HHsearch 1.5 NAME c3u6xU_ FAM FILE c3u6xU_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3u6xU_.a3m DATE Sat Jul 7 13:13:44 2012 LENG 105 match states, 105 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.3937 -1.1003 SEQ >ss_dssp CCEEEEEESCSSCCCEEEEEEESCTTCCTTSTTCSSSTTCSCCEEECCEEEEETTEEEEECCGGGCCCSEEEEETTTEEEEEETTEEEEEEESSSCEEEE EECCC >sa_dssp BDDAAACADCDEEBDAEBCBCDCCDEBBEEDEEDCEEEDCDEEEEBEDECDCEECCACACBDEECDBEDEDDDCEDBBACACDECCAAAADBDECDBDDB DDDEE >ss_pred CEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEE EEEEC >ss_conf 9079983377646516886420332342256566772067448876789875013788863522776114999966829998397499998168656422 78839 >Consensus gfkfvlehdseyqpevkvtsyknaigtetdgfxxgpxfggxtiynvpixlsydxqkvyvempxsyxlagxixxxxdxtlliixxxqvlcfxmxxakitkg yxfva >c3u6xU_ GFKFVLEHDSEYQPEVKVTSYKNAIGTETDGFDSGPVFGGGTIYNVPVSLSYDRQKVYVEMPKSYTLAGDIILIDDGTLLVIKETQVLCFKMSDAKITKG YVFVA >UniRef50_A6MAD2(195-298:299) Gp067 n=3 Tax=Caudovirales RepID=A6MAD2_9CAUD E=4e-50 s/c=1.90 id=76% cov=100% GFKFVLEHDSEYQPEVKVTSYKNAIGTETDGFGTGPSFGGETIYNVPIRLSYDLQKVYVEMPISYQLAGEVTITVDNTLLIINGPQVLCFNMTGAKITKG YAFV- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1173 0 0 F 2 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1173 0 0 K 3 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1173 0 0 F 4 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1173 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1173 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1173 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1173 0 0 H 8 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1173 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1173 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1173 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 12 0 * * * * * * 1173 0 0 Q 13 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1173 0 0 P 14 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1173 0 0 E 15 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1173 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1173 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1173 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 18 0 * * * * * * 1173 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1173 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 20 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 21 0 * * * * * * 1173 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1173 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1173 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1173 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1173 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1173 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 27 0 * * * * * * 1173 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1173 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1173 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1173 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1173 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1173 0 0 D 33 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1173 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 34 0 * * * * * * 1173 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1173 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1173 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 37 0 * * * * * * 1173 0 0 F 38 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1173 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1173 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1173 0 0 G 41 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1173 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1173 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 44 0 * * * * * * 1173 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1173 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1173 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1173 0 0 V 48 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 48 0 * * * * * * 1173 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 49 0 * * * * * * 1173 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1173 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 52 0 * * * * * * 1173 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1173 0 0 R 54 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 54 0 * * * * * * 1173 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1173 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1173 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 58 0 * * * * * * 1173 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1173 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1173 0 0 M 61 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1173 0 0 P 62 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1173 0 0 K 63 * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1173 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 64 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 65 0 * * * * * * 1173 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * 66 0 * * * * * * 1173 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1173 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1173 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1173 0 0 D 70 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1173 0 0 I 71 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 71 0 * * * * * * 1173 0 0 I 72 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 72 0 * * * * * * 1173 0 0 L 73 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1173 0 0 I 74 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 74 0 * * * * * * 1173 0 0 D 75 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 75 0 * * * * * * 1173 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1173 0 0 G 77 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1173 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1173 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1173 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1173 0 0 V 81 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 81 0 * * * * * * 1173 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1173 0 0 K 83 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1173 0 0 E 84 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1173 0 0 T 85 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 85 0 * * * * * * 1173 0 0 Q 86 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1173 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1173 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1173 0 0 C 89 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1173 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1173 0 0 K 91 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1173 0 0 M 92 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1173 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 93 0 * * * * * * 1173 0 0 D 94 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1173 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1173 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1173 0 0 I 97 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1173 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 98 0 * * * * * * 1173 0 0 K 99 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1173 0 0 G 100 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1173 0 0 Y 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 101 0 * * * * * * 1173 0 0 V 102 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 102 0 * * * * * * 1173 0 0 F 103 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1173 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1173 0 0 A 105 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //