Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q22070 Date Sat Apr 13 12:57:32 BST 2013 Unique Job ID 810548c15e619017

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	H	G	S	L	G	P	S	S	S	S	R	K	T	T	V	T	S	T	A	G	S	V	H	L	H	H	R	S	S	N	G	F	S	T	A	S	R	A	Q	L	N	R	H	N	E	M	D	F	G	K	M	F	A	A	M	E	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	K	V	C	K	I	A	V	L	K	K	W	D	P	A	Y	K	Q	L	T	L	D	R	Y	S	R	Q	I	F	L	T	K	L	E	L	S	A	V	R	N	K	P	T	I	L	D	I	R	Q	I	R	E	V	Q	T	L	N	Y	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?			?																			?	?	?	?	?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	T	I	K	V	D	D	K	W	K	K	D	R	E	I	V	N	F	D	S	K	A	I	L	I	I	S	Y	G	M	G	F	A	L	S	Y	W	I	L	L	F	E	S	E	D	A	C	K	L	W	S	Q	G	L	H	N	L	M	M	D
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Disorder		?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	R	D	R	D	S	S	P	H	P	L	R	I	E	R	F	L	H	K	H	F	L	S	L	M	S	P	A	N	D	A	V	A	R	K	H	M	K	P	F	V	Q	T	S	L	Q	F	K	V	Q	S	D	Q	L	Q	Q	V	T	E	D
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Disorder					?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	M	N	S	D	Q	F	S	F	A	S	R	Q	L	I	H	V	P	E	L	F	S	S	R	F	A	D	L	A	E	K	H	E	R	K	G	L	V	V	T	F	Q	N	F	L	R	F	L	D	G	K	Q	F	D	E	L	A	S	N	R
Secondary structure
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Disorder				?																																	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	R	A	L	E	F	L	N	R	Y	F	Q	E	D	Q	A	Y	F	G	D	R	N	E	P	S	M	T	V	F	E	F	C	D	F	L	F	S	R	E	N	S	L	W	D	P	T	N	E	K	V	T	H	D	M	S	R	P	L	S	H
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Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	W	I	A	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	L	R	S	E	S	S	L	D	C	Y	A	Q	A	L	L	M	G	C	R	C	I	E	L	D	C	W	D	G	Q	K	K	P	G	S	A	E	F	I	D	I	V	I	Y	H	G
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Disorder																																															?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	T	M	T	S	K	I	L	L	R	D	V	L	H	V	I	R	H	Y	A	F	V	T	S	E	Y	P	V	I	L	S	I	E	D	N	C	S	V	P	A	Q	R	L	L	A	Q	E	L	K	D	I	L	G	D	Y	L	L	T	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	N	R	E	E	K	Q	L	P	S	P	A	A	L	K	K	K	I	I	V	K	H	K	K	L	P	I	E	S	E	D	L	A	A	V	V	K	T	D	E	F	Q	D	T	E	I	I	S	R	E	C	V	K	K	G	I	L	M	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		N	N	N	S	H	E	W	T	S	H	V	F	I	L	F	P	D	R	L	C	Y	L	I	Q	T	A	D	P	E	N	P	N	D	D	T	V	S	V	S	G	D	E	E	R	E	E	E	T	P	S	G	F	G	V	K	P	E	E	M	H
Secondary structure
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Disorder			?												?		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?			?	?		?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		V	T	E	E	W	F	H	G	R	C	E	R	D	E	A	K	K	R	I	L	E	H	K	E	K	G	N	G	L	F	M	I	R	D	S	N	L	F	I	G	D	F	S	L	S	I	L	H	D	G	K	V	H	H	V	R	I	R	S	K
Secondary structure
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Disorder																							?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		I	I	D	K	E	K	K	Y	Y	F	M	D	N	K	V	C	D	T	L	Y	E	L	V	S	Y	Y	T	R	H	Y	L	T	T	A	H	F	K	M	V	L	T	I	P	C	P	Q	P	Q	P	H	L	N	Q	P	W	F	S	A	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?		?	?	?	?												?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	K	E	K	A	E	E	L	L	S	L	V	P	E	D	G	A	F	L	I	R	T	S	S	T	D	S	S	V	Y	V	L	S	L	K	V	D	G	E	F	W	H	Y	R	L	K	R	D	G	R	I	F	V	V	N	Q	K	V	F	E
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Disorder											?	?		?	?													?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		N	L	N	Q	I	V	E	F	Y	A	N	R	E	F	V	R	G	I	S	L	R	F	P	V	N	E	K	D	I	S	H	L	T	A	E	L	A	E	A	R	T	P	G	C	Y	M	D	L	K	D	L	D	K	E	V	Q	A	R	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		R	P	Y	R	G	T	A	D	D	E	L	S	F	P	A	N	V	I	I	T	V	L	R	K	E	E	G	L	W	R	G	R	Y	G	S	L	T	G	W	F	P	S	A	H	V	Q	E	I	L	P	E	K	V	S	T	S	E	T	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																					?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		Y	N	T	I	E	L	A	G	T	L	I	E	R	I	H	D	A	D	R	P	N	V	I	R	I	S	Q	S	N	Q	H	W	M	N	K	Q	Y	Y	L	L	A	A	S	S	S	E	E	A	D	G	W	Q	N	N	L	F	E	L	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?				?	?			?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?			?		?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		S	V	N	T	K	M	S	I	L	R	T	K	E	K	E	K	R	I	A	A	E	L	S	N	L	V	V	Y	C	Q	A	V	P	F	D	P	A	H	I	Y	N	D	A	F	Y	E	M	C	S	F	V	E	G	K	L	D	K	L	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?		?		?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		K	G	L	L	P	F	N	S	R	K	L	S	R	V	Y	P	N	G	S	R	I	T	S	N	N	Y	S	P	V	P	M	W	N	A	G	C	H	M	V	A	L	N	Y	Q	T	G	D	K	P	M	Q	L	N	Q	G	K	F	L	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		G	R	C	G	Y	L	L	K	P	D	Y	M	L	T	D	D	F	D	P	T	N	T	E	K	F	A	T	A	Y	P	I	R	L	N	V	Q	V	I	G	G	R	H	L	S	R	K	D	K	N	K	G	I	C	S	P	F	V	E	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?										?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		I	I	G	M	P	C	D	T	K	V	F	Q	T	K	T	I	A	S	N	G	L	N	P	I	W	N	Q	T	F	T	F	E	I	Q	C	P	E	V	A	L	I	R	F	H	V	E	D	G	D	F	V	G	P	K	T	D	P	F	I	G
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SS confidence
Disorder																																																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		Q	A	V	F	P	V	D	S	I	R	C	G	F	R	S	V	P	L	K	N	Q	Y	S	E	E	L	E	L	S	S	L	L	V	D	V	Q	M	C	S	R	E	G	T	Q	L	I	R	S	S	S	H	F	L	Q	A	S	R	L	A	P
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SS confidence
Disorder																								?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		V	F	A	H	R	K	I	T	N	G	D	S	I	P	R	E	M	A	P	R	L	R	T	S	A	T	D	R	S	L	D	S	P	T	N	S	E	S	R	A	T	L	L	S	G	Q	R	G	S	Q	D	S	M	D	S	A	A	E	T	S
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SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350
Sequence		S	I	A	S	G	T	I	S	S	R	D	G	K	K	K	Q	N	W	L	K	K	F	S	F	G	K	S	S	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?
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