Job Description P0C0V7 Confidence 100.00% Date Tue Jul 17 17:05:08 BST 2012 Rank 12 Aligned Residues 402 % Identity 24% Template c2dkdA_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:phosphoacetylglucosamine mutase; PDBTitle: crystal structure of n-acetylglucosamine-phosphate mutase,2 a member of the alpha-d-phosphohexomutase superfamily, in3 the product complex Resolution 2.10 Å

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		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.				.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.
Query Sequence		L	G	R	Y	G	G	Y	V	L	A	H	N	K	G	E	K	H	P	R	V	L	V	G	R	D	T	.	.	.	R	V	S	G	E	M	L	E	S	A	L	I	A	G	L	I	S	I	G	A	E	V	M	R	L	G	I	I	S	T	P	G	V	A	Y	L	T	R	D	M	G	A	E	L	G	V	M	I	S	A	S
Query Conservation																												.	.	.
Alig confidence																			.	.								.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	Q	T	L	S	Q	Y	L	P	S	H	P	K	P	Q	G	.	.	V	T	F	T	Y	G	T	A	G	F	R	M	K	A	D	K	L	D	Y	V	T	F	T	V	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	S	L	R	S	K	Y	L	Q	G	K	T	V	G	V	M	I	T	A	S
Template Known Secondary structure								T	T	G	G	G					T	T	.	.						B	T	T	B					G	G	G											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	T										T
Template Predicted Secondary structure																			.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.			20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.															.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	N	P	V	A	D	N	G	I	K	F	F	G	S	D	G	F	K	L	S	D	E	Q	E	N	E	I	E	A	L	L	D	Q	E	N	P	E	L	P	R	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	N	P	P	E	D	N	G	V	K	V	V	D	P	L	G	S	M	L	E	S	S	W	E	K	Y	A	T	D	L	A	N	A	S	P	S	P	N	S	L	V	E	V	I	K	N	L	V	S	D	L	K	I	D	L	S	I	P	A	N	V	V	I	A	R	D	S	R	E	S	S	P	A	L	S	M	A	T	I	D
Template Known Secondary structure		T	S		T	T									T	T	S	S	B														T	S	B	S				B													T			T	T	S										S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
																																	145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	D	I	V	H	Y	S	D	Y	F	E	G	A	Q	K	Y	L	S	Y	L	K	S	T	V	D	V	N	F	E	G	L	K	I	A	L	D	G	A	N	G	S	T	S	S	L	A	P	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	Q	S	V	P	N	T	K	Y	Q	D	F	G	L	F	T	T	P	E	L	H	Y	V	T	R	T	L	N	D	P	D	F	G	K	P	T	E	D	G	Y	Y	S	K	L	A	K	S	F	Q	E	I	Y	T	I	C	E	S	N	N	E	K	I	D	I	T	I	D	A	A	N	G	V	G	A	P	K	I	Q	E
Template Known Secondary structure					T	S	S	S																								G	G	G			S	S																			S				S										T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.					.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.				.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.					.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.																				.	.	.																									.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.																				.	.	.																									.	.	.	.
Query Sequence		L	F	G	D	L	E	A	D	T	E	T	I	G	C	S	.	.	.	.	P	D	G	Y	N	I	N	E	K	C	G	S	T	H	P	E	K	L	A	.	.	.	E	K	V	V	E	T	E	S	D	F	G	L	A	F	D	G	D	G	D	R	I	I	A	V	.	.	.	.	D	E	N	G	Q	I	V	D	G	D	Q
Query Conservation																	.	.	.	.																				.	.	.																									.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																				.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	E	K	Y	L	H	K	E	I	S	F	T	V	V	N	G	D	Y	K	Q	P	N	L	L	N	F	D	C	G	A	D	Y	V	K	T	N	Q	K	L	P	K	N	V	K	P	V	N	N	K	L	Y	A	S	F	D	G	D	A	D	R	L	I	C	Y	Y	Q	N	N	D	N	K	F	K	L	L	D	G	D	K
Template Known Secondary structure							S	T	T	T							S			T	T		G	G	G	T	T	T	T		S									S			T	T					T	T								T	T	S										T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280									.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	M	F	I	I	G	Q	E	M	H	K	N	Q	E	L	N	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	M	I	V	S	T	V	M	S	N	L	G	F	Y	K	A	L	E	Q	E	G	I	K	S	N	K	T	K	V	G	D	R	Y	V	V	E	E	M	R	R	G	N	Y	N	L	G	G	E	Q	S	G	H	I	V	M
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	T	L	F	A	L	F	L	Q	Q	L	F	K	Q	I	D	P	T	K	I	S	L	N	I	G	V	V	Q	T	A	Y	A	N	G	S	S	T	K	Y	V	E	D	V	L	K	I	P	V	R	C	T	P	T	G	V	K	H	L	H	H	E	A	E	N	F	D	I	G	V	Y	F	E	A	N	G	H	G	T	V
Template Known Secondary structure															T	T	S		T	T	T											T	T	S											T	T									S	S									T	T	S	S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
																																		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	Y	N	T	T	G	D	G	L	L	T	G	I	Q	L	A	S	V	I	K	M	T	G	K	S	L	S	E	L	A	G	Q	M	K	K	Y	P	Q	S	L	I	N	V	R	V	T	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	F	N	P	E	A	E	K	K	I	F	D	Y	K	P	N	N	D	N	E	A	K	A	I	K	V	L	Q	N	F	S	Q	L	I	N	Q	T	V	G	D	A	I	S	D	L	L	A	V	L	I	V	V	H	Y	L	K	L	S	P	S	D	W	D	N	E	Y	T	D	L	P	N	K	L	V	K	V	I	V	P	D
Template Known Secondary structure																	S	S																	S		S	S	S																	T	T								T	T														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
		383	.	.	.	.										.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Y	R	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	V	D	V	K	E	V	M	T	K	V	E	V	E	M	N	G	E	G	R	I	L	V	R	P	S	G	T	E	P	L	V	R	V	M	V	E	A	A	T	D	E	D	A	E	R	F	A	Q	Q	I	A	D	V	V	Q
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		R	S	I	F	K	T	T	N	A	E	R	T	L	V	E	P	K	G	M	Q	D	E	I	D	K	L	V	A	Q	Y	.	P	N	G	R	S	F	V	R	A	S	G	T	E	D	A	V	R	V	Y	A	E	A	D	T	Q	N	N	V	E	E	L	S	K	A	V	S	E	L	V	K
Template Known Secondary structure		G	G	G					T	T	T	T					S	T	T										T	T	S	.	T	T									S	S	S	S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.		.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.