Job Description Q22070 Confidence 100.00% Date Sat Apr 13 12:57:32 BST 2013 Rank 3 Aligned Residues 661 % Identity 37% Template c2fjuB_ PDB info PDB header:signaling protein,apoptosis/hydrolase Chain: B: PDB Molecule:1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate PDBTitle: activated rac1 bound to its effector phospholipase c beta 2 Resolution 2.20 Å Model Dimensions (Å) X:90.133 Y:85.197 Z:58.793

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	M	F	A	A	M	E	K	G	H	K	V	C	K	I	A	V	L	K	K	W	D	P	A	Y	K	Q	L	T	L	D	R	Y	S	R	Q	I	F	L	T	K	L	E	L	S	A	V	R	N	K	P	T	I	L	D	I	R	Q	I	R	E	V	Q	T	L	N	Y	K	L	N	T	I	K	V	D	D	K	W	K	K
Query Conservation
Alig confidence																			.																								.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																								.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	K	A	Y	L	S	Q	G	E	R	F	I	K	W	D	D	.	E	T	T	V	A	S	P	V	I	L	R	V	D	P	K	G	Y	Y	L	Y	W	T	Y	.	.	.	.	.	Q	S	K	E	M	E	F	L	D	I	T	S	I	R	D	T	R	F	G	.	.	.	.	.	.	.	K	F	A	K	M	P	K	S
Template Known Secondary structure																	S	S	.	S	S	S											T	T	S								.	.	.	.	.	T	T	S							G	G	G							G	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S					S
Template Predicted Secondary structure																			.																								.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.						.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70								.	.	.	.	.	.	.	.
		132	.									.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.		.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query Sequence		D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	V	N	F	D	S	K	A	I	L	I	I	S	Y	G	M	G	F	.	A	L	S	Y	W	I	L	L	F	E	S	E	D	A	C	K	L	W	S	Q	G	L	H	N	L	M	M	D	T	R	D	R	D	S	S	P	H	P	L	R	I	E	R	F	L	H	K	H	F	L
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.																				.																																																		.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		Q	K	L	R	D	V	F	N	M	D	F	P	D	N	S	F	L	L	K	T	L	T	V	V	S	G	P	D	M	V	D	L	T	F	H	N	F	V	S	Y	K	E	N	V	G	K	A	W	A	E	D	V	L	A	L	V	K	H	P	L	T	A	N	A	S	R	S	T	F	L	D	K	I	L	V	K	L	K	M	.
Template Known Secondary structure								T	T	T	T	S	T	T			G	G	G	T								S	S	S	S	S									S	S	S	S														T						T																	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.			.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240								.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	M	S	P	A	N	D	A	V	A	R	K	H	M	K	P	F	V	Q	T	S	L	Q	.	.	F	K	V	Q	S	D	Q	L	Q	Q	V	T	E	D	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	N	S	D	Q	F	S	F	A	S	R	Q	L	I	H	V	P	E	L	F	S	S	R	F	A	D	L	A	E	K	H	E
Query Conservation																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																			.				.	.															.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.							.
Template Conservation		.	.																			.																																																.	.	.	.	.							.
Template Sequence		.	.	Q	L	N	S	E	G	K	I	P	V	K	N	F	F	Q	M	F	P	.	A	D	R	K	R	V	E	A	A	L	S	A	C	H	L	P	K	G	K	N	D	A	I	N	P	E	D	F	P	E	P	V	Y	K	S	F	L	M	S	L	C	P	R	P	E	I	D	.	.	.	.	.	E	I	F	T	S	Y	.
Template Known Secondary structure		.	.	S			T	T	S											S	T	.	T												T	T				S	S	S					G	G	G	S		T	T										S							.	.	.	.	.							.
Template Predicted Secondary structure		.	.																			.																																																.	.	.	.	.							.
Template SS confidence
				158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.						.	.	.	.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	K	G	L	V	V	T	F	Q	N	F	L	R	F	L	D	G	K	Q	F	D	E	L	A	S	N	R	T	R	A	L	E	F	L	N	R	Y	F	Q	E	D	Q	A	Y	F	G	D	R	N	E	P	S	M	T	V	F	E	F	C	D	F	L	F	S	R	E	N	S	L	W	D	P	T	N	E	K	V	T	H	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	M	T	K	E	H	L	T	K	F	I	N	Q	K	Q	R	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	D	K	Y	.	.	.	.	E	P	S	.	.	.	.	.	.	G	Q	L	S	P	E	G	M	V	W	F	L	C	G	P	E	N	S	V	L	A	Q	D	K	L	L	L	H	H	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.		B											T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.				.	.	.	.	.	.		B												S	T	T	S		S	B		G	G	G	G	S	S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.										.	.	.	.	.	.					.	260	.							.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.			.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.
Query SS confidence																																																				.	.
Query Sequence		M	S	R	P	L	S	H	Y	W	I	A	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	L	R	S	E	S	S	L	D	C	Y	A	Q	A	L	L	M	G	C	R	C	I	E	L	D	C	W	D	G	.	.	Q	K	K	P	G	S	A	E	F	I	D	I	V	I	Y	H	G	Y	T	M	T	S	K	I	L	L	R	D
Query Conservation																																																				.	.
Alig confidence																																																				.	.				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	T	Q	P	L	N	H	Y	F	I	N	S	S	H	N	T	Y	L	T	A	G	Q	F	S	G	L	S	S	A	E	M	Y	R	Q	V	L	L	S	G	C	R	C	V	E	L	D	C	W	K	G	K	P	P	D	E	.	.	.	.	.	.	.	E	P	I	I	T	H	G	F	T	M	T	T	D	I	F	F	K	E
Template Known Secondary structure				S		G	G	G					B	B	S	S	T	T	B	S	S		S	S	S	S		B		T									T	T													T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.								.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.		.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.					.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																												.	.	.	.
Query SS confidence																											.																												.	.	.	.
Query Sequence		V	L	H	V	I	R	H	Y	A	F	V	T	S	E	Y	P	V	I	L	S	I	E	D	N	C	.	S	V	P	A	Q	R	L	L	A	Q	E	L	K	D	I	L	G	D	Y	L	L	T	Q	P	A	N	R	.	.	.	.	E	E	K	Q	L	P	S	P	A	A	L	K	K	K	I	I	V	K	H	K	K	L	P
Query Conservation																											.																												.	.	.	.
Alig confidence																											.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	E	A	I	A	E	S	A	F	K	T	S	P	Y	P	I	I	L	S	F	E	N	H	V	D	S	P	R	Q	Q	A	K	M	A	E	Y	C	R	T	I	F	G	D	M	L	L	T	E	P	L	E	K	F	P	L	K	P	G	V	P	L	P	S	P	E	D	L	R	G	K	I	L	I	K	N	K	K	E	E
Template Known Secondary structure										T	T	T	S			S																												G	G	G	B			S			T	T	S		S	S	T	T						T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	S	E	D	L	A	A	V	V	K	T	D	E	F	Q	D	T	E	I	I	S	R	E	C	V	K	K	G	I	L	M	V	K	N	N	N	S	H	E	W	T	S	H	V	F	I	L	F	P	D	R	L	C	Y	L	I	Q	T	A	D	P	E	N	P	N	D	D	T	V	S	V	S	G	D	E	E	R	E	E
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	N	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.
		587	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	P	S	G	F	G	V	K	P	E	E	M	H	V	T	E	E	W	F	H	G	R	C	E	R	D	E	A	K	K	R	I	L	E	H	K	E	K	G	N	G	L	F	M	I	R	D	S	N	L	F	I	G	D	F	S	L	S	I	L	H	D	G	K	V	H	H	V	R	I	R	S	K	I	I	D	K	E	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		667	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Y	Y	F	M	D	N	K	V	C	D	T	L	Y	E	L	V	S	Y	Y	T	R	H	Y	L	T	T	A	H	F	K	M	V	L	T	I	P	C	P	Q	P	Q	P	H	L	N	Q	P	W	F	S	A	T	A	D	K	E	K	A	E	E	L	L	S	L	V	P	E	D	G	A	F	L	I	R	T	S	S	T	D
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		747	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	S	V	Y	V	L	S	L	K	V	D	G	E	F	W	H	Y	R	L	K	R	D	G	R	I	F	V	V	N	Q	K	V	F	E	N	L	N	Q	I	V	E	F	Y	A	N	R	E	F	V	R	G	I	S	L	R	F	P	V	N	E	K	D	I	S	H	L	T	A	E	L	A	E	A	R	T	P	G	C	Y	M
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		827	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	K	D	L	D	K	E	V	Q	A	R	A	L	R	P	Y	R	G	T	A	D	D	E	L	S	F	P	A	N	V	I	I	T	V	L	R	K	E	E	G	L	W	R	G	R	Y	G	S	L	T	G	W	F	P	S	A	H	V	Q	E	I	L	P	E	K	V	S	T	S	E	T	S	N	Y	N	T	I	E	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		907	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	T	L	I	E	R	I	H	D	A	D	R	P	N	V	I	R	I	S	Q	S	N	Q	H	W	M	N	K	Q	Y	Y	L	L	A	A	S	S	S	E	E	A	D	G	W	Q	N	N	L	F	E	L	T	R	S	V	N	T	K	M	S	I	L	R	T	K	E	K	E	K	R	I	A	A	E	L	S	N	L	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	I	K	K	M	Q	S	D	E	G	T	A	G	L	E	V	T	A	Y	E	E	M	S	S	L	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	T	T	T	T	T	G	G	G	G											T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																							520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
		987	.	.	990	.	.	.	.	.			.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.				.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.
Predicted Secondary structure											.	.																											.	.	.
Query SS confidence											.	.																											.	.	.
Query Sequence		V	Y	C	Q	A	V	P	F	D	.	.	P	A	H	I	Y	N	D	A	F	Y	E	M	C	S	F	V	E	G	K	L	D	K	L	V	E	K	.	.	.	G	L	L	P	F	N	S	R	K	L	S	R	V	Y	P	N	G	S	R	I	T	S	N	N	Y	S	P	V	P	M	W	N	A	G	C	H	M	V	A	L
Query Conservation											.	.																											.	.	.
Alig confidence											.	.																											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Y	I	Q	P	T	K	F	V	S	F	E	F	S	A	Q	K	N	R	S	Y	V	I	S	S	F	T	E	L	K	A	Y	D	L	L	S	K	A	S	V	Q	F	V	D	Y	N	K	R	Q	M	S	R	I	Y	P	K	G	T	R	M	D	S	S	N	Y	M	P	Q	M	F	W	N	A	G	C	Q	M	V	A	L
Template Known Secondary structure		S	S																T		T	T																												S								T	T		T	T												T	T						B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
		1062	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Y	Q	T	G	D	K	P	M	Q	L	N	Q	G	K	F	L	A	N	G	R	C	G	Y	L	L	K	P	D	Y	M	L	T	D	D	F	D	P	T	N	T	E	K	F	A	T	A	Y	P	I	R	L	N	V	Q	V	I	G	G	R	H	L	S	R	K	D	K	N	K	G	I	C	S	P	F	V	E	I	E	I
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		N	F	Q	T	M	D	L	P	M	Q	Q	N	M	A	V	F	E	F	N	G	Q	S	G	Y	L	L	K	H	E	F	M	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	T	L	S	I	T	V	I	S	G	Q	F	L	S	E	R	S	.	.	.	.	.	V	R	T	Y	V	E	V	E	L
Template Known Secondary structure			T	T			S										T	T	T	G	G	G		S						G	G	G	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S			S	S		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		627	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.																660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.						.	.	680	.	.	.	.	.	.
		1142	.	.	.	.	.	.			.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.		.	.	.	1170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.																			.							.
Query SS confidence									.	.																			.							.
Query Sequence		I	G	M	P	C	D	T	.	.	K	V	F	Q	T	K	T	I	A	S	N	G	L	N	P	I	W	N	.	Q	T	F	T	F	E	.	I	Q	C	P	E	V	A	L	I	R	F	H	V	E	D	G	D	F	V	G	P	K	T	D	P	F	I	G	Q	A	V	F	P	V	D	S	I	R	C	G	F	R	S	V	P
Query Conservation									.	.																			.							.
Alig confidence									.	.																			.							.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	L	P	G	D	P	K	R	R	Y	R	T	K	L	S	P	S	T	N	S	I	N	P	V	W	K	E	E	P	F	V	F	E	K	I	L	M	P	E	L	A	S	L	R	V	A	V	M	E	E	G	.	.	.	.	.	.	N	K	F	L	G	H	R	I	I	P	I	N	A	L	N	S	G	Y	H	H	L	C
Template Known Secondary structure					T	T	S											S	S	S			S	S		B												S		G	G	G										T	T	.	.	.	.	.	.	T										G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		704	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.							.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.
		1218	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	N	Q	Y	S	E	E	L	E	L	S	S	L	L	V	D	V	Q	M	C	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	H	S	E	S	N	M	P	L	T	M	P	A	L	F	I	F	L	E	M	K	D
Template Known Secondary structure					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		778	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.