Email m.sternberg@imperial.ac.uk Description KCJ11_HUMAN_ATP-sensitive_inward_rectifier_potassium_channel_11_ Date Wed Jun 17 23:05:45 BST 2015 Unique Job ID a9ffd763295ff236

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	S	R	K	G	I	I	P	E	E	Y	V	L	T	R	L	A	E	D	P	A	E	P	R	Y	R	A	R	Q	R	R	A	R	F	V	S	K	K	G	N	C	N	V	A	H	K	N	I	R	E	Q	G	R	F	L	Q	D	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?		?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	T	L	V	D	L	K	W	P	H	T	L	L	I	F	T	M	S	F	L	C	S	W	L	L	F	A	M	A	W	W	L	I	A	F	A	H	G	D	L	A	P	S	E	G	T	A	E	P	C	V	T	S	I	H	S	F	S	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	L	F	S	I	E	V	Q	V	T	I	G	F	G	G	R	M	V	T	E	E	C	P	L	A	I	L	I	L	I	V	Q	N	I	V	G	L	M	I	N	A	I	M	L	G	C	I	F	M	K	T	A	Q	A	H	R	R	A	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?																																				?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	I	F	S	K	H	A	V	I	A	L	R	H	G	R	L	C	F	M	L	R	V	G	D	L	R	K	S	M	I	I	S	A	T	I	H	M	Q	V	V	R	K	T	T	S	P	E	G	E	V	V	P	L	H	Q	V	D	I	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	N	G	V	G	G	N	S	I	F	L	V	A	P	L	I	I	Y	H	V	I	D	A	N	S	P	L	Y	D	L	A	P	S	D	L	H	H	H	Q	D	L	E	I	I	V	I	L	E	G	V	V	E	T	T	G	I	T	T	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?		?																														?																?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	T	S	Y	L	A	D	E	I	L	W	G	Q	R	F	V	P	I	V	A	E	E	D	G	R	Y	S	V	D	Y	S	K	F	G	N	T	I	K	V	P	T	P	L	C	T	A	R	Q	L	D	E	D	H	S	L	L	E	A	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Sequence		L	A	S	A	R	G	P	L	R	K	R	S	V	P	M	A	K	A	K	P	K	F	S	I	S	P	D	S	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered ( 23%)
	Alpha helix ( 32%)
	Beta strand ( 30%)
	TM helix ( 14%)