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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1n54b_ | Ferredoxin-like | RNA-binding domain, RBD | Canonical RBD |
Added to library: Tue Mar 16 12:11:30 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | K | A | L | R | S | D | S | Y | V | E | L | S | Q | Y | R | D | Q | H | F | R | G | D | N | E | E | Q | E | K | L | L | K | K | S | C | T | L | Y | V | G | N | L | S | F | Y | T | T | E | E | Q | I | Y | E | L | F | S | K | S | G | D | I | K | K | I | I | M | G | L | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . |
Sequence | M | K | K | T | A | C | G | F | C | F | V | E | Y | Y | S | R | A | D | A | E | N | A | M | R | Y | I | N | G | T | R | L | D | D | R | I | I | R | T | D | W | D | A | G | F | K | E | G | R | Q | Y | G | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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