HHsearch 1.5 NAME c2qkwA_ FAM FILE c2qkwA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c2qkwA_.a3m DATE Tue Mar 9 20:05:36 2010 LENG 101 match states, 101 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4496 1.2290 SEQ >ss_dssp CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHTTTSSSCCSSGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCCCCSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC C >sa_dssp EECDCEDADEBCDDADECCDBDEDBDEDBEEEEDEEECDDBEEBDDDBDEBBEDACDACDDCEEECEEECECECCDBBEDADDACDDADDACECBEEBCE E >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC C >ss_conf 9531899999999988760887678887511388789874210576555335588777766402579983437432088999976427989999998637 9 >Consensus dnvtsxqllxvRhQLaEsxxLPxxQxeFxxxqAPxSLRxxYxxLxxxTxxxlxxADMxHRxmTgxxGxxPxxxxxexvddMxsxisxWxDMxEALxHAMx i >c2qkwA_ DNVTSSQLLSVRHQLAESAGLPRDQHEFVSSQAPQSLRNRYNNLYSHTQRTLDMADMQHRYMTGASGINPGMLPHENVDDMRSAITDWSDMREALQHAMG I >UniRef50_Q4ZLM6(29-129:163) Type III effector protein AvrPto1 n=6 Tax=Pseudomonas syringae group RepID=Q4ZLM6_PSEU2 E=2e-39 s/c=1.61 id=89% cov=101% DNVTSNQLLSVRRQLAESAGLPRDQHEFISSQAPESLRSSYNNLYSHTQRTLDFADMQHRFMTGASGINPGMLPRENVDDMRSAISDWSDMREALQHAMG I >UniRef50_C7DYA7(35-128:158) Effector AvrPto n=1 Tax=Pseudomonas syringae pv. myricae RepID=C7DYA7_9PSED E=3e-32 s/c=1.48 id=37% cov=94% ------EIINLRHQLSEAVNLPQHQVDFLNNEAPPSLRDNYRGLDRATRNDILVADMHHRRLT-QGGPHPATSTQDSINNMQTRVSAWHDMNEALDHAMQ V # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1071 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1071 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1071 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1071 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 5 0 * * * * * * 1071 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 6 0 * * * * * * 1071 0 0 Q 7 * * * 1260 * * * * * * * * * 780 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1580 0 0 L 8 * * * * * * * 1260 * 780 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1580 0 0 L 9 * * * * * * * 1260 * 780 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1580 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * 1260 * * * 780 * * * * 10 0 * * * * * * 1580 0 0 V 11 * * * * * * * * * 1260 * * * * * * * 780 * * 11 0 * * * * * * 1580 0 0 R 12 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 12 0 * * * * * * 1580 0 0 H 13 * * * * * * 497 * * * * * * * 1780 * * * * * 13 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 14 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 14 0 * * * * * * 1580 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1580 0 0 A 16 780 * * * * * * * * * * * * * * 1260 * * * * 16 0 * * * * * * 1580 0 0 E 17 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1580 0 0 S 18 1260 * * * * * * * * * * * * * * 780 * * * * 18 0 * * * * * * 1580 0 0 A 19 780 * * * * * * * * * * * * * * * * 1260 * * 19 0 * * * * * * 1580 0 0 G 20 * * * * * 780 * * * * * 1260 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1580 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1580 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1580 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * 1260 780 * * * * * 23 0 * * * * * * 1580 0 0 D 24 * * 780 * * * 1260 * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1580 0 0 H 26 * * * * * * 780 * * * * * * * * * * 1260 * * 26 0 * * * * * * 1580 0 0 E 27 * * 1260 780 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1580 0 0 F 28 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1580 0 0 V 29 * * * * * * * 1780 * 1260 * * * * * * * 1780 * * 29 0 * * * * * * 1580 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * 1260 * * * 780 * * * * 30 0 * * * * * * 1580 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * 1260 * * * 780 * * * * 31 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 32 * * * 1260 * * * * * * * * * 780 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1580 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1580 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 35 * * * 1780 * * * * * * * * 1260 1780 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1580 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1580 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1580 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1580 0 0 N 39 * * 1260 * * * * * * * * 1780 * * * 1780 * * * * 39 0 * * * * * * 1580 0 0 R 40 * * * * * * * * * * * 1260 * * 1780 1780 * * * * 40 0 * * * * * * 1580 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * * * * * 1580 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 780 * * 1260 * * * * * 42 0 * * * * * * 1580 0 0 N 43 * * * * * 1260 * * * * * 780 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1580 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1580 0 0 Y 45 * * 1260 * * * * * * * * * * * * * * * * 780 45 0 * * * * * * 1580 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * 1260 780 * * * * 46 0 * * * * * * 1580 0 0 H 47 1260 * * * * * 780 * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1580 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 49 * * * * * * * * * * * * * 780 1260 * * * * * 49 0 * * * * * * 1580 0 0 R 50 * * * * * * * * * * * 1260 * * 780 * * * * * 50 0 * * * * * * 1580 0 0 T 51 * * 1260 * * * * * * * * * * * * * 780 * * * 51 0 * * * * * * 1580 0 0 L 52 * * * * * * * 1260 * 780 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1580 0 0 D 53 * * 780 * * * * * * 1260 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1580 0 0 M 54 * * * * 1780 * * * * * 1780 * * * * * * 1260 * * 54 0 * * * * * * 1580 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1580 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1580 0 0 M 57 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 58 * * * * * * 1260 * * * * * * 780 * * * * * * 58 0 * * * * * * 1580 0 0 H 59 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1580 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 60 0 * * * * * * 1580 0 0 Y 61 * * * * 1780 * * * * * * * * * 1260 * * * * 1780 61 0 * * * * * * 1580 0 0 M 62 * * * * * * * * * 1260 780 * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1580 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 780 * 1260 * * * * 1580 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * 0 * 1071 0 1000 A 65 780 * * * * * * * * * * * * 1260 * * * * * * 65 0 * * * * * * 1580 0 0 S 66 * * * * * 1260 * * * * * * * * * 780 * * * * 66 0 * * * * * * 1580 0 0 G 67 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1580 0 0 I 68 * * * * * * * 780 * * * * 1260 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1580 0 0 N 69 * * * * * * 1260 * * * * 780 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1580 0 0 P 70 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1580 0 0 G 71 1260 * * * * 780 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1580 0 0 M 72 * * * * * * * * * * 780 * * * * * 1260 * * * 72 0 * * * * * * 1580 0 0 L 73 * * * * * * * * * 780 * * * * * 1260 * * * * 73 0 * * * * * * 1580 0 0 P 74 * * * * * * * * * * * * 780 * * * 1260 * * * 74 0 * * * * * * 1580 0 0 H 75 * * * * * * 1780 * * * * * * 1260 1780 * * * * * 75 0 * * * * * * 1580 0 0 E 76 * * 1260 780 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1580 0 0 N 77 * * * * * * * * * * * 780 * * * 1260 * * * * 77 0 * * * * * * 1580 0 0 V 78 * * * * * * * 1260 * * * * * * * * * 780 * * 78 0 * * * * * * 1580 0 0 D 79 * * 780 * * * * * * * * 1260 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1580 0 0 D 80 * * 780 * * * * * * * * 1260 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1580 0 0 M 81 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1580 0 0 R 82 * * * * * * * * * * * * * 1260 780 * * * * * 82 0 * * * * * * 1580 0 0 S 83 * * * * * * * * * * * * * * * 780 1260 * * * 83 0 * * * * * * 1580 0 0 A 84 780 * * * * * * * * * * * * * 1260 * * * * * 84 0 * * * * * * 1580 0 0 I 85 * * * * * * * 780 * * * * * * * * * 1260 * * 85 0 * * * * * * 1580 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * 497 1780 * * * 86 0 * * * * * * 1580 0 0 D 87 1260 * 780 * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1580 0 0 W 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 88 0 * * * * * * 1580 0 0 S 89 * * * * * * 1260 * * * * * * * * 780 * * * * 89 0 * * * * * * 1580 0 0 D 90 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1580 0 0 M 91 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1580 0 0 R 92 * * * * * * * * * * * 1260 * * 780 * * * * * 92 0 * * * * * * 1580 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1580 0 0 A 94 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1580 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1580 0 0 Q 96 * * 1260 * * * * * * * * * * 780 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1580 0 0 H 97 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1580 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1580 0 0 M 99 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1580 0 0 G 100 * * * * * 780 * * * * * * * 1260 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1580 0 0 I 101 * * * * * * * 780 * * * * * * * * * 1260 * * 101 0 * * 0 * * * 1580 0 0 //