Job Description O05204 Confidence 99.96% Date Tue Jul 17 17:05:01 BST 2012 Rank 86 Aligned Residues 299 % Identity 20% Template c1w4xA_ PDB info PDB header:oxygenase Chain: A: PDB Molecule:phenylacetone monooxygenase; PDBTitle: phenylacetone monooxygenase, a baeyer-villiger2 monooxygenase Resolution 1.7 Å

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		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.			.	.	240											.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	F	E	N	K	E	P	Y	D	V	L	I	V	G	G	G	P	A	S	G	S	A	A	I	Y	T	A	R	K	G	L	R	T	G	I	V	A	D	R	.	.	I	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	N	D	T	A	G	I	E	N	F	I	T	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																									.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	Q	P	P	E	E	V	D	V	L	V	V	G	A	G	F	S	G	L	Y	A	L	Y	R	L	R	E	L	G	R	S	V	H	V	I	E	T	A	G	D	V	G	G	V	W	Y	W	N	R	Y	P	G	A	R	C	D	I	E	S	I	E	Y	C	Y	S	F	S	E	E	V	L	Q	E	W	N	W	T	E	R
Template Known Secondary structure							S										S													T	T								S	S	S	S	S		T								T	T		B		S	S		T	T	T	S	S			S												B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.			.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.			.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.																	.	.																						.	.
Query SS confidence																							.	.																	.	.																						.	.
Query Sequence		E	T	T	G	S	E	F	S	S	N	L	A	A	H	I	D	Q	Y	D	I	D	.	.	A	M	T	G	I	R	A	T	D	I	E	K	T	D	E	A	.	.	I	K	V	T	L	E	N	G	A	V	L	E	S	K	T	V	I	I	A	T	G	.	.	A	G	W	R	K	L	N	I	P	G	E	E	Q	L	I	N
Query Conservation																							.	.																	.	.																						.	.
Alig confidence																							.	.																	.	.																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	S	Q	P	E	I	L	R	Y	I	N	F	V	A	D	K	F	D	L	R	S	G	I	T	F	H	T	T	V	T	A	A	A	F	D	E	A	T	N	T	W	T	V	D	T	N	H	G	D	R	I	R	A	R	Y	L	I	M	A	S	G	Q	L	S	V	P	Q	L	P	N	F	P	G	L	K	D	F	A	G
Template Known Secondary structure		S		B															T	T	G	G	G	G				S										T	T	T	T							T	T															S										T	T	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340		.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure													.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	V	A	F	C	P	H	C	D	G	.	P	L	F	E	N	K	D	V	A	V	I	G	G	G	N	S	G	V	E	A	A	I	D	L	A	G	I	V	N	H	V	T	L	F	E	F	A	S	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	Y	H	T	G	N	W	P	H	E	P	V	D	F	S	G	Q	R	V	G	V	I	G	T	G	S	S	G	I	Q	V	S	P	Q	I	A	K	Q	A	A	E	L	F	V	F	Q	R	T	P	H	F	A	V	P	A	R	N	A	P	L	D	P	E	F	L	A	D	L	K	K	R	Y	A	E	F	R	E	E	S
Template Known Secondary structure						G	G	G			S	S					B	T									S														B	S							S	S											B											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	T	P	G	G	T	H	R	Y	Q	G	P	K	S	A	L	E	V	S	D	E	E	L	V	E	T	L	E	R	Y	W	Q	E	G	G	P	D	I	L	A	A	Y	R	D	I	L	R	D	R	D	A	N	E	R	V	A	E	F	I	R	N	K	I	R	N	T	V	R	D	P	E	V	A	E	R	L	V	P	K
Template Known Secondary structure			T	S	S	S	S	S							S		T	T	T	S																	S	G	G	G	G	G	S	S	T	T	T	T	T																					S	S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
										381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400			.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	D	N	V	L	Q	D	R	L	R	S	L	S	N	V	D	I	K	T	.	.	N	A	K	T	T	E	V	V	G	E	D	H	V	T	G	I	R	Y	E	D	M	N	T	G	E	E	H	L	L	N	L	D	G	I	F	V	Q	I	G	L	L	P	N	T	S	W	L	N	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.											.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	P	F	G	T	K	R	L	I	L	E	I	D	Y	Y	E	M	F	N	R	D	N	V	H	L	V	D	T	L	S	A	P	I	E	T	I	T	P	R	.	.	.	.	G	V	R	T	S	E	R	E	.	.	.	.	.	.	Y	E	L	D	S	L	V	L	A	T	G	F	D	A	L	T	G	A	L	F	K	I
Template Known Secondary structure		S	S		S	S	S	S						S	S					T	T	S	T	T						T	T	T	S							S	S	.	.	.	.					S	S			.	.	.	.	.	.				S											T	T					T	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.					370	.	.	.	.	.	.	.							.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.											.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.			.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query Sequence		V	E	L	N	E	R	G	E	I	V	I	D	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	T	N	V	P	G	I	F	A	A	G	.	.	D	V	T	D	Q	K	N	K	Q	I	I	I	S	M	G	A	G	A	N	A	A	L	N	A	F	D	Y	I	I	R	N
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	R	G	V	G	N	V	A	L	K	E	K	W	A	A	G	P	R	T	Y	L	G	L	S	T	A	G	F	P	N	L	F	F	I	A	G	P	G	S	P	S	A	L	S	N	M	L	V	S	I	E	Q	H	V	E	W	V	T	D	H	I	A	Y	M	F	K	N	G
Template Known Secondary structure						G	G	G		B					T	T	T	S				B	T	T	T	B		T	T	S	T	T				S	S		T	T	S	S	G	G	G	S																							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.