Job Description O05204 Confidence 99.46% Date Tue Jul 17 17:05:01 BST 2012 Rank 162 Aligned Residues 218 % Identity 25% Template c2fjaC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:adenylylsulfate reductase, subunit a; PDBTitle: adenosine 5'-phosphosulfate reductase in complex with2 substrate Resolution 2.00 Å

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		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.					.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.										.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	V	L	I	V	G	G	G	P	A	S	G	S	A	A	I	Y	T	A	R	.	.	.	.	K	G	L	R	T	G	I	V	A	D	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	Q	V	N	D	T	A	G	I	E	N	F	I	T	V	K	E	T	T	G	S	E	F	S	S	N	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	I	L	I	I	G	G	G	F	S	G	C	G	A	A	Y	E	A	A	Y	W	A	K	L	G	G	L	K	V	T	L	V	E	K	A	A	V	E	R	S	G	A	V	A	Q	G	L	S	A	I	N	T	Y	I	D	L	T	G	R	S	E	R	Q	N	T	L	E	D	Y	V	R	Y	V	T	L	D	M	M	G
Template Known Secondary structure			S							S															G	G	G	T								S	S		T	T	T		S	T	T	S	S						S					S	S	S	S	B	S																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2023	.	.	.	.	.	.	2030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2100	.	.
																		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	A	H	I	D	Q	Y	D	I	D	A	M	T	G	I	R	A	T	D	I	E	K	T	D	E	A	I	K	V	T	L	E	N	G	A	V	L	E	S	K	T	V	I	I	A	T	G	A	G	W	R	K	L	N	I	P	G	E	E	Q	L	I	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	A	R	E	D	L	V	A	D	Y	A	R	H	V	D	G	T	V	H	L	F	E	K	W	G	L	P	I	W	K	T	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																									T	T			B		B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2103	.	.	.	.	.	.	2110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2130	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	G	V	A	F	C	P	H	C	D	G	P	L	F	E	N	K	D	V	A	V	I	G	G	G	N	S	G	V	E	A	A	I	D	L	A	G	I	V	N	H	V	T	L	F	E	F	A	S	E	L	K	A	D	N	V	L	Q	D	R	L	R	S	L	S	N	V	D	I	K	T	N	A	K	T	T	E	V	V	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	Y	V	R	E	G	Q	W	Q	I	M	I	H	G	E	S	Y	K	P	I	I	A	E	A	A	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	G	E	E	N	I	Y	E	R	V	F	I	F	E	L	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B		B	S	S	S	S							T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											2136	.	.	.	2140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2160	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	2170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2180	.
		410	.					.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	.	.	.	.	H	V	T	G	I	R	Y	E	D	M	N	T	G	E	E	H	L	L	N	L	D	G	I	F	V	Q	I	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	N	D	P	N	A	V	A	G	A	V	G	F	S	V	R	E	P	K	F	Y	V	F	K	A	K	A	V	I	L	A	T	G	G	A	T	L	L	F	R	P	R	S	T	G	E	A	A	G	R	T	W	Y	A	I	F	D	T	G	S	G	Y	Y	M	G	L	K	A	G	A	M	L	T	Q	F	E	H	R	F
Template Known Secondary structure			T	T		T	T	B									S	S	S	S								S									B		S	S	S			S			S	G	G	G	G			S	S		T	T		B	S										T					S	T	T			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2182	.	.	.	.	.	.	.	2190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2260	.
											441	.	.	.	.	.	.	.	.			450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	N	T	S	W	L	N	D	.	.	A	V	E	L	N	E	R	G	E	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	F	R	F	K	D	G	Y	G	P	V	G	A	W	F	L	F	F	K	C	K	A	K	N	A	Y	G	E	E	Y	I	K	T	R	A	A	E	L	E	K	Y	K	P	Y	G	A	A	Q	P	I	P	T	P	L	R	N	H	Q	V	M	L	E	I	M	D	G	N	Q	P	I	Y	M	H	T	E	E	A	L	A
Template Known Secondary structure							T	T	T										T	S							T	T	S							T	S	G	G	G	T	T	S	T	T	G	G	G		S	S																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2262	.	.	.	.	.	.	.	2270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2340	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	A	G	G	D	K	K	K	L	K	H	I	Y	E	E	A	F	E	D	F	L	D	M	T	V	S	Q	A	L	L	W	A	C	Q	N	I	D	P	Q	E	Q	P	S	E	A	A	P	A	E	P	Y	I	M	G	S	H	S	G	E	A	G	F	W	V	C	G	P	E	D	L	M	P	E	E	Y	A	K	L	F
Template Known Secondary structure					T	T																		T	T											T	T			T	T	T	S										B	B		S	S	S	S											T	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2342	.	.	.	.	.	.	.	2350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2420	.
			461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.		.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																							.
Query SS confidence		.																							.
Query Sequence		.	I	D	R	N	N	N	T	N	V	P	G	I	F	A	A	G	D	V	T	D	Q	K	.	N	K	Q	I	I	I	S	M	G	A	G	A	N	A	A	L	N	A	F	D	Y	I
Query Conservation		.																							.
Alig confidence		.																							.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	K	Y	N	R	M	T	T	V	K	G	L	F	A	I	G	D	C	A	G	A	N	P	H	K	F	S	S	G	S	F	T	E	G	R	I	A	A	K	A	A	V	R	F	I
Template Known Secondary structure		S	S			T	T	B		S	S	B	T					G	G	G	B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2422	.	.	.	.	.	.	.	2430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2460	.	.	.	.	.	.	.