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|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
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| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 3 | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . |
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | Q | V | K | A | E | Y | D | F | Q | S | Q | P | N | T | G | E | L | S | I | S | A | G | E | V | L | T | V | I | R | E | N | I | D | G | G | W | I | E | G | R | N | V | R | G | S | V | G | L | F | P | E | S | Y | V | T | P | Y | Q | A | S | R | P | P | P | V | L | P | P | P | L | P | P | T | S | S | G | P | P | A | A |
| Template Sequence |   | Y | V | R | T | L | Y | D | F | P | G | N | . | D | A | E | D | L | P | F | K | K | G | E | I | L | V | I | I | E | K | P | . | E | E | Q | W | W | S | A | R | N | K | D | G | R | V | G | M | I | P | V | P | Y | V | E | K | L | V | R | S | S | P | H | G | K | H | G | N | R | N | S | N | S | Y | G | I | P | E | P | A |
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | B | . | S | S | S | B | B | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | G | G | G | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | ||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 127 | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | ||
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 83 | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | S | S | R | P | F | D | D | W | G | G | A | S | E | V | A | A | P | P | S | Y | G | A | Q | H | H | H | Q | P | T | P | S | V | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | H | A | Y | A | Q | P | Q | T | T | T | P | L | P | A | V | S | G | S | P | G | A | A | I | T | P | L | P | S | T | Q | N | G | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | G | T | T | S | S | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 205 | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
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| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | |||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | |||||||||
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