYSGIWTSTSPQKALVSPEAVASLIISRSGNTLDCRSWQRTIIRPGKLTTRDARLYNINEKNEVSALRLDHDVLHYGGLTLQRSTSP TEQCQ------------ >UniRef50_B2VES4(22-128:133) Putative outer membrane lipoprotein n=1 Tax=Erwinia tasmaniensis RepID=B2VES4_ERWT9 E=1e-42 s/c=1.62 id=50% cov=92% -NYASAVKTPAPAELVGNWQTLGPQSGLVSNQAKASLIITAEGDTLDCRQWQRVLAKPGKLTRADDRWVNVNTQQRVMPLELDGAELHYDRLILQKVAQP TAECQQRL--------- >UniRef50_D2T9L9(22-129:141) Uncharacterized lipoprotein yedD n=3 Tax=Enterobacteriaceae RepID=D2T9L9_ERWPY E=5e-42 s/c=1.58 id=48% cov=93% -NYSGAVKTPAPAELVGNWQTFGPQSGLVSDQAKASLLITAQGETLDCRQWQRVLAKPGKLTRADDQWVNVNTQQRVMPLELKGNELHYDRLILQKVAQP TAECQQQLD-------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 1053 948 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1270 0 0 R 2 * * * * * * * * * * * 447 * * 1909 * * * * * 2 0 * * * * * * 1567 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1787 0 0 E 4 2548 * * 2328 * * * * * * * 2325 * * * 2485 * 1990 * * 4 0 * * * * * * 1787 0 0 D 5 * * 1327 * * 2485 * * 1990 * * * * * * 2548 * * * * 5 0 * * * * * * 1787 0 0 V 6 1516 * * * * * * * * * * * * * * * * 621 * * 6 0 * * * * * * 1787 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1787 0 0 K 8 1990 * * * * * * * 418 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1787 0 0 A 9 1149 * * * * * * * * * * * * * * * 865 * * * 9 0 * * * * * * 1787 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1787 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1787 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1787 0 0 A 13 418 * * * * * * * * * * * * 1990 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1787 0 0 G 14 * * * 1516 * 621 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1787 0 0 L 15 * * * * * * * * * 418 * * * * * * * * * 1990 15 0 * * * * * * 1787 0 0 A 16 2328 * * 2325 * * * * * * * * * * * 1990 * 1516 * * 16 0 * * * * * * 1787 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1787 0 0 F 18 * * * * 2328 * * 1990 * * * 1516 * * * * * * * 2325 18 0 * * * * * * 1787 0 0 W 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 19 0 * * * * * * 1787 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 418 * * 1990 * * * 20 0 * * * * * * 1787 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * 1148 866 * * * 21 0 * * * * * * 1787 0 0 K 22 * * * * 2485 * * * 1327 2548 * * * * * * 1990 * * * 22 0 * * * * * * 1787 0 0 G 23 * * * * * 418 * * * * * * * * * 1990 * * * * 23 0 * * * * * * 1787 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1787 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1787 0 0 S 26 * * * * * * * * 1990 * * * * * 2325 866 * * * * 26 0 * * * * * * 1787 0 0 A 27 1149 * * * * 1516 * * 2325 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1787 0 0 X 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1671 0 0 X 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1671 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1787 0 0 P 31 * * 2485 * * * * * * * * 2548 621 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1787 0 0 D 32 * * 2328 1148 * * * * * * * * * 1516 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1787 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1787 0 0 I 34 * * * * * * * 1327 1516 * * * * * * * * 1990 * * 34 0 * * * * * * 1787 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1787 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1787 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1787 0 0 I 38 * * * * * * * 685 * 2485 * * * * * * * 2325 * * 38 0 * * * * * * 1787 0 0 V 39 * * * * * * * 734 * * * * * * * * * 1327 * * 39 0 * * * * * * 1787 0 0 T 40 * * * * * * * * * * * * * * * 1990 418 * * * 40 0 * * * * * * 1787 0 0 K 41 1516 * * * * * * * 1327 * * * * * 1990 * * * * * 41 0 * * * * * * 1787 0 0 E 42 * * * 812 * * * * * * * * * 2485 * 1990 * * * * 42 0 * * * * * * 1787 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1787 0 0 D 44 * * 812 2485 * * * * * * * 1990 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1787 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1787 0 0 F 46 * * * * 2328 * * * * 320 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1787 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1787 0 0 C 48 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1787 0 0 R 49 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 49 0 * * * * * * 1787 0 0 Q 50 * * * * * * * * * * * * * 418 * 1990 * * * * 50 0 * * * * * * 1787 0 0 W 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 51 0 * * * * * * 1787 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1787 0 0 R 53 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 53 0 * * * * * * 1787 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 1990 418 * * 54 0 * * * * * * 1787 0 0 I 55 * * * * * * * 621 * 1516 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1787 0 0 A 56 418 * * * * * * 1990 * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1787 0 0 Q 57 * * * * * * * * 1516 2325 * * * 2328 1990 * * * * * 57 0 * * * * * * 1787 0 0 P 58 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1787 0 0 G 59 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1787 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1787 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1787 0 0 X 62 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 62 0 * * * * * * 1671 0 0 N 63 * * * * * * * * * * 2325 2328 * * 1516 * 1990 * * * 63 0 * * * * * * 1787 0 0 R 64 1516 * * * * * * * * 2325 * * * * 1149 * * * * * 64 0 * * * * * * 1787 0 0 D 65 * * 321 * * * * * * * * * * * * 2325 * * * * 65 0 * * * * * * 1787 0 0 S 66 1990 * 865 * * * * * * * * * * * * 2328 * * * * 66 0 * * * * * * 1787 0 0 E 67 * * 2325 2328 * * * * * * * * * 2485 1242 * * * * * 67 0 * * * * * * 1787 0 0 I 68 * * * * * * * 2328 * 1148 * * * * * * * * 1516 * 68 0 * * * * * * 1787 0 0 Y 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 2325 1516 * 1149 69 0 * * * * * * 1787 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1787 0 0 V 71 * * * * * * * 1990 * * * * * * * * * 418 * * 71 0 * * * * * * 1787 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * 734 * * * * 1327 * * * 72 0 * * * * * * 1787 0 0 A 73 2328 * * 1990 * * * * * * * * * * * * 1516 2325 * * 73 0 * * * * * * 1787 0 0 S 74 * * * * * * * * 1148 * * * * 1516 * 2328 * * * * 74 0 * * * * * * 1787 0 0 L 75 * * * * * * * * * 2328 * 1990 * 1516 2325 * * * * * 75 0 * * * * * * 1787 0 0 D 76 * * 2328 1148 * * * * * * * * * * 1516 * * * * * 76 0 * * * * * * 1787 0 0 I 77 * * * * * * * 2328 * 2325 * * * * * * * 734 * * 77 0 * * * * * * 1787 0 0 Y 78 * * * * * * * * * * 1516 * * * * 1990 * * * 1327 78 0 * * * * * * 1787 0 0 P 79 1990 * * 2325 * * * * * * * * 866 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1787 0 0 V 80 * * * * * * * 2325 * 734 * * * * * * * 2328 * * 80 0 * * * * * * 1787 0 0 E 81 * * * 418 * * * * * * * * * * 1990 * * * * * 81 0 * * * * * * 1787 0 0 R 82 * * * * * * * * * 734 * * * * 1327 * * * * * 82 0 * * * * * * 1787 0 0 E 83 * * 684 2328 * * * * 2485 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1787 0 0 G 84 * * * * * 418 1990 * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1787 0 0 N 85 2548 * 1990 * * * * * * * * 793 * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1787 0 0 T 86 * * * 1516 * * * * * * * * * * * * 1327 1990 * * 86 0 * * * * * * 1787 0 0 I 87 * * * * * * * 2328 * 320 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1787 0 0 S 88 * * * 2325 * * 734 * * * * * * * * 2328 * * * * 88 0 * * * * * * 1787 0 0 Y 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 89 0 * * * * * * 1787 0 0 D 90 * * 418 * * 1990 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1787 0 0 R 91 * * * * * 1148 * * * * * * * * 866 * * * * * 91 0 * * * * * * 1787 0 0 X 92 * * * * * * * * * 451 1896 * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1671 0 0 T 93 * * * * * * * 1516 * * * * * * * * 621 * * * 93 0 * * * * * * 1787 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1787 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * 320 * 2328 * * * * 95 0 * * * * * * 1787 0 0 R 96 * * * * * * * * 1516 * * * * * 621 * * * * * 96 0 * * * * * * 1787 0 0 V 97 * * * * * * * * * * * * * * * 1990 * 418 * * 97 0 * * * * * * 1787 0 0 E 98 865 * * 2328 * * * * * * * * * * * * 1990 * * * 98 0 * * * * * * 1787 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * 1516 1327 1990 * * * * 99 0 * * * * * * 1787 0 0 L 100 * * * * * * * * * 2328 * * 320 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1787 0 0 T 101 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 101 0 * * * * * * 1787 0 0 P 102 1516 * * 1990 * * * * * * * * 1327 * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1787 0 0 E 103 * * * 418 * * * * * * * * * 1990 * * * * * * 103 0 * * * * * * 1787 0 0 C 104 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1787 0 0 E 105 2325 * * 2328 * * * * * * * * * 734 * * * * * * 105 0 * * * * * * 1787 0 0 K 106 1900 * * * * * * * 1909 * * * * 1102 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1567 0 0 A 107 904 * * * * * * * * * * * * 2083 2122 * * * * * 107 0 * * * * * * 1567 0 0 W 108 * * * * * * * * * 447 * * * * * * * * 1909 * 108 0 * * * * * * 1567 0 0 A 109 1664 * 1476 1622 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1556 0 0 K 110 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1270 0 0 A 111 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 R 112 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 A 113 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 T 114 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //