Phyre 2 Results for P03949

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	P03949
Date	Fri May 3 21:46:51 BST 2013
Unique Job ID	d5e13bb67019227a

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M G H S H S T G K E I N D N E L F T C E D P V F D Q P V A S P K S E I S S K L A E E I E R S K S P L I L E V S P R T P D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?
?
?
? ? ?
? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence S V Q M F R P T F D T F R P P N S D S S T F R G S Q S R E D L V A C S S M N S V N N V H D M N T V S S S S S S S A P L F

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence V A L Y D F H G V G E E Q L S L R K G D Q V R I L G Y N K N N E W C E A R L Y S T R K N D A S N Q R R L G E I G W V P S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence N F I A P Y N S L D K Y T W Y H G K I S R S D S E A I L G S G I T G S F L V R E S E T S I G Q Y T I S V R H D G R V F H

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence Y R I N V D N T E K M F I T Q E V K F R T L G E L V H H H S V H A D G L I C L L M Y P A S K K D K G R G L F S L S P N A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence P D E W E L D R S E I I M H N K L G G G Q Y G D V Y E G Y W K R H D C T I A V K A L K E D A M P L H E F L A E A A I M K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
?
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence D L H H K N L V R L L G V C T H E A P F Y I I T E F M C N G N L L E Y L R R T D K S L L P P I I L V Q M A S Q I A S G M

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence S Y L E A R H F I H R D L A A R N C L V S E H N I V K I A D F G L A R F M K E D T Y T A H A G A K F P I K W T A P E G L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence A F N T F S S K S D V W A F G V L L W E I A T Y G M A P Y P G V E L S N V Y G L L E N G F R M D G P Q G C P P S V Y R L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence M L Q C W N W S P S D R P R F R D I H F N L E N L I S S N S L N D E V Q K Q L K K N N D K K L E S D K R R S N V R E R S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence D S K S R H S S H H D R D R D R E S L H S R N S N P E I P N R S F I R T D D S V S F F N P S T T S K V T S F R A Q G P P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence F P P P P Q Q N T K P K L L K S V L N S N A R H A S E E F E R N E Q D D V V P L A E K N V R K A V T R L G G T M P K G Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence R I D A Y L D S M R R V D S W K E S T D A D N E G A G S S S L S R T V S N D S L D T L P L P D S M N S S T Y V K M H P A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence S G E N V F L R Q I R S K L K K R S E T P E L D H I D S D T A D E T T K S E K S P F G S L N K S S I K Y P I K N A P E F

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence S E N H S R V S P V P V P P S R N A S V S V R P D S K A E D S S D E T T K D V G M W G P K H A V T R K I E I V K N D S Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence P N V E G E L K A K I R N L R H V P K E E S N T S S Q E D L P L D A T D N T N D S I I V I P R D E K A K V R Q L V T Q K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence V S P L Q H H R P F S L Q C P N N S T S S A I S H S E H A D S S E T S S L S G V Y E E R M K P E L P R K R S N G D T K V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence V P V T W I I N G E K E P N G M A R T K S L R D I T S K F E Q L G T A S T I E S K I E E A V P Y R E H A L E K K G T S K

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ?
?
? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence R F S M L E G S N E L K H V V P P R K N R N Q D E S G S I D E E P V S K D M I V S L L K V I Q K E F V N L F N L A S S E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence I T D E K L Q Q F V I M A D N V Q K L H S T C S V Y A E Q I S P H S K F R F K E L L S Q L E I Y N R Q I K F S H N P R A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
?
?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . .

Sequence K P V D D K L K M A F Q D C F D Q I M R L V D R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ?
? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand