HHsearch 1.5 NAME c3nqnB_ FAM FILE c3nqnB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3nqnB_.a3m DATE Sat Aug 28 18:06:48 2010 LENG 150 match states, 150 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.4033 -1.3681 SEQ >ss_dssp CCSSEEEEEEEEECTTCHHHHHHHHTCHHHHHHTSTTSEEEEECSSEEEEEEEEEETTTEEEEEEEEEEEEEETTEEEEEECCCCTTSCEEEEEEEEEEC TTSEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCC >sa_dssp EEECCBDCDCECEBDECDECACECBCEBCDCBEDAECBDECDCDEECACBCACBECEEEDEDDBCBCADCCEBEDABCBDDCECEEEDCBABACBDBDBD DEADADBCBCBDBDDDEEEEEEEECCDBBBECACEAAEBACEBADEECDE >ss_pred CCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCEEEECCCEEEE CCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >ss_conf 9434031028986289758887764164467438642100110121122234562022000146620125764576365306767882205412650121 15733799998412455599999999887657999998754225404898 >Consensus xxxxxaeqxFtLrhPggqaaaLafvrxpxxalagvrflrgLxxdgExvxGELvvxvPllGevdlPFrSrlxxtpxGaxLxPxxltGEraWvevsGeatax eggxxafxfxfraHlalGaAfekmvxAAagRTleRvaxxLpxGxxaxxxx >c3nqnB_ GXILSAEQSFTLRHPHGQAAALAFVREPAAALAGVRFLRGLDSDGEQVWGELLVTVPLLGEVDLPFRSEIVRTPQGAELRPLTLTGERAWVAVSGQATAA EGGEXAFAFQFQAHLATGAAFEKXVQAAAGRTLERVAKALPEGLAAGLPP >UniRef50_Q1J1P2(2-154:163) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Deinococcus RepID=Q1J1P2_DEIGD E=4e-38 s/c=1.04 id=62% cov=98% --LIEARQHFTLSHPGGQMAALAFVRNAGVALARVRFLHGLAADTEGVRGELVVPVPVLGEVDLPFQSRLTVTPNGATLTPQPLTGERAWVEVAGEAQVD EVGTVTFHFHFRAHLALpqsegwgGAAFEKMVRAAAGRTLERVAGELPLGIGAAM-- >UniRef50_C1XVV7(1-148:148) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Meiothermus RepID=C1XVV7_9DEIN E=9e-05 s/c=0.33 id=33% cov=91% ---MTLERTFELRIPGTPAELLT----PERVFGGRPPFRDLRREGEYLMGELVTYTPLIGDLRFPFRSRLQAEAEGraslVALFPGDEGGEPPafWAELS GEGTAV-GDALAYTITVRLHAQLpegekwgGKALRRMAEAAFQRTISRALETLNQG------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 X 2 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 2 * * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 1020 * 980 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1286 0 0 L 4 * * * * * * * 1640 * 1723 1410 * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1756 0 0 S 5 * * * 1640 * * * * * * * * * * * 1723 1410 * * * 5 0 * * * * * * 1756 0 0 A 6 681 * * * * * * * * 1410 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1756 0 0 E 7 * * * 558 * * * * * * * * * * 1640 * * * * * 7 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 681 1410 * * * * * 8 0 * * * * * * 1756 0 0 S 9 * * * * * * 1640 * * * * * * * * 1723 1410 * * * 9 0 * * * * * * 1756 0 0 F 10 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1756 0 0 T 11 * * * 1410 * * * * * * * * * * * * 681 * * * 11 0 * * * * * * 1756 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1756 0 0 R 13 * * * * * * * * * * * * * * 558 1640 * * * * 13 0 * * * * * * 1756 0 0 H 14 * * * * * * 681 1410 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1756 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1756 0 0 H 16 * * * * * 521 1723 * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1756 0 0 G 17 * * * * * 681 * * * * * * * * * * 1410 * * * 17 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * 1410 681 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1756 0 0 A 19 558 * * * * * * * * * 1640 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1756 0 0 A 20 681 * * 1410 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1756 0 0 A 21 681 * * * * * * * * 1410 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1756 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1756 0 0 A 23 681 * * * * * * * * * * * * * * * 1410 * * * 23 681 * 1410 * * * * 1756 0 0 F 24 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * 0 1286 0 1000 V 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 25 0 * * * * * 0 1286 0 1000 R 26 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 26 0 * * * * * 0 1286 0 1000 E 27 * * * 1020 * * * * * * * 980 * * * * * * * * 27 0 * * * * 0 * 1286 0 1000 P 28 1640 * * * * * * * * * * * 558 * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1756 0 0 A 29 1723 * * 1410 * 1640 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1756 0 0 A 30 1723 * * * * * * * * * * * * * 1410 * * 1640 * * 30 0 * * * * * * 1756 0 0 A 31 681 * * * * * * * * * * * * * * * * 1410 * * 31 0 * * * * * * 1756 0 0 L 32 * * * * 1410 * * * * 681 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1756 0 0 A 33 681 * * * * 1410 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1756 0 0 G 34 * * * * * 558 * * * * * * * * 1640 * * * * * 34 0 * * * * * * 1756 0 0 V 35 * * * * * * * * * * * * * * 1410 * * 681 * * 35 0 * * * * * * 1756 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * 1410 * 681 * * * * * 36 0 * * * * * * 1756 0 0 F 37 * * * * 681 * * * * * * * 1410 * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1756 0 0 L 38 * * * * 1410 * * * * 681 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1756 0 0 R 39 * * * * * * 1640 * * * * * * * 558 * * * * * 39 0 * * * * * * 1756 0 0 G 40 * * 1410 * * 681 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1756 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1756 0 0 D 42 1640 * 1723 * * * * * * * * * * * 1410 * * * * * 42 0 * * * * * * 1756 0 0 S 43 1640 * * * * * * * * * * * * * 1410 1723 * * * * 43 0 * * * * * * 1756 0 0 D 44 * * 681 1410 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1756 0 0 G 45 * * * * * 558 * * * * * * * * * * 1640 * * * 45 0 * * * * * * 1756 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 47 * * * * * 1640 * * * * * * * 1723 * * * * * 1410 47 0 * * * * * * 1756 0 0 V 48 * * * * * * * * * 1410 * * * * * * * 681 * * 48 0 * * * * * * 1756 0 0 W 49 * * * * * * * * * * 1410 * * * 1640 * * * 1723 * 49 0 * * * * * * 1756 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1756 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1756 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1756 0 0 L 53 * * * * * * * * * 1723 * * * * * * * 521 * * 53 0 * * * * * * 1756 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 1410 681 * * 54 0 * * * * * * 1756 0 0 T 55 * * * * * * * * * * * * 1640 * * * 1723 * * 1410 55 0 * * * * * * 1756 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * 1410 681 * * 56 0 * * * * * * 1756 0 0 P 57 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1756 0 0 L 58 * * * * * * * * * 558 * * * * * * * 1640 * * 58 0 * * * * * * 1756 0 0 L 59 * * * * * * * 1410 * 681 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1756 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1756 0 0 E 61 * * 1410 681 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1756 0 0 V 62 * * * * * * * * * 1410 * * * * * * * 681 * * 62 0 * * * * * * 1756 0 0 D 63 * * 681 * * * * * * * * * * * 1410 * * * * * 63 0 * * * * * * 1756 0 0 L 64 * * * * 1410 * * * * 681 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1756 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1756 0 0 F 66 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1756 0 0 R 67 * * * * * * * * * * * * * 1640 558 * * * * * 67 0 * * * * * * 1756 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1756 0 0 E 69 * * * 1723 * * * * * * * * * * 521 * * * * * 69 0 * * * * * * 1756 0 0 I 70 * * * * * * * 1723 * 521 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1756 0 0 V 71 * * * * * * * * * * * * * 1410 * * 1640 1723 * * 71 0 * * * * * * 1756 0 0 R 72 1410 * * * * * * * * * * * * * 1723 * * 1640 * * 72 0 * * * * * * 1756 0 0 T 73 * * * 1410 * * * * * * * * * * * * 681 * * * 73 0 * * * * * * 1756 0 0 P 74 1410 * * * * * * * * * * * 681 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 75 * * * 1410 * * * * * * * 1640 * 1723 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1756 0 0 G 76 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 76 681 1410 * 2000 415 * * 1756 1000 0 A 77 681 * * * * * * * * * * * * * * * * 1410 * * 77 0 * * * * * * 1756 0 0 E 78 1410 * * 1723 * * * * * * * * * * * * 1640 * * * 78 0 * * * * * * 1756 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1756 0 0 R 80 * * * * 1410 * * * * * * * * * 1723 * 1640 * * * 80 0 * * * * * * 1756 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1756 0 0 L 82 * * * * * 1410 * * * 1723 * * * 1640 * * * * * * 82 0 * * * * * * 1756 0 0 T 83 * * 1410 * * * * * * * * * 1640 * * * 1723 * * * 83 0 * * * * * * 1756 0 0 L 84 * * * 1410 * * * * * 681 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1756 0 0 T 85 * * * * * 1410 * * * * * * * * * * 681 * * * 85 0 * * * * * * 1756 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1756 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1756 0 0 R 88 * * * * * * * * * * * * 1410 * 681 * * * * * 88 0 * * * * * * 1756 0 0 A 89 681 * * * * * * * * * * * 1410 * * * * * * * 89 681 1410 * 1000 1000 * * 1756 1000 0 W 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 90 0 * * * * * * 1756 0 0 V 91 1410 * * * * * * * * * * * * * * * * 681 * * 91 0 * * * * * * 1756 0 0 A 92 1723 * * 521 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1756 0 0 V 93 * * * * * * * * * 1410 * * * * * * * 681 * * 93 0 * * * * * * 1756 0 0 S 94 1640 * * * * * * * * * * * * * * 558 * * * * 94 0 * * * * * * 1756 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 96 * * * 521 * * * * * * * * * 1723 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1756 0 0 A 97 681 * * * * 1410 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1756 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * 1640 * * 558 * * * 98 0 * * * * * * 1756 0 0 A 99 558 * * * * * * * * * * * * * * * * 1640 * * 99 0 * * * * * * 1756 0 0 A 100 1723 * 1640 * * * * * * * * * * * * * * 1410 * * 100 681 * 1410 * * * * 1756 0 0 E 101 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * 0 * 1286 0 1000 G 102 * * * * * 558 * * * * * * * * * * * 1640 * * 102 0 * * * * * * 1756 0 0 G 103 * * 1410 * * 681 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1756 0 0 E 104 1410 * * 1723 * * * * * * * * * * * * 1640 * * * 104 0 * * * * * * 1756 0 0 X 105 * * * * * * * * * 1052 * * * * * * * 949 * * 105 0 * * * * * * 1600 0 0 A 106 558 * * * * * * * * * * * * * * * 1640 * * * 106 0 * * * * * * 1756 0 0 F 107 * * * * 681 * * * * * * * * * * * * * * 1410 107 0 * * * * * * 1756 0 0 A 108 1723 * * * * * 1640 * * * * * * * * * 1410 * * * 108 0 * * * * * * 1756 0 0 F 109 * * * * 681 * * 1410 * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 110 * * * * * * 1640 * * * * * * 1723 * * 1410 * * * 110 0 * * * * * * 1756 0 0 F 111 * * * * 681 * * * * * * * * * * * * 1410 * * 111 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 112 * * * * * * * * * * * * * 1723 521 * * * * * 112 0 * * * * * * 1756 0 0 A 113 681 * * * * * * * * 1410 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1756 0 0 H 114 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1756 0 0 L 115 1410 * * * * * * * * 681 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1756 0 0 A 116 681 * * * * * * * * * * * * 1410 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1756 0 0 T 117 * * * * * * * * * 521 * * * * * * 1723 * * * 117 1723 521 * 2807 222 * * 1756 1597 0 G 118 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1756 0 0 A 119 681 * * * * * * * 1410 * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1756 0 0 A 120 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1756 0 0 F 121 * * * * 681 * * * * 1410 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1756 0 0 E 122 * * * 681 * * * * * * * * * * 1410 * * * * * 122 0 * * * * * * 1756 0 0 K 123 * * * * * * * * 681 * * * * * 1410 * * * * * 123 0 * * * * * * 1756 0 0 X 124 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1600 0 0 V 125 1410 * * * * * * * * * * * * * * * * 681 * * 125 0 * * * * * * 1756 0 0 Q 126 * * * 1410 * * * * * * * * * 1723 1640 * * * * * 126 0 * * * * * * 1756 0 0 A 127 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1756 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1756 0 0 A 129 681 * * * 1410 * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1756 0 0 G 130 * * * * * 681 * * * * * * * 1410 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1756 0 0 R 131 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 131 0 * * * * * * 1756 0 0 T 132 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 132 0 * * * * * * 1756 0 0 L 133 * * * * * * * 1410 * 681 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1756 0 0 E 134 * * * 681 * * * * * * * * * * * 1410 * * * * 134 0 * * * * * * 1756 0 0 R 135 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 135 0 * * * * * * 1756 0 0 V 136 1410 * * * * * * * * * * * * * * * * 681 * * 136 0 * * * * * * 1756 0 0 A 137 681 * * * * * * * * 1410 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1756 0 0 K 138 * * * 1410 * 1640 * * 1723 * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1756 0 0 A 139 1723 * * 1640 * * * * * * * * * * * * 1410 * * * 139 0 * * * * * * 1756 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1756 0 0 P 141 * * * * * * * * * * * 1410 681 * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1756 0 0 E 142 * * * 1723 * * * * * 1640 * * * 1410 * * * * * * 142 0 * * * * * * 1756 0 0 G 143 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1756 0 0 L 144 * * * * * * * 980 * 1020 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1286 0 0 A 145 1020 * * * * 980 * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1286 0 0 A 146 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1286 0 0 G 147 980 * * * * 1020 * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1286 0 0 L 148 * * * * * * * * * 1020 980 * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1286 0 0 P 149 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 P 150 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 150 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //