HHsearch 1.5 NAME c3kz5E_ FAM FILE c3kz5E_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3kz5E_.a3m DATE Sun Aug 29 03:12:05 2010 LENG 48 match states, 48 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4477 2.3066 SEQ >ss_dssp CCSSCCEEEEETTEEEEEETTEEEEEECTTTSCHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEEEDEDDEEDEBBCACDEEEEEDDEDCEEEBEEEDBDEDDDEEEEEE >ss_pred CCCCHHCCCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 974000000388725897266678840324285899999999997409 >Consensus xxxxssrhqfapgatvlykgdkmvlnldrsrvpteciekieailkele >c3kz5E_ GSHMSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELE >UniRef50_P62559(172-323:323) Protein sopB n=70 Tax=root RepID=SOPB_ECO57 E=7e-72 s/c=0.53 id=90% cov=102% RTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1 0 * * * * * * 1059 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 2 0 * * * * * * 1059 0 0 H 3 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 3 0 * * * * * * 1059 0 0 M 4 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1059 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 5 0 * * * * * * 1059 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1059 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1059 0 0 H 8 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1059 0 0 Q 9 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1059 0 0 F 10 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1059 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1059 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1059 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1059 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1059 0 0 T 15 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 15 0 * * * * * * 1059 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1059 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1059 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 18 0 * * * * * * 1059 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1059 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1059 0 0 D 21 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1059 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1059 0 0 M 23 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1059 0 0 V 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 24 0 * * * * * * 1059 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1059 0 0 N 26 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1059 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1059 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1059 0 0 R 29 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 29 0 * * * * * * 1059 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1059 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1059 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1059 0 0 P 33 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1059 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1059 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1059 0 0 C 36 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1059 0 0 I 37 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1059 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1059 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1059 0 0 I 40 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1059 0 0 E 41 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1059 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1059 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1059 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1059 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1059 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1059 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1059 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * 0 * * * 1059 0 0 //