Job Description O05204 Confidence 99.95% Date Tue Jul 17 17:05:01 BST 2012 Rank 89 Aligned Residues 294 % Identity 23% Template c4ap3A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:steroid monooxygenase; PDBTitle: oxidized steroid monooxygenase bound to nadp Resolution 2.39 Å

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		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.			.	.	240											.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.												.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure																																				.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	P	Y	D	V	L	I	V	G	G	G	P	A	S	G	S	A	A	I	Y	T	A	R	K	G	L	R	T	G	I	V	A	D	R	.	.	I	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	N	D	T	A	G	I	E	N	F	I	T	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	T	G	S
Query Conservation																																				.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	Y	D	V	V	V	V	G	A	G	I	A	G	L	Y	A	I	H	R	F	R	S	Q	G	L	T	V	R	A	F	E	A	A	S	G	V	G	G	V	W	Y	W	N	R	Y	P	G	A	R	C	D	V	E	S	I	D	Y	S	Y	S	F	S	P	E	L	E	Q	E	W	N	W	S	E	K	Y	A	T	Q	P
Template Known Secondary structure												S													T	T								S	S	S	S	S		T								T	T		B		S	S		T	T	T	S	S			S											S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.			.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.																	.	.																							.	.
Query SS confidence																		.	.																	.	.																							.	.
Query Sequence		E	F	S	S	N	L	A	A	H	I	D	Q	Y	D	I	D	.	.	A	M	T	G	I	R	A	T	D	I	E	K	T	D	E	A	.	.	I	K	V	T	L	E	N	G	A	V	L	E	S	K	T	V	I	I	A	T	G	A	.	.	G	W	R	K	L	N	I	P	G	E	E	Q	L	I	N	K	G	V	A	F
Query Conservation																		.	.																	.	.																							.	.
Alig confidence																		.	.																	.	.																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	L	A	Y	L	E	H	V	A	D	R	F	D	L	R	R	D	I	R	F	D	T	R	V	T	S	A	V	L	D	E	E	G	L	R	W	T	V	R	T	D	R	G	D	E	V	S	A	R	F	L	V	V	A	A	G	P	L	S	N	A	N	T	P	A	F	D	G	L	D	R	F	T	G	D	I	V	H	T
Template Known Secondary structure														T	T		G	G	G				S										T	T	T	T							T	T															S										T	T	G	G	G			S					G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		335	.	.	.	.	340		.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.				380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.																																								.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																																								.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	P	H	C	D	G	.	P	L	F	E	N	K	D	V	A	V	I	G	G	G	N	S	G	V	E	A	A	I	D	L	A	G	I	V	N	H	V	T	L	F	E	F	A	S	E	.	.	.	L	K	A	D	N	V	L	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.																																								.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.																																								.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	W	P	H	D	G	V	D	F	T	G	K	R	V	G	V	I	G	T	G	S	S	G	I	Q	S	I	P	I	I	A	E	Q	A	E	Q	L	F	V	F	Q	R	S	A	N	Y	S	I	P	A	G	D	D	A	T	R	A	E	Q	K	A	N	Y	A	E	R	R	R	L	S	R	E	S	G	G	G	S	P	H
Template Known Secondary structure		G	G			T	T					B	T									S														B	S							S	S																			T											S	S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	P	H	P	K	S	A	L	E	V	S	E	E	E	R	R	A	V	Y	E	E	R	W	K	L	G	G	V	L	F	S	K	A	F	P	D	Q	L	T	D	P	A	A	N	D	T	A	R	A	F	W	E	E	K	I	R	A	V	V	D	D	P	A	V	A	E	L	L	T	P	K	D	H	A	I	G	A	K	R	I
Template Known Secondary structure					S	S		T	T	S	S																					T	T	S	S	T	T	T	T	T																					S									S		S	S			B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
									389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400			.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	R	L	R	S	L	S	N	V	D	I	K	T	.	.	N	A	K	T	T	E	V	V	G	E	D	H	V	T	G	I	R	Y	E	D	M	N	T	G	E	E	H	L	L	N	L	D	G	I	F	V	Q	I	G	L	L	P	N	T	S	W	L	N	D	A	V	E	L	N	E	R	G	E	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.													.	.											.	.	.	.			.					.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.			.					.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	D	S	G	Y	Y	E	T	Y	N	R	D	N	V	E	L	V	D	L	R	S	T	P	I	V	G	M	D	E	T	.	.	.	.	G	I	.	V	T	T	G	.	.	.	.	.	A	H	Y	D	L	D	M	I	V	L	A	T	G	F	D	A	M	T	G	S	L	D	K	L	E	I	V	G	R	G	G	R	T
Template Known Secondary structure					S	S	T	G	G	G	G	G	S	T	T						T	T	T	S							T	T	.	.	.	.			.			S	S	.	.	.	.	.						S											S	S	T	T	G	G	G	S					G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.			.					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.					.	.		.	.	.	380						.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		460	.	.	.	.											.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.		.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		V	I	D	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	T	N	V	P	G	I	F	A	A	.	G	D	V	T	D	Q	K	N	K	Q	I	I	I	S	M	G	A	G	A	N	A	A	L	N	A	F	D	Y	I	I	R	N
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	E	T	W	A	A	G	P	R	T	Y	L	G	L	G	I	D	G	F	P	N	F	F	N	L	T	G	P	G	S	P	S	V	L	A	N	M	V	L	H	S	E	L	H	V	D	W	V	A	D	A	I	A	Y	L	D	A	R
Template Known Secondary structure						T	T	T	S				B	T	T	T	B		T	T		T	T				T	T		T	T	S		G	G	G	S																							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.