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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1m1jA_ | PDB header: blood clotting | Chain: A: PDB Molecule: fibrinogen alpha subunit; | PDBTitle: crystal structure of native chicken fibrinogen with two2 different bound ligands |
Added to library: Tue Mar 16 13:10:08 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | C | K | Y | E | K | N | W | P | I | C | V | D | D | D | W | G | T | K | C | P | S | G | C | R | M | Q | G | I | I | D | D | T | D | Q | N | Y | S | Q | R | I | D | N | I | R | Q | Q | L | A | D | S | Q | N | K | Y | K | T | S | N | R | V | I | V | E | T | I | N | I | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | G | L | E | G | A | Q | Q | L | D | E | N | Y | G | H | V | S | T | E | L | R | R | R | I | V | T | L | K | Q | R | V | A | T | Q | V | N | R | I | K | A | L | Q | N | S | I | Q | E | Q | V | V | E | M | K | R | L | E | V | D | I | D | I | K | I | R | A | C | K | G | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | |||||||||||
Sequence | A | R | S | F | D | Y | Q | V | D | K | E | G | Y | D | N | I | Q | K | H | L | T | Q | A | S | S | I | D | M | H | P | D | F | Q | T | T | T | L | S | T | L | K | M | R | P | L | K | D | S | N | V | P | E | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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