HHsearch 1.5 NAME c1x6hA_ FAM FILE c1x6hA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c1x6hA_.a3m DATE Thu Mar 11 21:32:59 2010 LENG 86 match states, 86 columns in multiple alignment FILT 127 out of 16971 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 9.6 EVD 0.5633 2.1822 SEQ >ss_dssp CTTTCCSTTCCCCCCEECSSSSCEESSHHHHHHHHHHTTCSSCCCCCEECSSSCCEESCHHHHHHHHHHCCCCCSCCCCCCCCCCC >sa_dssp EEEECEDEEEEDEDECDBEECEDDBEEEEECECBCDDEDCEEDECCEDEAEDCDDECEEEDDCDECCEEBECEEDEEEEEEEEEEE >ss_pred CCCCCCCHHHCCCCCEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCCCCC >ss_conf 97010203327984647068887100012333212221111122222222223321111234443035314887787788887779 >Consensus gxxkxHxrxHxgekpxxCxxCxxxfxxxxxlxxHxxxxxxxxxxxxxxxcxxCxkxFxxxxxlxxHxxxHxxxkxxxCxxCgkxfg >c1x6hA_ GSSGSSGRTHTGEKPYACSHCDKTFRQKQLLDMHFKRYHDPNFVPAAFVCSKCGKTFTRRNTMARHADNCAGPDGVEGENSGPSSG >UniRef50_B4M7Z4(901-972:973) GJ16705 n=3 Tax=Drosophila RepID=B4M7Z4_DROVI E=9e-05 s/c=0.67 id=19% cov=85% ----RHMRAHLNIRDKVCPYCARAFVVGSAYYAHLNLH----RGEKRYSCSGCGQRFAQYAGLYKHRKRCSAIQSKELKE------ >UniRef50_UPI000175F606(514-600:649) PREDICTED: similar to zinc finger protein 160 n=3 Tax=Danio rerio RepID=UPI000175F606 E=4e-05 s/c=0.57 id=19% cov=100% GNFTKHKQVHAGLKAFVCLECRKCFAHAEDLKSHLVNCGRKTQSLCDYNLQCseCRKSFRKRSNFKNHLRIHSGGRRFNCDRCNKKF- >UniRef50_UPI00016E86CE(609-689:987) UPI00016E86CE related cluster n=3 Tax=Takifugu rubripes RepID=UPI00016E86CE E=0.001 s/c=0.55 id=20% cov=94% -----HYKSHTAAKVYQCTMCSKSFSFlGFVFMRSDEMHEMEEPRNALFACYVCDRHFTNSTELMAHQKAHVEKKPFKCPICGQAF- >UniRef50_UPI00016E2CEF(193-281:470) UPI00016E2CEF related cluster n=1 Tax=Takifugu rubripes RepID=UPI00016E2CEF E=2e-06 s/c=0.60 id=16% cov=101% GALRVHERIHSEERPFKCDFCSFASKQRSNLVIHSQIHsdaKIFAVCVCSHCRIGFLEKHSESSKLKNHQKTNLGLKKHRCKYCGKTFG >UniRef50_Q4T7P0(711-846:1001) Chromosome undetermined SCAF8068, whole genome shotgun sequence. (Fragment) n=5 Tax=Euteleostomi RepID=Q4T7P0_TETNG E=2e-05 s/c=0.37 id=16% cov=97% GYIKQHLRVHRQRQPYQCPICEhialdsKDLESHMIHHCKTRTYQCKVCQETFHHksqlrnhekehenltsdttafnaiegiataedaereigDCTLQKL FKCDVCdytsstyvgVRNHRRIHNSEKPYRCSLCG---- >UniRef50_Q16EJ7(289-370:610) Putative uncharacterized protein (Fragment) n=2 Tax=Aedes aegypti RepID=Q16EJ7_AEDAE E=0.0003 s/c=0.57 id=19% cov=97% -SLDNHTRRHMGRPNFACEYC---PSTFYTSQEHKLHLSLSHSDVRTYQCPFCEKAFKTNMHLHRHKETIHMKIRFKCTHCDASYG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 5481 0 0 S 2 3865 * 4717 * 4839 * 3956 4758 * * * 3378 * * 5083 822 * * * 3931 2 0 * * * * * * 6854 0 0 S 3 5065 * * * 5043 * * 3463 4844 971 5089 * * * 4058 2423 * * * 5152 3 0 * * * * * * 7122 0 0 G 4 4276 * 4949 * * 5633 5875 * 1033 * * 5454 * 3885 2119 5837 4754 6080 * * 4 0 * * * * * * 8164 0 0 S 5 3796 * 6309 4779 * 6033 4705 * 2444 4738 6283 4167 * 3200 2004 3338 4780 5121 * 6208 5 0 * * * * * * 8826 0 0 S 6 * * * * * * 162 * 5410 * * 5921 5286 * * 6284 * * * 5170 6 0 * * * * * * 8966 0 0 G 7 6692 * * 3183 * 6284 5188 3901 3871 2902 2998 * * 2276 3216 4801 5419 4495 * 5160 7 0 * * * * * * 8966 0 0 R 8 4174 * 5348 5011 * * 6315 5373 3058 4183 6280 4129 * 3959 1111 6540 5616 5451 * 5268 8 30 5625 * 0 * * * 8949 1672 0 T 9 4841 6289 * 5256 4816 * * 2162 4918 5105 6456 * * 5494 4210 3315 1887 2887 * 6446 9 15 6616 * 0 * * * 8953 1000 0 H 10 * 6425 * 5629 * * 133 6527 6236 * 6540 * * * 5548 * * * * * 10 34 5438 * 1563 596 * * 9336 1715 0 T 11 4123 5587 6856 4519 5703 6470 4918 4149 4126 4621 6700 4175 5684 6891 4958 2498 1561 6525 * * 11 25 6850 6869 1000 1000 * * 9347 1000 0 G 12 4689 6615 4001 3157 * 1162 * * 3608 * * 3835 5992 3945 5726 4707 5724 5597 * * 12 13 * 6752 * * * 0 9389 0 1000 E 13 4744 * 3373 1052 * * 5418 5237 4247 4421 6763 5613 5166 4064 5518 5127 5558 4450 * * 13 82 4413 6857 507 1755 1000 1000 9396 3205 1709 K 14 6987 * 6804 4685 6041 5277 6691 5911 976 6853 4670 5232 5626 4362 2342 6670 6982 * * 6610 14 11 * 7073 * * 1000 1000 9690 0 1682 P 15 5429 * 5361 5911 6369 7030 5613 6412 5254 4187 5835 4078 1092 3999 3539 4231 5190 6632 * 5818 15 58 4673 * 2050 399 0 * 9750 3074 1681 Y 16 * 4657 * * 1618 5050 2717 7178 5905 4138 * 5564 * * * * * 6926 6849 1583 16 20 6209 * 840 1180 * * 9852 1636 0 A 17 4317 5946 6000 2942 6733 6895 4849 7296 2171 6778 4779 5353 5096 3525 3643 4505 3788 3190 7062 7110 17 10 7201 * 1585 585 * * 9941 1000 0 C 18 * 102 * 6277 * * * 6306 * 6310 * * * * * 6473 6706 * * 6792 18 0 * * * * * * 9893 0 0 S 19 4841 5906 2996 3290 * 5739 5376 5648 3125 4452 * 4621 2667 4545 4332 3274 3270 * * * 19 0 * * * * * * 9893 0 0 H 20 5155 * 4810 2648 4403 7024 3140 3235 3277 4149 5860 7125 * 3955 4915 5622 4878 3476 * 3709 20 39 5212 * 1000 1000 * * 9893 2725 0 C 21 6811 138 * * * 6585 * * * * * 6843 5187 * * 6277 * * 6310 6601 21 39 * 5218 * * * * 9893 0 0 D 22 4702 6541 3008 3678 6093 1526 4783 6755 5406 * * 3900 3819 4819 5441 3493 7428 6797 * 5847 22 74 5798 4959 2842 217 * 0 9844 1710 2312 K 23 4764 4647 6426 3656 4809 * 5957 5989 1445 6857 4686 5927 * 4731 3459 5114 4525 5098 * 3273 23 50 5175 7264 1592 582 2592 262 9833 2422 3848 T 24 3034 4275 5051 5040 5497 4223 * 6238 3574 6713 * 4575 4724 5353 3271 3102 2672 3396 * 7163 24 40 5965 6490 4125 85 1829 477 9857 1620 3894 F 25 4638 5176 * * 898 6636 5424 * 6612 4258 * * 5609 * 5276 3923 3904 7167 5785 3387 25 15 6576 * 2000 415 1052 950 9866 1000 3626 R 26 3847 5810 4031 4070 4636 5176 4210 4208 2756 5868 * 4616 5340 6792 3644 2982 3436 4105 * 5697 26 29 5641 * 3166 170 536 1688 9929 1811 2298 Q 27 * 5173 4494 5788 4327 4198 3909 6073 4613 4951 5124 3495 * 3318 2721 3331 3289 4650 6899 4980 27 14 6706 * 0 * 0 * 9894 1000 1000 K 28 4180 4379 * 4729 4286 4628 5384 4646 2435 4425 * 4170 4855 4923 3072 3350 5033 4751 5936 4384 28 28 * 5712 * * * * 9893 0 0 Q 29 3649 * 4904 3912 4348 3799 4230 5319 4795 4991 6654 5389 6001 4020 4425 1937 4325 4652 * 4465 29 0 * * * * 0 * 9840 0 1732 L 30 3432 5121 3909 4753 6829 4763 3331 4647 4701 3795 6711 2850 4972 3790 5919 2819 5148 6716 * 5001 30 13 6843 * 0 * * * 9893 1000 0 L 31 5377 4161 7341 * 2982 7109 5779 5125 5260 1271 4539 5959 6056 7020 5473 4362 5988 4388 7028 3864 31 24 * 5909 * * * * 9893 0 0 D 32 4352 6803 4673 4433 5403 4960 4693 4256 2783 3261 4925 6596 6031 3753 3190 3984 3964 4149 6031 5712 32 27 5743 * 3816 106 933 1070 9877 1731 1732 M 33 3230 5345 5165 3988 * 5947 5963 4394 3318 3607 5584 4537 4923 4145 2566 4244 3539 6094 * 4642 33 9 * 7291 * * * 0 9899 0 1000 H 34 6228 6829 5423 4670 * 6777 537 * 4456 4837 * 6882 6150 5138 5395 4871 5872 * * 6583 34 0 * * * * * 0 9895 0 1691 F 35 6929 4939 6715 3217 4529 6777 3774 4344 3627 2961 3475 5943 5691 3885 3970 5340 4158 3509 7044 5331 35 9 7279 * 2807 222 0 * 9895 1000 1691 K 36 5163 6722 5477 4198 5563 5110 5441 4524 2317 3694 6914 4711 6780 3862 2165 4826 5452 4207 6865 5440 36 17 * 6455 * * * * 9931 0 0 R 37 4312 6016 5394 4620 5181 5854 4167 3723 3609 4779 5482 3926 6463 3997 2699 3399 3290 4554 6672 6716 37 21 * 6124 * * * 0 9906 0 1000 Y 38 5539 4100 6048 3926 6108 * 1449 4813 3902 4728 * 4797 5900 5185 4462 4569 4364 4593 6987 4243 38 47 6752 5457 1585 585 590 1574 9904 1000 2396 H 39 4548 5315 5188 4212 5843 5112 1549 6435 4555 4570 6632 4435 6234 4289 4016 4345 3296 6105 * 5762 39 45 6204 5887 5158 41 * 0 9893 1678 2763 D 40 4180 4920 4412 4775 6695 3350 4930 4551 3007 3981 5613 3782 7330 5970 3054 3369 4151 4297 5821 * 40 30 6230 7121 4442 68 2311 325 9867 1653 3576 P 41 4278 6858 4758 2655 6831 3753 4521 3938 3422 5882 6648 4971 4672 6094 4066 3749 3741 3236 6146 5866 41 80 4446 7006 3578 126 * 0 9927 3608 3517 N 42 5130 5522 4128 3166 5383 4238 2986 5940 2989 6638 5186 3615 5911 4763 3338 5339 3939 4004 * 6394 42 52 6174 5538 2783 226 482 1817 9917 1652 3825 F 43 4651 6657 4844 4290 6037 4864 4436 4687 3910 3665 5672 4914 3622 5158 4107 2821 3854 3286 6559 4626 43 64 5279 5828 3535 130 306 2388 9941 2329 3024 V 44 4096 4846 4352 4019 7080 3732 4502 5882 3570 4647 5150 4441 3739 5461 3067 3687 3997 4090 * 4710 44 37 6430 6197 0 * * 0 9872 1115 2094 P 45 4900 4636 3900 2784 * 5161 4520 5945 3760 4127 5557 4094 3163 6062 3878 3846 4275 4276 5876 5010 45 36 5352 * 2004 414 2298 328 9865 2247 3062 A 46 4386 3334 5859 5051 4433 4756 3897 5100 2415 4247 * 5283 4745 4459 3372 5488 4351 4554 * 3900 46 70 6125 4912 3154 172 1933 438 9882 1723 2769 A 47 5091 3643 4956 4709 5523 6664 4780 5602 3695 4405 5916 4353 2520 4372 3129 3849 3905 4396 * 5570 47 118 4120 5554 1949 432 852 1165 9900 3877 4114 F 48 * 2879 5059 5086 2436 5319 3047 6048 4406 5491 * 6878 5957 5215 5650 4766 5726 5677 6833 2096 48 11 * 6978 * * 932 1072 9941 0 3579 V 49 5114 3797 4539 3808 6015 7517 4351 4371 2791 5475 7212 5416 3678 3557 4346 3476 3430 4109 * 5926 49 35 6646 6181 5248 38 977 1023 9958 1000 2608 C 50 5655 676 4860 * 5350 4785 * 7032 4367 5330 5739 * * 5799 5324 5015 5794 7389 * 4022 50 34 * 5418 * * 429 1959 9993 0 2716 S 51 5122 3582 3700 3012 5852 3958 4411 6818 3687 5803 6727 3691 3050 5262 4347 3352 4444 6896 * 5743 51 43 * 5104 * * * 0 9939 0 2855 K 52 5277 5919 4783 2725 4315 3315 4809 3703 3617 4648 6283 4771 * 3579 4847 4554 3688 3978 * 4878 52 54 6099 5503 1000 1000 * 0 9905 1671 4228 C 53 5289 466 5492 6700 5672 5721 * 6732 6775 5613 * 5533 5702 * 5557 4831 5839 6671 * 5906 53 25 * 5842 * * 1486 637 9897 0 4845 G 54 6108 6346 3275 4218 4316 1690 5462 * 5545 3981 * 4033 4454 5181 4859 3915 4112 5547 * 4866 54 14 6689 * 1000 1000 854 1162 9874 1000 4413 K 55 4877 * 6859 4614 4465 * 6935 * 1088 7252 5672 4805 * 4166 2866 5606 5167 4461 * 4500 55 30 6407 6875 2000 415 993 1007 9901 1000 2685 T 56 3497 4671 6467 5099 6144 4113 6826 5492 4044 5782 4067 5351 6397 3775 3838 2291 3004 3735 7196 * 56 72 * 4355 * * 592 1571 9893 0 2187 F 57 5122 4587 * 6428 488 * 5850 6636 * 5346 * * * * * 5225 4490 * * 3612 57 0 * * * * 1474 644 9748 0 3806 T 58 3239 6214 5319 5799 6377 4130 4869 5639 3139 4944 6923 4159 4498 4631 3248 2505 3810 4713 6063 6222 58 13 * 6813 * * 1978 422 9795 0 2863 R 59 5944 5043 4186 4632 5923 4871 3848 5857 3968 4713 6081 4426 6380 3632 3079 2604 3418 5826 5255 4483 59 0 * * * * 936 1067 9795 0 2808 R 60 4321 * 4551 3669 5596 5768 4892 * 2405 3438 5511 4717 4914 4038 3412 3026 4458 5448 * 4805 60 0 * * * * 1000 1000 9832 0 1753 N 61 3522 4829 3481 6130 7304 6016 4706 5786 3799 5017 5224 4229 4892 4074 4254 2386 3738 4795 6842 4149 61 0 * * * * 0 * 9876 0 1000 T 62 4193 4136 4015 3425 5012 4623 3800 5312 4229 3983 6011 3117 * 4738 4514 2856 4172 6475 6860 5445 62 27 6657 6900 3170 170 * * 9931 1000 0 M 63 * 5972 6889 6471 3178 * 6688 4524 6756 905 4243 * * 6955 3971 * 6461 3869 5327 5144 63 13 6789 * 4322 74 0 * 9920 1000 1000 A 64 4432 * 5616 5008 6571 * 5567 4026 2738 4707 4521 3356 6488 2869 3205 4276 3619 4251 7315 4987 64 0 * * * * * * 9931 0 0 R 65 3436 6913 4689 3850 6084 6886 5013 3981 2862 4167 5331 3795 6415 3438 2541 4654 5228 4597 * * 65 33 5482 * 3299 155 * * 9931 2255 0 H 66 * 6987 * * * * 177 6833 * 6288 * 6900 6483 5466 6415 * 6721 * * 5481 66 9 7270 * 0 * * * 9931 1000 0 A 67 4901 7153 5644 4429 6218 * 4882 3628 4833 3038 2188 5757 6475 2720 3577 5195 5498 4135 * 5872 67 30 5597 * 0 * * * 9931 2304 0 D 68 4946 4881 4526 4732 * 5449 6648 5195 2219 3745 5324 3806 * 5176 1982 4937 4366 4708 * 7296 68 30 5621 * 0 * * * 9931 2138 0 N 69 4245 5547 5655 6765 6914 * 5718 2959 3756 4215 4431 4011 * 4986 2881 3824 2533 3539 6991 * 69 38 6196 6331 0 * * * 9931 1742 0 C 70 5815 3952 6756 6964 5742 6344 594 5098 5548 7255 6797 5578 6499 6485 7200 4739 * 4865 * 5726 70 32 6168 6919 1013 987 0 * 9911 1686 1000 A 71 4045 4852 7444 5337 * 5177 2578 5566 4156 4366 5669 3730 6284 4935 5126 3200 2032 5504 * 6797 71 33 5934 7319 1606 575 0 * 9945 1710 1000 G 72 4684 6658 4299 3265 6999 1478 5040 * 4089 5547 6065 4139 4939 5919 4322 4460 4485 4457 6325 * 72 27 5747 * 608 1540 0 * 9973 1720 1000 P 73 6048 5889 3794 1669 6502 4535 6988 4635 3152 4185 7011 5109 4845 4063 4820 5431 4194 4141 * 6588 73 28 6438 7039 1000 1000 * * 9956 1000 0 D 74 6767 * 5051 4590 6866 5129 6823 5606 1473 5616 7071 4472 5713 4589 2340 3621 4784 6656 * 4884 74 48 5357 6925 667 1434 0 * 9955 2190 1000 G 75 4553 * 4777 5955 5570 4743 6808 6922 3892 4317 5859 4488 1474 * 3981 3130 3943 4722 * 6738 75 10 7115 * 0 * 0 * 9946 1000 1000 V 76 6755 4872 6770 * 2072 6888 3213 5425 5624 4007 * 7145 6827 6896 6781 7134 5850 4465 6471 1422 76 14 6645 * 1585 585 * * 9673 1000 0 E 77 5588 7009 6500 2571 7003 5489 3906 4375 2382 5668 6732 4635 3983 4214 3881 4004 3818 4095 * 6760 77 0 * * * * * * 9699 0 0 G 78 * 264 5610 * 6881 5317 6727 * 4759 5940 * 6738 * 5321 * 5954 * * * * 78 36 5336 * 1131 880 * * 9633 2245 0 E 79 4244 * 2886 2642 * 5353 5554 5347 2732 5701 6879 4589 3554 4075 3941 3413 4102 * * * 79 0 * * * * * * 9600 0 0 N 80 * * 4370 2210 4888 6345 4183 4152 3992 3982 6162 4872 6724 2945 5075 4232 4571 3339 * 4612 80 0 * * * * * * 9595 0 0 S 81 6863 247 6695 6544 * * * * 6736 6688 * 7157 * 6851 7154 3952 * 6976 * 6165 81 0 * * * * * * 9494 0 0 G 82 5229 6591 3422 4755 6679 816 * * 5792 * * 4171 3850 * 6186 3905 5800 * 6187 * 82 0 * * * * * * 9412 0 0 P 83 3720 * 4685 4970 * 6275 * * 818 * * 6428 4793 4169 3910 6130 6136 * * 3742 83 0 * * * * * * 9051 0 0 S 84 2304 * 5952 6169 * 6219 5799 * 4020 * * 6100 6435 3634 3263 1811 3116 3985 * * 84 0 * * * * * * 8925 0 0 S 85 3868 6014 * * 476 * * * * * * * * * * 4004 4857 * 6037 3557 85 0 * * * * * * 8551 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * 0 * * * 5171 0 0 //