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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d2cqda1 | Ferredoxin-like | RNA-binding domain, RBD | Canonical RBD |
Added to library: Tue Mar 16 12:33:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | H | G | S | Q | K | D | T | T | F | T | K | I | F | V | G | G | L | P | Y | H | T | T | D | A | S | L | R | K | Y | F | E | G | F | G | D | I | E | E | A | V | V | I | T | D | R | Q | T | G | K | S | R | G | Y | G | F | V | T | M | A | D | R | A | A | A | E | R | A | C | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | D | P | N | P | I | I | D | G | R | K | A | N | V | N | L | A | Y | L | G | A | K | P | R | S | L | Q | T | G | F | A | I | G | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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