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|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
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| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 492 | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 510 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 520 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 530 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 540 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 550 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 560 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 570 | . |
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | L | F | T | T | P | K | R | L | I | S | S | P | K | T | S | K | S | S | T | P | T | P | L | R | R | R | A | E | I | S | S | P | K | I | L | R | S | S | F | S | G | A | I | R | K | S | L | S | T | P | D | S | V | K | V | E | T | A | V | T | V | T | A | L | F | E | F | A | K | S | S | A | E | T | M | S | I | E | Q | G |
| Template Sequence |   | S | S | G | S | S | G | R | L | L | D | L | E | N | I | Q | I | P | D | A | P | P | P | I | P | K | E | P | S | N | Y | D | F | S | G | P | S | S | G | I | E | G | R | G | S | S | G | S | S | G | S | S | G | S | S | G | D | K | E | R | H | G | V | A | I | Y | N | F | Q | G | S | G | A | P | Q | L | S | L | Q | I | G |
| Template Known Secondary structure |   | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | S | B | S | T | T | B | B | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 2 | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . |
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|   |   | 572 | . | . | . | . | . | . | . | 580 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 590 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 600 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 610 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | E | I | L | L | V | L | E | H | D | H | G | D | G | W | T | R | T | K | N | C | R | K | H | N | E | E | S | G | F | V | P | T | S | Y | L | Q | F | P | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | D | V | V | R | I | Q | E | T | C | G | . | D | W | Y | R | G | Y | . | . | L | I | K | H | K | M | L | Q | G | I | F | P | K | S | F | I | H | I | K | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | . | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | G | G | G | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 82 | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | |||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | |||||||||
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