Job Description G5EC24 Confidence 100.00% Date Fri May 3 21:06:01 BST 2013 Rank 3 Aligned Residues 478 % Identity 44% Template c2shpA_ PDB info PDB header:tyrosine phosphatase Chain: A: PDB Molecule:shp-2; PDBTitle: tyrosine phosphatase shp-2 Resolution 2.00 Å Model Dimensions (Å) X:82.293 Y:62.894 Z:52.908

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	N	F	Y	Y	R	V	N	G	E	K	A	E	E	L	L	K	E	Y	G	E	D	G	D	F	L	L	R	Y	S	E	S	N	P	Q	N	F	S	I	S	V	R	V	A	E	D	K	I	L	H	I	K	V	T	K	Y	E	S	D	M	L	S	I	F	E	D	E	R	T	T	P	N	Q	F	G	S	I	T	E
Query Conservation
Alig confidence																																													.														.										.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.														.										.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	W	F	H	P	N	I	T	G	V	E	A	E	N	L	L	L	T	R	G	V	D	G	S	F	L	A	R	P	S	K	S	N	P	G	D	L	T	L	S	V	R	.	R	N	G	A	V	T	H	I	K	I	Q	N	T	.	G	D	Y	Y	D	L	Y	G	G	.	.	.	.	.	E	K	F	A	T	L	A	E
Template Known Secondary structure		S	T	T	B		S	S																T	T								S	S	S	T	T								.		T	T										S	.	S	S					T	T	S	.	.	.	.	.				S	S
Template Predicted Secondary structure																																													.														.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.	.	.	.	.						.	70	.	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		L	A	E	F	Y	M	E	F	P	E	K	L	R	E	K	N	G	L	F	L	E	L	K	K	P	V	Y	V	P	Y	H	L	E	A	C	A	E	E	Q	R	R	T	Q	L	Y	R	W	W	H	G	N	L	P	A	S	S	A	N	K	L	L	.	Q	T	E	K	N	G	T	Y	L	L	R	A	S	Q	H	I	P	G
Query Conservation																																																															.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	V	Q	Y	Y	M	E	H	H	G	Q	L	K	E	K	N	G	D	V	I	E	L	K	Y	P	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	D	P	T	S	E	R	W	F	H	G	H	L	S	G	K	E	A	E	K	L	L	T	E	K	G	K	H	G	S	F	L	V	R	E	S	Q	S	H	P	G
Template Known Secondary structure								T		T	T		S	B	S	S	S	S		B									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T		T	T	B			S													T			T	T								S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.												.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.						.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	V	I	S	A	K	T	.	.	.	.	.	E	G	Q	V	V	H	L	T	I	Y	Q	D	P	S	T	G	R	F	N	I	D	G	D	R	T	K	F	Q	S	A	W	L	L	I	D	S	Y	S	K	N	P	I	V	E	K	G	E	A	S	R	V	L	Y	L	E	E	P	L	F	N	T	F	I	E	A	D	L
Query Conservation										.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.														.	.										.																					.	.
Template Conservation																												.	.										.																					.	.
Template Sequence		D	F	V	L	S	V	R	T	G	D	N	D	G	K	S	K	V	T	H	V	M	I	R	C	Q	E	.	.	L	K	Y	D	V	G	G	G	E	.	R	F	D	S	L	T	D	L	V	E	H	Y	K	K	N	P	M	V	E	T	.	.	L	G	T	V	L	Q	L	K	Q	P	L	N	T	T	R	I	N	A	A	E
Template Known Secondary structure																											T	.	.	T				S	S	S	S		.		B	S	S											S			B		T	.	.	T	S		B										S				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																												.	.										.																					.	.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.			.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200			.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	D	R	F	E	I	I	R	R	P	I	N	P	R	E	S	M	E	K	T	G	I	S	E	E	F	D	R	L	S	Q	E	A	L	P	A	E	Q	Y	L	S	K	R	E	G	R	R	P	V	N	A	E	K	N	R	Y	K	N	I	V	P	F	D	H	T	R	V	I	L	T	D	R	P	N	T	P	G	S	D
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	S	R	V	R	E	L	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	W	E	E	F	E	T	L	Q	Q	Q	E	.	.	C	K	L	L	Y	S	R	K	E	G	Q	R	Q	E	N	K	N	K	N	R	Y	K	N	I	L	P	F	D	H	T	R	V	V	L	H	.	.	.	.	.	.	D	S	D
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											G	G	G	.	.	G	G	G									S	G	G	G	G	G	G	S	S	S	T	T					T	T	T						.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.												.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.			.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.							.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.		.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																																																														.
Query SS confidence																																																														.
Query Sequence		Y	I	N	A	S	Y	V	R	F	E	N	S	Q	R	T	K	N	V	T	F	A	C	E	K	S	F	I	A	T	Q	G	C	L	E	T	T	I	S	D	F	W	S	M	V	W	Q	E	N	S	R	V	I	V	M	P	T	M	E	N	E	.	R	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	A	E	V	N	K	P	E	V	H
Query Conservation																																																														.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.													.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.
Template Sequence		Y	I	N	A	N	I	I	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	K	S	Y	I	A	T	Q	G	C	L	Q	N	T	V	N	D	F	W	R	M	V	F	Q	E	N	S	R	V	I	V	M	T	T	K	E	V	E	R	G	K	S	K	C	V	K	Y	W	P	D	E	.	Y	A	L	K	E	Y
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	T												T								S		S			T	T			S					S			T	.	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.														.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.		.	.	.	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.				460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.
Query Sequence		G	D	I	S	L	T	C	T	I	E	R	K	V	Q	R	A	V	S	D	E	V	K	A	E	L	E	Q	E	K	T	N	R	I	A	K	G	L	V	P	E	A	E	L	N	G	D	G	I	S	Y	I	L	R	T	L	V	M	K	K	.	.	.	G	K	D	T	R	E	I	R	Q	L	Q	Y	L	T	W	P	D	H
Query Conservation																																																													.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	M	R	V	R	N	V	K	E	S	A	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	T	L	R	E	L	K	L	S	K	V	G	Q	G	N	T	E	R	T	V	W	Q	Y	H	F	R	T	W	P	D	H
Template Known Secondary structure		T	T												S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S											T	T																		S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	C	P	L	H	P	Y	A	V	L	N	F	L	E	D	V	D	R	E	Y	D	Y	F	N	A	Q	P	I	A	A	S	L	P	Q	G	P	I	V	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	V	L	V	L	D	A	L	L	N	Q	V	K	K	V	G	L	L	C	P	M	D	V	Y	K	M	V	K	Y	V	R
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	P	S	D	P	G	G	V	L	D	F	L	E	E	V	H	H	K	Q	E	S	I	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	P	V	V	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	I	L	I	D	I	I	R	E	K	G	V	D	C	D	I	D	V	P	K	T	I	Q	M	V	R
Template Known Secondary structure		S			S																			S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.									S	S	S	S																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.									.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Y	R	S	G	L	V	Q	T	E	Q	Q	Y	Q	F	L	Y	K	A	L	A	F	Y	L	K	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	R	S	G	M	V	Q	T	E	A	Q	Y	R	S	I	Y	M	A	V	Q	H	Y	I	E	T
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T	S	S																			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.