Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q8I4E2 Date Sat Apr 13 13:13:52 BST 2013 Unique Job ID 3b15295aa727664b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Q	V	K	A	E	Y	D	F	Q	S	Q	P	N	T	G	E	L	S	I	S	A	G	E	V	L	T	V	I	R	E	N	I	D	G	G	W	I	E	G	R	N	V	R	G	S	V	G	L	F	P	E	S	Y	V	T	P	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?									?		?	?	?	?																																							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	S	R	P	P	P	V	L	P	P	P	L	P	P	T	S	S	G	P	P	A	A	S	S	R	P	F	D	D	W	G	G	A	S	E	V	A	A	P	P	S	Y	G	A	Q	H	H	H	Q	P	T	P	S	V	P	E	V	T	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	Y	P	S	Q	N	D	D	F	D	D	E	W	T	D	E	D	D	E	Q	E	P	T	R	P	N	V	Q	S	S	I	G	S	N	S	R	R	D	L	S	R	S	H	S	E	H	G	G	P	D	R	G	S	N	K	V	N	K	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	R	F	S	N	F	V	K	S	G	V	E	A	Y	V	I	G	E	S	K	T	T	S	Q	I	S	E	R	H	E	V	V	M	N	N	G	I	I	Q	W	K	P	I	Q	Q	Y	Y	T	C	I	V	D	K	P	K	K	E	S	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?				?	?	?	?	?	?					?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	G	L	K	S	F	I	A	Y	S	I	T	S	S	L	T	N	I	Q	R	Q	V	S	R	R	Y	K	H	F	D	W	L	H	E	Q	L	S	A	K	Y	V	L	I	P	I	P	P	L	P	E	K	Q	V	A	G	R	Y	E	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																?		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	I	D	H	R	K	H	I	L	Q	L	W	V	N	K	I	C	R	H	P	V	L	S	Q	S	E	V	W	L	H	F	I	S	C	T	D	E	K	D	W	K	N	G	K	R	R	A	E	K	D	E	Y	I	G	G	A	F	L	N	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	T	V	P	H	Q	P	L	D	P	N	N	V	D	M	Q	V	E	R	F	Q	R	S	V	K	T	S	E	E	A	M	R	V	M	Q	E	R	M	N	M	F	Q	K	V	F	A	G	P	V	K	Q	N	W	Q	K	M	G	S	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	T	L	Q	Q	S	F	E	I	D	E	T	V	A	S	R	R	L	T	E	A	L	A	Y	T	A	S	E	Y	H	E	I	G	Q	V	F	D	A	H	T	K	N	D	M	E	P	V	L	E	N	L	Y	S	Y	K	G	T	V	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	P	D	I	I	Q	V	H	K	Q	A	V	Q	K	F	R	D	S	E	G	R	L	S	S	A	E	A	E	K	M	K	Q	R	I	D	A	M	S	Y	T	V	I	A	E	V	Q	H	Q	T	A	E	K	V	E	D	M	K	S	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	T	Y	L	K	K	Q	A	M	F	Y	Q	E	V	A	T	K	L	T	S	L	A	A	R	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand