HHsearch 1.5 NAME c1qysA_ FAM FILE c1qysA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c1qysA_.a3m DATE Thu Mar 11 17:45:43 2010 LENG 92 match states, 92 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3616 -1.7398 SEQ >ss_dssp CEEEEEEEECSSCEEEEEEEESSSSHHHHHHHHHHHHHHHHCCSEEEEEEECSSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCEEEEEEETTEEEEEEEC >sa_dssp EBCBCBBBDCEECECDCDCEBEDEDDACCBCCDBCEDBEEDDACBBDBBADBCEDECADCABDCADECBDDCCAEECDDDDEEDCACACADE >ss_pred CEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEEEC >ss_conf 90799998258828899999832479999999999999726771699999854758899999999999985297505799816179997429 >Consensus xvxixixIxxxGxxxxxxxxVsTxxELxrxLxELxxxlxrxGArxVxItIsAxxxxxAxxxxxlixrxxxxLGYxDINVxxxGxxVxiExxx >c1qysA_ DIQVQVNIDDNGKNFDYTYTVTTESELQKVLNELXDYIKKQGAKRVRISITARTKKEAEKFAAILIKVFAELGYNDINVTFDGDTVTVEGQL >UniRef50_UPI00017BDAF0(6-93:96) UPI00017BDAF0 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI00017BDAF0 E=6e-22 s/c=1.19 id=29% cov=97% -VDITIKIQRDGQEIEIDIRVSTGKELERALQELEKALARAGARNVQITISAENDEQAKELLELIARLLQKLGYKDINVRVNGTEVKIE--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 1016 * * * * * * * * * 984 * * 2 0 * * * * * * 1617 0 0 Q 3 * * 984 * * * * * * * * * * 1016 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1617 0 0 V 4 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * 1016 * * 4 0 * * * * * * 1617 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 1016 * * 984 * * * 5 0 * * * * * * 1617 0 0 V 6 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * 1016 * * 6 0 * * * * * * 1617 0 0 N 7 * * * * * * * * 984 * * 1016 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1617 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1617 0 0 D 9 * * 1016 * * * * * * * * * * 984 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1617 0 0 D 10 * * 1016 * * * * * * * * * * * 984 * * * * * 10 0 * * * * * * 1617 0 0 N 11 * * 984 * * * * * * * * 1016 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1617 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1617 0 0 K 13 * * * * * * * * 1016 * * * * 984 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1617 0 0 N 14 * * * 984 * * * * * * * 1016 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1617 0 0 F 15 * * * * 1016 * * 984 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1617 0 0 D 16 * * 1016 984 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1617 0 0 Y 17 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * * * 1016 17 0 * * * * * * 1617 0 0 T 18 * * 984 * * * * * * * * * * * * * 1016 * * * 18 0 * * * * * * 1617 0 0 Y 19 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * * * 1016 19 0 * * * * * * 1617 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * 984 * 1016 * * * 20 0 * * * * * * 1617 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1617 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * 984 1016 * * * 22 0 * * * * * * 1617 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1617 0 0 E 24 * * * 1016 * 984 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1617 0 0 S 25 * * * * * * * * 984 * * * * * * 1016 * * * * 25 0 * * * * * * 1617 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1617 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1617 0 0 Q 28 * * * 984 * * * * * * * * * 1016 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1617 0 0 K 29 * * * * * * * * 1016 * * * * * 984 * * * * * 29 0 * * * * * * 1617 0 0 V 30 984 * * * * * * * * * * * * * * * * 1016 * * 30 0 * * * * * * 1617 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1617 0 0 N 32 * * * * * * * * * * * 1016 * 984 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1617 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1617 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1617 0 0 X 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 D 36 * * 1016 * * * * * 984 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1617 0 0 Y 37 984 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1016 37 0 * * * * * * 1617 0 0 I 38 * * * * * * * 1016 * 984 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1617 0 0 K 39 984 * * * * * * * 1016 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1617 0 0 K 40 * * * * * * * * 1016 * * * * * 984 * * * * * 40 0 * * * * * * 1617 0 0 Q 41 984 * * * * * * * * * * * * 1016 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1617 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1617 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1617 0 0 K 44 * * * * * * * * 1016 * * * * * 984 * * * * * 44 0 * * * * * * 1617 0 0 R 45 * * * * * * * * * * * 984 * * 1016 * * * * * 45 0 * * * * * * 1617 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1617 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * 984 1016 * * * * * 47 0 * * * * * * 1617 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1617 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 1016 984 * * * 49 0 * * * * * * 1617 0 0 I 50 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1617 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * 984 1016 * * * 51 0 * * * * * * 1617 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1617 0 0 R 53 * * * 984 * * * * * * * * * * 1016 * * * * * 53 0 * * * * * * 1617 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * 984 * * * * 1016 * * * 54 0 * * * * * * 1617 0 0 K 55 * * 984 * * * * * 1016 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1617 0 0 K 56 * * * 984 * * * * 1016 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1617 0 0 E 57 * * * 1016 * * * * * * * * * 984 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1617 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1617 0 0 E 59 * * * 1016 * * * * 984 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1617 0 0 K 60 * * * 984 * * * * 1016 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1617 0 0 F 61 * * * * 1016 * * * * 984 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1617 0 0 A 62 1016 * * * * * * * * 984 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1617 0 0 A 63 1016 * * 984 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1617 0 0 I 64 * * * * * * * 1016 * 984 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1617 0 0 L 65 * * * * * * * 984 * 1016 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1617 0 0 I 66 984 * * * * * * 1016 * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1617 0 0 K 67 * * * * * * * * 1016 * * * * * 984 * * * * * 67 0 * * * * * * 1617 0 0 V 68 * * * * * * * * * 984 * * * * * * * 1016 * * 68 0 * * * * * * 1617 0 0 F 69 * * * * 1016 * * * * 984 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1617 0 0 A 70 1016 * * * * * * * * * * * * 984 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1617 0 0 E 71 * * * 1016 * * * * 984 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1617 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1617 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1617 0 0 Y 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 74 0 * * * * * * 1617 0 0 N 75 * * * * * * * * 984 * * 1016 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1617 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1617 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1617 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1617 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1617 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * 984 * 1016 * * * 80 0 * * * * * * 1617 0 0 F 81 * * * * 1016 * * * * * * * * * * * * 984 * * 81 0 * * * * * * 1617 0 0 D 82 * * 1016 * * * * * * * * 984 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1617 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1617 0 0 D 84 * * 1016 * * * * * * * * * * * * * 984 * * * 84 0 * * * * * * 1617 0 0 T 85 * * * 984 * * * * * * * * * * * * 1016 * * * 85 0 * * * * * * 1617 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1617 0 0 T 87 * * * * * * * * 984 * * * * * * * 1016 * * * 87 0 * * * * * * 1617 0 0 V 88 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * 1016 * * 88 0 * * * * * * 1617 0 0 E 89 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1617 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 91 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //