HHsearch 1.5 NAME c1x5wA_ FAM FILE c1x5wA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c1x5wA_.a3m DATE Mon Mar 8 23:00:16 2010 LENG 70 match states, 70 columns in multiple alignment FILT 129 out of 17966 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 8.1 EVD 0.5373 1.9170 SEQ >ss_dssp CCSCCCCCSEECSSSSCEESSHHHHHHHHGGGCCSCSEECSSSSCEESSHHHHHHHHHHHHSSSCCSSCC >sa_dssp EEEEEEEDEDEBEEDEDCCEEDECBEEBDEEDEDEEEDDBEEDECCBEDDDDCEEACEEECCEDEEEEEE >ss_pred CCCCCCCCCEECCCCCCEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >ss_conf 9876688879987688865358674031543222222335421220416468531255338886899887 >Consensus gsxxsxxkpxxCxxCxxxfxxxxxlxxHxxxhxxxxxxxCxxCxxxfxxxxxLxxHxxxhxxexxxxxxG >c1x5wA_ GSSGSSGHPEKCSECSYSCSSKAALRIHERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMSGPSSG >UniRef50_Q7PRW6(45-110:262) AGAP000507-PA (Fragment) n=1 Tax=Anopheles gambiae RepID=Q7PRW6_ANOGA E=1e-05 s/c=0.78 id=22% cov=93% --AGNRSHRYKCDHCEQTFKRRDEHDRHRYTHTGVHAYPClePDCGKAYSNRSHLLRHVRACHLESAG---- >UniRef50_Q6NW60(304-375:457) Sp1 transcription factor n=1 Tax=Danio rerio RepID=Q6NW60_DANRE E=2e-14 s/c=1.11 id=22% cov=96% GRDPSKKKQHICHIpgCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPfvCSWSFCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKF---- >UniRef50_Q7QH10(388-458:531) AGAP010982-PA (Fragment) n=1 Tax=Anopheles gambiae RepID=Q7QH10_ANOGA E=1e-06 s/c=0.76 id=20% cov=99% -ASSPTEEPsqFQCDLCHKKFPYNCYLTMHMRKNHDKsKPYGCKVCHYRFGYRGTLLRHQLIHSSQRVQPGS- >UniRef50_B0WL29(460-525:659) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Culex quinquefasciatus RepID=B0WL29_CULQU E=1e-05 s/c=0.78 id=21% cov=94% ----ATEKEFSCKVCGKEFATLLAVQSHMKIKHSEQEFKCGFCERSYSSDQSRRFHEKKHAKDAGYQAS- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 5089 0 0 S 2 2542 * 4280 5340 5597 * 5532 * * * * 3719 5139 * 4518 1022 4504 5302 * * 2 0 * * * * * * 6888 0 0 S 3 2794 5532 4675 5124 * * 3809 3071 5638 5563 * * * * * 2261 3332 2140 * * 3 0 * * * * * * 7121 0 0 G 4 5712 * 5564 4357 * 2047 2387 * 5120 * * 3940 5611 2993 5570 2715 3955 * * * 4 0 * * * * * * 7164 0 0 S 5 3496 * 4931 5075 6199 5890 * * 2745 5924 * 6214 3362 5863 5868 1285 3570 6249 * * 5 0 * * * * * * 7620 0 0 S 6 3840 * 3679 2462 5954 3577 * * 4030 4738 * 3108 6350 5034 4676 2832 3895 4582 * 5338 6 16 * 6545 * * * * 7753 0 0 G 7 4415 6629 4284 1478 * 2673 * * 3600 * * 4164 4811 4961 4438 3970 4424 6222 * * 7 0 * * * * 0 * 7890 0 1000 H 8 * * 6172 5569 5650 3841 4844 * 1226 6702 6400 4263 4872 4659 2124 5663 5914 * * * 8 0 * * * * * * 7926 0 0 P 9 * * 5741 5839 * 6252 * 6478 3997 6124 6600 5203 703 3993 3476 6711 4359 * * * 9 25 7007 6769 1000 1000 * * 8012 1000 0 E 10 * 5998 6139 6008 1418 * 2945 6674 5260 * * * * 6826 * 5585 * 5472 * 1464 10 10 7226 * 1585 585 * 0 8402 1000 1000 K 11 5147 * * 2638 7358 4989 6804 4504 2391 7467 5248 4651 3774 2795 3912 4141 5102 4053 * 5132 11 0 * * * * 0 * 8417 0 1000 C 12 * 101 * * * 6237 * * * * * * * * 6167 5345 * * 5962 * 12 0 * * * * * * 8421 0 0 S 13 5193 6699 3027 2753 * 5408 6126 * 3053 6511 * 3295 2781 4796 3890 3549 3700 6739 * * 13 22 6047 * 559 1639 * * 8425 1652 0 E 14 5421 * 4349 2648 4357 6535 3702 3205 4811 3627 5955 5361 * 3933 5225 5953 4988 2967 6970 3467 14 55 4747 * 1275 769 * * 8425 2909 0 C 15 * 123 * * 5969 * * * * * * * * 5678 * 5342 * * * 5532 15 19 6234 * 2322 322 * * 8423 1000 0 S 16 6063 * 3143 3588 * 1832 4376 6907 5411 5661 5813 3675 3495 4673 3887 3672 6803 * 6173 6028 16 0 * * * * * * 8423 0 0 Y 17 5567 7134 7234 4198 3343 * 7025 * 1553 5056 5622 4828 * 4198 3427 6513 4776 4266 * 2932 17 0 * * * * * * 8423 0 0 S 18 2768 6098 * 5470 7341 3673 * 4905 3588 5692 5988 6758 5024 5025 3094 2659 3155 3043 * * 18 8 7544 * 0 * * * 8423 1000 0 C 19 4440 6018 * 7176 875 6624 6750 5642 * 4682 * 6955 6879 * * 4274 3434 5540 * 2994 19 0 * * * * * * 8423 0 0 S 20 3644 5989 4579 4735 6488 5712 6017 5418 2991 4475 6879 4259 4344 6567 3494 2548 3165 4391 * 4454 20 0 * * * * * * 8423 0 0 S 21 6204 6150 4058 5403 5609 5365 5059 6855 4215 4545 * 3890 * 3522 2815 3012 2285 7226 6078 4026 21 10 7127 * 1585 585 * * 8423 1000 0 K 22 3704 * 6535 4007 5347 5084 5463 * 2151 4094 5064 4099 4353 4393 2952 3431 5328 5441 * 4826 22 7 7657 * 1000 1000 * * 8423 1000 0 A 23 3428 6378 3879 4548 6310 3655 4345 6047 3973 6141 5904 4289 5118 5613 3888 2198 3587 5112 7018 5172 23 0 * * * * * * 8423 0 0 A 24 4039 6016 3314 3881 * 4396 2971 6624 4167 5780 4744 2814 * 4455 4591 2781 4272 7238 * 5277 24 0 * * * * * * 8423 0 0 L 25 7499 6513 * * 3183 * 7237 4266 7127 855 3905 7197 5275 * 4653 6535 * 3768 * 4993 25 0 * * * * * * 8423 0 0 R 26 5207 * 4588 3407 5442 6824 4347 4496 2795 4204 6912 4312 6528 3133 3200 3555 3492 5036 5908 * 26 0 * * * * * * 8423 0 0 I 27 3931 * 4942 4201 5900 6176 * 3424 3423 5702 5428 4531 5810 3946 2074 4648 3560 3719 * 5374 27 0 * * * * * * 8423 0 0 H 28 * * 5455 6258 * * 136 * * 6364 * * 5467 6582 * * * * * 6811 28 48 4940 * 642 1478 * * 8423 2608 0 E 29 5399 5553 * 3275 4978 * 6528 3318 3862 2581 2696 5727 6258 2967 4448 5141 5101 4387 * 7030 29 55 4749 * 2140 371 * * 8423 3188 0 R 30 4693 5591 * 5285 6044 7343 4571 4669 2273 4266 4697 5336 6737 3701 1719 4195 6972 5298 * 6378 30 70 4586 7534 0 * * * 8423 3055 0 I 31 3983 5703 6231 5533 4641 * 5321 2839 3417 6298 6822 4960 6481 4404 4589 3676 2318 3206 6035 5147 31 51 5233 6895 0 * * 0 8429 2699 1000 H 32 6628 5147 7018 5604 * 5653 705 6793 4522 5093 7052 5611 6254 4868 5214 4149 5964 4523 * * 32 35 6086 6727 1000 1000 1000 1000 8414 1711 1697 C 33 3927 6251 6217 4815 6846 5085 2217 3995 5893 3973 * 3774 4553 6030 5698 3296 2394 5308 * 6966 33 51 4860 * 1583 586 0 * 8388 3039 1727 T 34 4508 6897 3530 3554 6879 1978 6330 4952 3846 5787 * 3874 3984 5008 4811 4467 3997 4003 6258 * 34 70 4401 * 1974 424 * * 8423 3701 0 D 35 4382 * 3508 1919 5716 3635 5035 5117 4013 5726 * 4342 4364 4138 3949 5187 4225 4784 * 5419 35 53 5084 7307 1067 936 * * 8423 2673 0 R 36 6803 * 6253 3435 4676 5070 5071 5817 1634 4565 * 5113 4673 4414 2703 4889 4229 6233 6257 5477 36 44 5360 7382 0 * 0 * 8424 2316 1000 P 37 3637 5416 5230 5175 5707 4549 5557 5519 3608 3563 5964 4735 1831 5394 4427 3761 4473 5143 * 5778 37 101 3890 * 1273 770 0 * 8424 4468 1000 F 38 5887 4489 7030 * 1950 5115 3371 5469 6090 4360 6258 * 5574 6914 6238 * 4626 5102 4770 1743 38 15 6639 * 2807 222 * * 8423 1000 0 K 39 4751 5869 4609 3837 5777 5420 4727 6036 1877 5498 6269 5254 5775 3443 3588 4482 4002 3726 6855 5505 39 23 7019 7003 1585 585 * * 8423 1000 0 C 40 6823 320 * 6682 * * * 6763 * * * 5707 6930 * 4549 4880 5864 * 5866 4934 40 10 7231 * 1000 1000 0 * 8437 1000 1000 N 41 4898 4926 2594 4355 5690 5337 4981 6116 4016 5531 6187 3166 2834 5394 6167 3331 3332 5517 * 5515 41 23 6991 6914 0 * * * 8423 1000 0 Y 42 5896 6996 4480 2868 4631 * 3880 3226 4125 2904 6826 6758 * 3355 4918 5161 4984 3475 * 3487 42 62 4573 * 579 1597 0 * 8407 3367 1000 C 43 * 131 * * * 5231 * * * * * * * 6234 * 5806 * * * 5094 43 9 7340 * 2000 415 * * 8423 1000 0 S 44 4949 6790 2805 4929 7243 1682 4279 * 4574 4663 * 4065 3865 5674 4738 3097 6258 * 5969 * 44 15 6639 * 1000 1000 * * 8423 1000 0 F 45 4147 * 6010 4089 3119 * 5694 6829 1870 4818 5624 4980 * 4494 3063 5913 5628 5052 6624 3013 45 0 * * * * * * 8423 0 0 D 46 3791 4806 5884 5498 5054 3724 6826 4228 4018 5963 * 4818 * 4329 3745 2241 2723 3985 7222 6100 46 13 6790 * 3000 193 * * 8423 1000 0 T 47 4178 3564 * * 986 * 6567 6639 * 4730 6743 * 6684 * * 3436 3808 6002 6997 3460 47 14 6684 * 2000 415 * * 8423 1000 0 K 48 3953 7056 5852 5859 5484 4781 7134 4698 3198 5230 5977 4123 3444 6000 3099 2628 3229 4172 * 4968 48 13 6782 * 4170 82 * * 8423 1000 0 Q 49 * 6242 4582 4732 7180 5327 3571 5761 5467 4359 * 3905 6703 4374 2575 2601 3348 7019 3945 3764 49 0 * * * * * * 8423 0 0 P 50 4616 7006 7096 5113 5840 * 5437 6826 2322 4425 6110 3963 3173 3939 2899 2811 5490 5303 5432 5849 50 13 * 6762 * * * * 8423 0 0 S 51 3323 7196 3275 4368 * 3662 5371 * 4651 4487 * 5515 4508 4038 4204 2440 3952 4651 6133 3836 51 0 * * * * 0 * 8398 0 1000 N 52 3688 6305 3359 3263 * 4401 4155 6513 4757 4656 5896 3001 * 3720 4751 2655 4451 7372 6209 4704 52 0 * * * * * * 8423 0 0 L 53 * * * * 4045 * * 3622 6864 599 3864 * 7003 * 5357 * * 4475 5747 5319 53 0 * * * * * * 8423 0 0 S 54 4144 7152 5053 3846 * 6975 5712 4195 2435 4690 7006 3660 6823 3376 3295 3720 3549 4799 6624 5052 54 0 * * * * * * 8423 0 0 K 55 3570 6787 6933 3446 5975 4817 5376 5120 2584 5066 4879 5170 7019 3881 2501 4856 4321 3771 * 4870 55 0 * * * * * * 8423 0 0 H 56 * 5315 * * * * 37 * * * * * * * * * * * * * 56 41 5156 * 2752 232 * * 8423 2670 0 M 57 * 7404 * 3734 5103 7387 5924 3285 4159 2787 2639 * 6364 2955 4424 5916 4634 3218 * 4282 57 20 6176 * 0 * * * 8423 1748 0 K 58 4074 * 4830 4209 6550 6905 * 6153 2002 3691 5352 4581 * 3814 1872 6092 4590 5355 * * 58 15 6568 * 0 * * * 8386 1660 0 K 59 4294 5848 * 4501 5948 6214 * 3397 3081 3871 6831 4558 * 6212 3377 3300 2284 3399 * 6186 59 0 * * * * * * 8354 0 0 F 60 5090 5486 7066 5299 5720 5971 652 5633 4330 7385 6633 5880 6734 5790 5543 6169 7181 4413 * 5345 60 0 * * * * * * 8348 0 0 H 61 4398 * 6969 6282 * 5301 1339 4840 5251 6814 * 5190 5291 6576 4740 2768 2604 5545 * 7086 61 55 5054 7088 2152 368 * * 8249 2117 0 G 62 4661 6442 3875 3736 * 1436 6538 6620 4289 5197 * 4990 3306 5198 4085 4007 5807 4713 * * 62 0 * * * * 0 * 8115 0 1000 D 63 4882 * 2262 1323 * 4316 * * 3330 * * 5258 6181 4507 5051 5362 5084 5914 6752 6102 63 0 * * * * * * 8143 0 0 M 64 4597 6551 5091 2830 6184 6402 5499 5666 1783 5442 5650 * 6151 3872 3499 3950 3594 4310 * 6873 64 0 * * * * * * 8077 0 0 S 65 3860 6532 4580 4329 * 6310 * 5656 4310 4676 6144 3902 1756 4053 4102 3522 4002 4403 * 6116 65 16 6465 * 0 * * * 7970 1000 0 G 66 3479 5433 * 4311 2915 3212 3936 * 6363 5206 * 5934 6431 3781 4780 3716 6395 * * 1906 66 0 * * * * * * 7858 0 0 P 67 4246 * * 2977 * 5546 * * 4210 5514 * * 1092 2293 * * * 5941 * 4901 67 0 * * * * * * 7337 0 0 S 68 3093 3195 * 4537 * 2680 * * 3063 * * 3223 3284 4358 * 3418 4208 4360 * * 68 0 * * * * * * 6971 0 0 S 69 2574 4109 4691 4857 * * 3702 * 4952 * * 5138 3090 * * 1350 5140 5317 * * 69 0 * * * * * * 6664 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * 0 * * * 5596 0 0 //