| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c2qk2A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: lp04448p; | PDBTitle: structural basis of microtubule plus end tracking by xmap215, clip-1702 and eb1 |
Added to library: Tue Mar 16 13:28:03 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | G | S | H | X | D | L | L | D | P | V | D | I | L | S | K | X | P | K | D | F | Y | D | K | L | E | E | K | K | W | T | L | R | K | E | S | L | E | V | L | E | K | L | L | T | D | H | P | K | L | E | N | G | E | Y | G | A | L | V | S | A | L | K | K | V | I | T | K | D | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | V | L | V | A | X | A | G | K | C | L | A | L | L | A | K | G | L | A | K | R | F | S | N | Y | A | S | A | C | V | P | S | L | L | E | K | F | K | E | K | K | P | N | V | V | T | A | L | R | E | A | I | D | A | I | Y | A | S | T | S | L | E | A | Q | Q | E | S | I | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | L | S | N | K | N | P | S | V | K | S | E | T | A | L | F | I | A | R | A | L | T | R | T | Q | P | T | A | L | N | K | K | L | L | K | L | L | T | T | S | L | V | K | T | L | N | E | P | D | P | T | V | R | D | S | S | A | E | A | L | G | T | L | I | K | L | X | G | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | T | P | L | L | A | D | V | D | P | L | K | X | A | K | I | K | E | C | Q | E | K | A | E | I | K | I | K | V | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|