HHsearch 1.5 NAME c4hhuA_ FAM FILE c4hhuA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4hhuA_.a3m DATE Sat Oct 27 15:51:28 2012 LENG 170 match states, 170 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.3776 -2.7363 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEECSCHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCEEEEEEETTEEEEEEESCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEECTTCCEEEEEEECSCHHHHHHH HHHHHHHHHHTTCEEEEEECSSEEEEEEESCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEEETTEEEEEECC >sa_dssp EBBAAAAAABEEDEBADEABECABEBAEEDEBEBDDCDCDCAAAACADEBEEEBBDDABEBADDADEECEBCBBDBDBDDECBBAAAAACCEEDEBADDA BECACECAEECEBECCDBCCEDBAAAAABDADEEBBEDACEBADDACEECEBEBCBABBCEEEDDDDECE >ss_pred CCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCHHHHHHH HHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCCC >ss_conf 9358999946836899999999999854003168999848979999916957999998888998876403379999950788469999946836899999 9999998540031689998489799999169579999988889988764033799999611000011369 >Consensus xgvxvixfxgddleaxekalkemirqarkfagtvtytlxgnxlxixitgvpeqvrkelakeaerlxxefnixvxyxixgsgsgvxvixfxgddleaxeka lkemirqarkfagtvtytlxgnxlxixitgvpeqvrkelakeaerlxxefnixvxyxixtgslehhhhhh >c4hhuA_ XGVXVIVFEGDDLEALEKALKEXIRQARKFAGTVTYTLSGNRLVIVITGVPEQVRKELAKEAERLKAEFNINVQYQIXGSGSGVXVIVFEGDDLEALEKA LKEXIRQARKFAGTVTYTLSGNRLVIVITGVPEQVRKELAKEAERLKAEFNINVQYQIXTGSLEHHHHHH >UniRef50_UPI0001B04C41(5-76:85) UPI0001B04C41 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI0001B04C41 E=5e-25 s/c=1.60 id=81% cov=43% --------------------------------------------------------------------------------------IRFRGDDLEAFEKA LKEMIRQARKFAGTVTYTLDGNDLEIRITGVPEQVRKELAKEAERLAKEFNITVTYTI------------ >UniRef50_UPI0001B04C41(5-76:85) UPI0001B04C41 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI0001B04C41 E=9e-28 s/c=1.72 id=81% cov=43% -----IRFRGDDLEAFEKALKEMIRQARKFAGTVTYTLDGNDLEIRITGVPEQVRKELAKEAERLAKEFNITVTYTI----------------------- ---------------------------------------------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 X 4 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 4 * * * * * * * 1000 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1122 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * 980 * * 1020 * * 7 0 * * * * * * 1122 0 0 F 8 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1122 0 0 E 9 * * * 1020 * * * * * * * * * * 980 * * * * * 9 0 * * * * * * 1122 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1122 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1122 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1122 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1122 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1122 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1122 0 0 L 16 * * * * 980 * * * * 1020 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1122 0 0 E 17 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1122 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1122 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1122 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1122 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1122 0 0 E 22 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1122 0 0 X 23 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1122 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1122 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1122 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1122 0 0 K 29 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1122 0 0 F 30 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1122 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1122 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1122 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1122 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1122 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1122 0 0 Y 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 36 0 * * * * * * 1122 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1122 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1122 0 0 S 39 * * 980 * * * * * * * * * * * * 1020 * * * * 39 0 * * * * * * 1122 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1122 0 0 N 41 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1122 0 0 R 42 * * 980 * * * * * * * * * * * 1020 * * * * * 42 0 * * * * * * 1122 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1122 0 0 V 44 * * * 980 * * * * * * * * * * * * * 1020 * * 44 0 * * * * * * 1122 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1122 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * 980 * * 1020 * * 46 0 * * * * * * 1122 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1122 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1122 0 0 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1122 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1122 0 0 P 51 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1122 0 0 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 53 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1122 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1122 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1122 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1122 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1122 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1122 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1122 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1122 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1122 0 0 A 62 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1122 0 0 E 63 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1122 0 0 R 64 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 64 0 * * * * * * 1122 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1122 0 0 K 66 980 * * * * * * * 1020 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1122 0 0 A 67 1020 * * * * * * * 980 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1122 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1122 0 0 F 69 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1122 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1122 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1122 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 1020 * * * * 980 * * * 72 0 * * * * * * 1122 0 0 V 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 73 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 74 * * * * * * * * * * * * * 1020 * * 980 * * * 74 0 * * * * * * 1122 0 0 Y 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 75 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 76 * * * * * * * * * * * * * 1020 * * 980 * * * 76 0 * * * * * * 1122 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1122 0 0 X 78 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 78 * * * * * * * 1000 0 0 G 79 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 X 85 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 85 * * * * * * * 1000 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1122 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * 980 * * 1020 * * 88 0 * * * * * * 1122 0 0 F 89 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1122 0 0 E 90 * * * 1020 * * * * * * * * * * 980 * * * * * 90 0 * * * * * * 1122 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1122 0 0 D 92 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1122 0 0 D 93 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1122 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1122 0 0 E 95 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1122 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1122 0 0 L 97 * * * * 980 * * * * 1020 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1122 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1122 0 0 K 99 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1122 0 0 A 100 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1122 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1122 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1122 0 0 E 103 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1122 0 0 X 104 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 I 105 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1122 0 0 R 106 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 106 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 107 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 107 0 * * * * * * 1122 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1122 0 0 R 109 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 109 0 * * * * * * 1122 0 0 K 110 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1122 0 0 F 111 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1122 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1122 0 0 G 113 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1122 0 0 T 114 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 114 0 * * * * * * 1122 0 0 V 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1122 0 0 T 116 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 116 0 * * * * * * 1122 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1122 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 118 0 * * * * * * 1122 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1122 0 0 S 120 * * 980 * * * * * * * * * * * * 1020 * * * * 120 0 * * * * * * 1122 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1122 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1122 0 0 R 123 * * 980 * * * * * * * * * * * 1020 * * * * * 123 0 * * * * * * 1122 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1122 0 0 V 125 * * * 980 * * * * * * * * * * * * * 1020 * * 125 0 * * * * * * 1122 0 0 I 126 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1122 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * 980 * * 1020 * * 127 0 * * * * * * 1122 0 0 I 128 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1122 0 0 T 129 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 129 0 * * * * * * 1122 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1122 0 0 V 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 131 0 * * * * * * 1122 0 0 P 132 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1122 0 0 E 133 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 134 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1122 0 0 V 135 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 135 0 * * * * * * 1122 0 0 R 136 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 136 0 * * * * * * 1122 0 0 K 137 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1122 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1122 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1122 0 0 A 140 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1122 0 0 K 141 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1122 0 0 E 142 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1122 0 0 A 143 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1122 0 0 E 144 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1122 0 0 R 145 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 145 0 * * * * * * 1122 0 0 L 146 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1122 0 0 K 147 980 * * * * * * * 1020 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1122 0 0 A 148 1020 * * * * * * * 980 * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1122 0 0 E 149 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1122 0 0 F 150 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1122 0 0 N 151 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1122 0 0 I 152 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1122 0 0 N 153 * * * * * * * * * * * 1020 * * * * 980 * * * 153 0 * * * * * * 1122 0 0 V 154 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 154 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 155 * * * * * * * * * * * * * 1020 * * 980 * * * 155 0 * * * * * * 1122 0 0 Y 156 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 156 0 * * * * * * 1122 0 0 Q 157 * * * * * * * * * * * * * 1020 * * 980 * * * 157 0 * * * * * * 1122 0 0 I 158 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1122 0 0 X 159 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 159 * * * * * * * 1000 0 0 T 160 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 G 161 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 S 162 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 L 163 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 E 164 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 H 165 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 H 166 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 H 167 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 H 168 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 H 169 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 H 170 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 170 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //