Job Description O07325 Confidence 98.75% Date Tue Jul 17 17:05:02 BST 2012 Rank 61 Aligned Residues 347 % Identity 16% Template c3flcX_ PDB info PDB header:transferase Chain: X: PDB Molecule:glycerol kinase; PDBTitle: crystal structure of the his-tagged h232r mutant of glycerol kinase2 from enterococcus casseliflavus with glycerol Resolution 1.85 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.		.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		E	E	H	Y	Y	V	S	I	D	I	G	S	S	S	V	K	T	I	V	G	E	K	F	H	N	G	I	N	V	I	G	T	G	Q	T	Y	T	S	G	I	K	N	G	L	I	D	D	F	D	I	A	R	Q	A	I	K	D	T	I	K	K	A	S	I	A	S	G	V	D	I	K	E	V	F	.	L	K	L	P	I
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence																																																																												.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	N	Y	V	M	A	I	D	Q	G	T	T	S	S	R	A	I	I	F	D	R	N	G	K	K	I	G	S	S	Q	K	E	F	P	Q	Y	F	P	K	S	G	W	V	E	H	N	A	N	E	I	W	N	S	V	Q	S	V	I	A	G	A	F	I	E	S	G	I	R	P	E	A	I	A	G	I	G	I	T	N
Template Known Secondary structure													S	S									T	T	S													B		S	S	T	T																												G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100						.	.	.	.	.	.	.	.	.						110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.											.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Query SS confidence												.											.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Query Sequence		I	G	T	E	V	Y	D	E	S	N	.	E	I	D	F	Y	E	D	T	E	I	.	.	.	.	.	N	G	S	H	I	E	K	V	L	.	.	.	.	.	E	G	I	R	E	K	N	D	V	Q	E	T	E	V	I	N	V	F	P	I	R	F	I	V	D	K	E	N	E	V	S	D	P	K	E	L	I	A	R	H
Query Conservation												.											.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Alig confidence												.											.	.	.	.	.										.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	R	E	T	T	V	V	W	D	K	T	T	G	Q	P	I	A	N	A	I	V	W	Q	S	R	Q	S	S	P	I	A	D	Q	L	K	V	D	G	H	T	E	M	I	H	E	K	T	G	L	V	I	D	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	F	S	A	T	K	V	R	W	L	L	D	N	I	E	G	A	Q	E	K
Template Known Secondary structure			S	S							T	T	T			B	S	S					T	T			T	T										T	T										S					.	.	.	.	.	.	.	T	T	S												S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.								.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	K	V	E	A	G	V	I	A	I	Q	K	S	I	L	I	N	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	K	C	V	E	A	C	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	N	G	E	L	L	F	G	T	I	D	S	W	L	V	W	K	L	T	D	G	Q	V	H	V	T	D	Y	S	N	A	S	R	T	M	L	Y	N	I	H	K	L	E	W	D	Q	E	I	L	D	L	L	N	I	P	S	S	M	L	P	E	V	K	S	N	S	E	V	Y	G	H	T	R	S	Y	R	F	Y	G
Template Known Secondary structure				T	T																T	T	T	S											T	T	T	S			T	T	T	T										T	T			G	G	G							S									G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
			178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	V	L	D	V	Y	S	D	A	Y	N	Y	G	S	I	L	T	A	T	E	K	E	L	G	A	C	V	I	D	I	G	E	D	V	T	Q	V	A	F	Y	E	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	V	D	A	D	S	I	E	M	A	G	R	D	I	T	D
Query Conservation		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	E	V	P	I	A	G	M	A	G	D	Q	Q	A	A	L	F	G	Q	M	A	F	E	K	G	M	I	K	N	T	Y	G	T	G	A	F	I	V	M	N	T	G	E	E	P	L	S	D	N	D	L	L	T	T	I	G	Y	G	I	N	G	K	V	Y	Y	A	L	E	G	S	I	F	V	A	G	S	A	I	Q	W
Template Known Secondary structure																				T	T			S	T	T							S	S	S									T						T	T	S									T	T											S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280																.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	I	A	Q	G	L	N	T	S	Y	E	T	A	E	K	V	K	H	Q	Y	G	H	A	F	Y	D	S	A	S	D	Q	D	I	F	T	V	E	Q	V	D	S	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	Q	Y	T	Q	K	D	L	S	D	F	I	E	A	R	V	E	E	I	F	F
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	D	G	L	R	M	I	E	T	S	P	.	.	.	.	.	.	Q	S	E	E	L	A	A	K	A	K	G	D	N	E	V	Y	V	V	P	A	F	T	G	L	G	A	P	Y	W	D	S	E	A	R	G	A	V	F	G	L	T	R	G	T	T	K	E	D	F	V	R	A	T	L	Q	A	V	A	Y	Q	S	K
Template Known Secondary structure					T	S			S	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.											S		S								T	T		B		T	T	T		B	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.							.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	F	D	V	L	Q	D	L	G	L	T	K	V	N	G	G	F	I	V	T	G	G	S	A	N	L	L	G	V	K	E	L	L	S	D	M	V	S	E	K	V	R	I	H	T	P	S	Q	M	G	I	R	K	P	E	F	S	S	A	I	S	T	I	S	S	S	I
Query Conservation
Alig confidence												.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	I	D	T	M	K	K	D	S	.	G	I	D	I	P	L	L	K	V	D	G	G	A	A	K	N	D	L	L	M	Q	F	Q	A	D	I	L	D	I	D	V	Q	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	L	E	T	T	A	L	G	A	A	Y	L	A	G
Template Known Secondary structure												.											S	G	G	G	G													T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400		.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.									.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.