Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description G5EC24 Date Fri May 3 21:06:01 BST 2013 Unique Job ID 84e226cc6a76541a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	R	L	A	L	R	Q	Y	N	F	Y	Y	R	V	N	G	E	K	A	E	E	L	L	K	E	Y	G	E	D	G	D	F	L	L	R	Y	S	E	S	N	P	Q	N	F	S	I	S	V	R	V	A	E	D	K	I	L	H	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?		?		?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	T	K	Y	E	S	D	M	L	S	I	F	E	D	E	R	T	T	P	N	Q	F	G	S	I	T	E	L	A	E	F	Y	M	E	F	P	E	K	L	R	E	K	N	G	L	F	L	E	L	K	K	P	V	Y	V	P	Y	H	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?																																								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	C	A	E	E	Q	R	R	T	Q	L	Y	R	W	W	H	G	N	L	P	A	S	S	A	N	K	L	L	Q	T	E	K	N	G	T	Y	L	L	R	A	S	Q	H	I	P	G	A	L	V	I	S	A	K	T	E	G	Q	V	V	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?													?													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	T	I	Y	Q	D	P	S	T	G	R	F	N	I	D	G	D	R	T	K	F	Q	S	A	W	L	L	I	D	S	Y	S	K	N	P	I	V	E	K	G	E	A	S	R	V	L	Y	L	E	E	P	L	F	N	T	F	I	E	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?																?	?	?	?	?	?		?	?	?	?		?	?	?		?				?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	F	V	D	R	F	E	I	I	R	R	P	I	N	P	R	E	S	M	E	K	T	G	I	S	E	E	F	D	R	L	S	Q	E	A	L	P	A	E	Q	Y	L	S	K	R	E	G	R	R	P	V	N	A	E	K	N	R	Y	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	V	P	F	D	H	T	R	V	I	L	T	D	R	P	N	T	P	G	S	D	Y	I	N	A	S	Y	V	R	F	E	N	S	Q	R	T	K	N	V	T	F	A	C	E	K	S	F	I	A	T	Q	G	C	L	E	T	T	I	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	W	S	M	V	W	Q	E	N	S	R	V	I	V	M	P	T	M	E	N	E	R	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	A	E	V	N	K	P	E	V	H	G	D	I	S	L	T	C	T	I	E	R	K	V	Q	R	A	V	S	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?											?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	K	A	E	L	E	Q	E	K	T	N	R	I	A	K	G	L	V	P	E	A	E	L	N	G	D	G	I	S	Y	I	L	R	T	L	V	M	K	K	G	K	D	T	R	E	I	R	Q	L	Q	Y	L	T	W	P	D	H	G	C	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	H	P	Y	A	V	L	N	F	L	E	D	V	D	R	E	Y	D	Y	F	N	A	Q	P	I	A	A	S	L	P	Q	G	P	I	V	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	V	L	V	L	D	A	L	L	N	Q	V	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	G	L	L	C	P	M	D	V	Y	K	M	V	K	Y	V	R	T	Y	R	S	G	L	V	Q	T	E	Q	Q	Y	Q	F	L	Y	K	A	L	A	F	Y	L	K	N	N	N	P	Y	P	V	K	S	F	I	D	G	D	T	D	A	F
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		D	F	P	R	R	L	R	P	T	P	N	A	S	R	P	S	S	A	R	Q	V	T	S	S	R	P	S	S	S	A	S	S	R	T	S	H	S	R	P	R	T	G	P	Q	A	E	P	I	F	E	R	S	T	S	S	T	S	S	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	L	L	K	S	T	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand