Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q965N4 Date Fri May 3 21:39:00 BST 2013 Unique Job ID 971f5ce47b1bdda5

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	D	D	G	P	P	G	S	S	G	A	S	K	G	Y	W	K	Q	N	L	Y	L	L	Q	E	K	A	P	K	P	N	A	V	L	C	R	K	P	L	Q	Q	R	P	R	H	F	G	A	E	F	H	G	L	I	D	R	N	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	K	M	L	L	E	A	G	E	G	S	Y	L	V	R	E	S	N	R	S	R	D	A	C	T	L	C	M	I	F	D	A	K	V	M	N	Y	K	L	Y	Y	D	G	Q	F	Y	V	G	E	K	R	F	D	T	M	D	L	L	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?						?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	G	L	I	S	M	F	V	D	L	H	A	A	D	Y	I	K	R	M	A	D	E	A	I	Y	E	D	S	P	Y	S	R	Y	T	N	A	A	A	T	T	S	D	I	V	R	R	P	V	T	R	A	H	N	F	T	S	Y	T	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?		?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	P	H	Y	C	D	Y	C	R	N	F	L	W	G	L	V	H	Q	G	M	R	C	E	D	C	G	F	A	A	H	K	K	C	S	E	K	T	L	H	D	C	V	P	D	S	K	Y	V	K	R	M	F	G	V	D	I	T	T	L	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																	?				?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	A	H	G	A	D	L	P	P	I	V	P	L	C	I	G	E	V	E	S	R	G	L	D	V	E	G	I	Y	R	V	S	G	S	Y	D	H	M	E	K	L	K	Q	Q	F	D	S	N	Q	Y	V	D	L	A	T	V	C	D	I	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	C	G	L	L	K	L	Y	F	R	L	L	P	Q	Q	L	I	P	F	S	V	H	K	Q	L	L	V	A	Y	Q	E	T	N	Q	R	S	T	H	E	R	E	R	Q	I	R	K	V	M	M	E	L	S	D	A	N	I	I	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	A	V	L	A	H	L	K	K	V	A	D	H	S	A	K	N	K	M	T	V	E	N	L	A	T	I	F	S	P	T	L	F	C	S	G	S	I	P	A	M	P	N	H	Q	L	L	H	F	L	I	N	N	P	R	V	V	P	K	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand