Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q20646 Date Fri May 3 21:47:31 BST 2013 Unique Job ID 769c1e9df65d5170

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	P	D	D	S	Q	L	S	D	I	L	K	D	A	R	I	P	D	S	Q	D	I	G	V	N	L	T	Q	N	L	S	F	D	T	V	Q	K	M	I	D	G	V	F	T	P	I	F	S	Q	G	T	E	D	S	L	E	K	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?		?	?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	K	T	P	G	I	S	T	I	Y	N	G	I	L	G	N	G	E	E	T	K	K	R	T	P	K	I	S	D	A	F	E	P	D	L	N	T	S	G	D	V	F	D	S	D	K	S	E	D	G	L	M	N	D	E	S	Y	L	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?			?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	T	L	S	Q	V	V	L	D	S	Q	K	Y	E	Y	L	R	V	R	T	E	E	E	Q	Q	L	V	I	E	K	R	A	R	E	R	F	I	R	K	S	M	K	I	A	E	E	T	A	L	S	Y	E	N	D	G	S	R	E	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																														?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	T	M	T	Q	K	V	T	Q	M	D	F	T	E	T	N	V	P	F	D	G	N	D	E	S	S	N	L	A	V	R	V	Q	S	D	M	N	L	N	E	D	C	E	K	W	M	E	I	D	V	L	K	Q	K	V	A	K	S	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?														?	?	?	?	?	?	?	?												?		?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	A	F	A	I	S	S	E	H	E	K	Y	L	W	T	K	M	G	C	L	V	P	I	Q	V	K	W	K	L	D	K	R	H	F	N	S	N	L	S	L	R	I	R	F	V	K	Y	D	K	K	E	N	V	E	Y	A	I	R	N	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	S	D	V	M	K	C	R	S	H	T	E	R	E	Q	H	F	P	F	D	S	F	F	Y	I	R	N	S	E	H	E	F	S	Y	S	A	E	K	G	S	T	F	T	L	I	M	Y	P	G	A	V	Q	A	N	F	D	I	I	F	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		C	Q	E	K	C	L	D	L	D	D	R	R	K	T	M	C	L	A	V	F	L	D	D	E	N	G	N	E	I	L	H	A	Y	I	K	Q	V	R	I	V	A	Y	P	R	R	D	W	K	N	F	C	E	R	E	D	A	K	Q	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																																													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	R	F	P	E	L	P	A	Y	K	K	A	S	L	E	S	I	N	I	K	Q	E	V	N	L	E	N	M	F	N	V	T	N	T	T	A	Q	M	E	P	S	T	S	Y	S	S	P	S	N	S	N	N	R	K	R	F	L	N	E	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	S	P	N	N	D	Y	T	M	M	H	R	T	P	P	V	T	G	Y	A	S	R	L	H	G	C	V	P	P	I	E	T	E	H	E	N	C	Q	S	P	S	M	K	R	S	R	C	T	N	Y	S	F	R	T	L	T	L	S	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	Y	T	K	V	V	E	F	L	A	R	E	A	K	V	P	R	Y	T	W	V	P	T	Q	V	V	S	H	I	L	P	T	E	G	L	E	R	F	L	T	A	I	K	A	G	H	D	S	V	L	F	N	A	N	G	I	Y	T	M	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?																		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Sequence		D	M	I	R	E	F	E	K	H	N	D	I	F	E	R	I	G	I	D	S	S	K	L	S	K	Y	Y	E	A	F	L	S	F	Y	R	I	Q	E	A	M	K	L	P	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand